Protein Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_01930
• Subject: NM_001324376.2
• Aligned Length: 745
• Identities: 614
• Gaps: 131

Alignment

Query   1  MSLKPRVVDFDETWNKLLTTIKAVVMLEYVERATWNDRFSDIYALCVAYPEPLGERLYTETKIFLENHVRHLHK  74
                                                                                     
Sbjct   1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  75  RVLESEEQVLVMYHRYWEEYSKGADYMDCLYRYLNTQFIKKNKLTEADLQYGYGGVDMNEPLMEIGELALDMWR  148
                                                                    |||||||||||||||||
Sbjct   1  ---------------------------------------------------------MNEPLMEIGELALDMWR  17

Query 149  KLMVEPLQAILIRMLLREIKNDRGGEDPNQKVIHGVINSFVHVEQYKKKFPLKFYQEIFESPFLTETGEYYKQE  222
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  18  KLMVEPLQAILIRMLLREIKNDRGGEDPNQKVIHGVINSFVHVEQYKKKFPLKFYQEIFESPFLTETGEYYKQE  91

Query 223  ASNLLQESNCSQYMEKVLGRLKDEEIRCRKYLHPSSYTKVIHECQQRMVADHLQFLHAECHNIIRQEKKNDMAN  296
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  92  ASNLLQESNCSQYMEKVLGRLKDEEIRCRKYLHPSSYTKVIHECQQRMVADHLQFLHAECHNIIRQEKKNDMAN  165

Query 297  MYVLLRAVSTGLPHMIQELQNHIHDEGLRATSNLTQENMPTLFVESVLEVHGKFVQLINTVLNGDQHFMSALDK  370
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 166  MYVLLRAVSTGLPHMIQELQNHIHDEGLRATSNLTQENMPTLFVESVLEVHGKFVQLINTVLNGDQHFMSALDK  239

Query 371  ALTSVVNYREPKSVCKAPELLAKYCDNLLKKSAKGMTENEVEDRLTSFITVFKYIDDKDVFQKFYARMLAKRLI  444
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 240  ALTSVVNYREPKSVCKAPELLAKYCDNLLKKSAKGMTENEVEDRLTSFITVFKYIDDKDVFQKFYARMLAKRLI  313

Query 445  HGLSMSMDSEEAMINKLKQACGYEFTSKLHRMYTDMSVSADLNNKFNNFIKNQDTVIDLGISFQIYVLQAGAWP  518
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 314  HGLSMSMDSEEAMINKLKQACGYEFTSKLHRMYTDMSVSADLNNKFNNFIKNQDTVIDLGISFQIYVLQAGAWP  387

Query 519  LTQAPSSTFAIPQELEKSVQMFELFYSQHFSGRKLTWLHYLCTGEVKMNYLGKPYVAMVTTYQMAVLLAFNNSE  592
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 388  LTQAPSSTFAIPQELEKSVQMFELFYSQHFSGRKLTWLHYLCTGEVKMNYLGKPYVAMVTTYQMAVLLAFNNSE  461

Query 593  TVSYKELQDSTQMNEKELTKTIKSLLDVKMINHDSEKEDIDAESSFSLNMNFSSKRTKFKITTSMQKDTPQEME  666
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 462  TVSYKELQDSTQMNEKELTKTIKSLLDVKMINHDSEKEDIDAESSFSLNMNFSSKRTKFKITTSMQKDTPQEME  535

Query 667  QTRSAVDEDRKMYLQAAIVRIMKARKVLRHNALIQEVISQSRARFNPSISMIKKCIEVLIDKQYIERSQASADE  740
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 536  QTRSAVDEDRKMYLQAAIVRIMKARKVLRHNALIQEVISQSRARFNPSISMIKKCIEVLIDKQYIERSQASADE  609

Query 741  YSYVA  745
           |||||
Sbjct 610  YSYVA  614