Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_01930
• Subject: XM_011519743.1
• Aligned Length: 2424
• Identities: 2235
• Gaps: 189

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGACTGGGAAGAAGGGAGAAAAACTCAGGTGGCAAAGGACATGGACGAAAACCCATGGCGACATGGAAAGAAA  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  ACCCTGTGATATAGAGAGGAAAAGCACAGGACAGCTTATTGGGGAGAATGGAACTCTTCTGTATCCTGATTGCG  148

Query    1  -----------------------------------------ATGTCTTTGAAACCAAGAGTAGTAGATTTTGAT  33
                                                     |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GTGATGGCCACGCATGGCTATTTCAACACTACACTTGCACAATGTCTTTGAAACCAAGAGTAGTAGATTTTGAT  222

Query   34  GAAACATGGAACAAACTTTTGACGACAATAAAAGCCGTGGTCATGTTGGAATACGTCGAAAGAGCAACATGGAA  107
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GAAACATGGAACAAACTTTTGACGACAATAAAAGCCGTGGTCATGTTGGAATACGTCGAAAGAGCAACATGGAA  296

Query  108  TGACCGTTTCTCAGATATCTATGCTTTATGTGTGGCCTATCCTGAACCCCTTGGAGAAAGACTTTATACAGAAA  181
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TGACCGTTTCTCAGATATCTATGCTTTATGTGTGGCCTATCCTGAACCCCTTGGAGAAAGACTTTATACAGAAA  370

Query  182  CTAAGATTTTTTTGGAAAATCATGTTCGGCATTTGCATAAGAGAGTTTTGGAGTCAGAAGAACAAGTACTTGTT  255
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CTAAGATTTTTTTGGAAAATCATGTTCGGCATTTGCATAAGAGAGTTTTGGAGTCAGAAGAACAAGTACTTGTT  444

Query  256  ATGTATCATAGGTACTGGGAAGAATACAGCAAGGGTGCAGACTATATGGACTGCTTATATAGGTATCTCAACAC  329
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  ATGTATCATAGGTACTGGGAAGAATACAGCAAGGGTGCAGACTATATGGACTGCTTATATAGGTATCTCAACAC  518

Query  330  CCAGTTTATTAAAAAGAATAAATTAACAGAAGCGGACCTTCAGTATGGCTATGGTGGTGTAGATATGAATGAAC  403
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CCAGTTTATTAAAAAGAATAAATTAACAGAAGCGGACCTTCAGTATGGCTATGGTGGTGTAGATATGAATGAAC  592

Query  404  CACTTATGGAAATAGGAGAGCTAGCATTGGATATGTGGAGGAAATTGATGGTTGAACCACTTCAGGCCATCCTT  477
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CACTTATGGAAATAGGAGAGCTAGCATTGGATATGTGGAGGAAATTGATGGTTGAACCACTTCAGGCCATCCTT  666

Query  478  ATCCGAATGCTGCTCCGAGAAATCAAAAATGATCGTGGTGGAGAAGACCCAAACCAGAAAGTAATCCATGGGGT  551
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  ATCCGAATGCTGCTCCGAGAAATCAAAAATGATCGTGGTGGAGAAGACCCAAACCAGAAAGTAATCCATGGGGT  740

Query  552  TATTAACTCCTTTGTTCATGTTGAACAGTATAAGAAAAAATTCCCCTTAAAGTTTTATCAGGAAATTTTTGAGT  625
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TATTAACTCCTTTGTTCATGTTGAACAGTATAAGAAAAAATTCCCCTTAAAGTTTTATCAGGAAATTTTTGAGT  814

Query  626  CTCCCTTTCTGACTGAAACAGGAGAGTATTACAAACAAGAAGCTTCAAATTTATTACAAGAATCAAACTGCTCA  699
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  CTCCCTTTCTGACTGAAACAGGAGAGTATTACAAACAAGAAGCTTCAAATTTATTACAAGAATCAAACTGCTCA  888

Query  700  CAGTATATGGAAAAGGTTCTAGGTAGATTAAAAGATGAAGAAATTCGATGTCGAAAATACCTACATCCAAGTTC  773
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CAGTATATGGAAAAGGTTCTAGGTAGATTAAAAGATGAAGAAATTCGATGTCGAAAATACCTACATCCAAGTTC  962

Query  774  ATATACTAAGGTGATTCATGAATGTCAACAACGAATGGTAGCAGACCACTTACAGTTTTTACATGCAGAATGTC  847
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  ATATACTAAGGTGATTCATGAATGTCAACAACGAATGGTAGCAGACCACTTACAGTTTTTACATGCAGAATGTC  1036

Query  848  ATAATATAATTCGACAAGAGAAAAAAAATGACATGGCAAATATGTACGTCTTACTCCGTGCTGTGTCCACTGGT  921
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  ATAATATAATTCGACAAGAGAAAAAAAATGACATGGCAAATATGTACGTCTTACTCCGTGCTGTGTCCACTGGT  1110

Query  922  TTACCTCATATGATTCAGGAGCTGCAAAACCACATCCATGATGAGGGCCTTCGAGCAACCAGCAACCTTACTCA  995
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  TTACCTCATATGATTCAGGAGCTGCAAAACCACATCCATGATGAGGGCCTTCGAGCAACCAGCAACCTTACTCA  1184

Query  996  GGAAAACATGCCAACACTATTTGTGGAGTCAGTTTTGGAAGTGCATGGTAAATTTGTTCAGCTTATCAACACTG  1069
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  GGAAAACATGCCAACACTATTTGTGGAGTCAGTTTTGGAAGTGCATGGTAAATTTGTTCAGCTTATCAACACTG  1258

Query 1070  TTTTGAATGGTGATCAGCATTTTATGAGTGCGTTGGATAAGGCCCTTACGTCAGTTGTAAATTACAGAGAACCT  1143
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  TTTTGAATGGTGATCAGCATTTTATGAGTGCGTTGGATAAGGCCCTTACGTCAGTTGTAAATTACAGAGAACCT  1332

Query 1144  AAGTCTGTTTGCAAAGCACCTGAACTGCTTGCTAAGTACTGTGACAACTTACTGAAGAAGTCAGCGAAAGGGAT  1217
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  AAGTCTGTTTGCAAAGCACCTGAACTGCTTGCTAAGTACTGTGACAACTTACTGAAGAAGTCAGCGAAAGGGAT  1406

Query 1218  GACAGAGAATGAAGTGGAAGACAGGCTCACGAGCTTCATCACAGTGTTCAAATACATTGATGACAAGGACGTCT  1291
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  GACAGAGAATGAAGTGGAAGACAGGCTCACGAGCTTCATCACAGTGTTCAAATACATTGATGACAAGGACGTCT  1480

Query 1292  TTCAAAAGTTCTACGCAAGAATGCTGGCAAAACGTTTAATTCATGGGTTATCCATGTCTATGGACTCTGAAGAA  1365
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  TTCAAAAGTTCTACGCAAGAATGCTGGCAAAACGTTTAATTCATGGGTTATCCATGTCTATGGACTCTGAAGAA  1554

Query 1366  GCCATGATCAACAAATTAAAGCAAGCCTGTGGTTATGAGTTTACCAGCAAGCTACATCGGATGTATACAGATAT  1439
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  GCCATGATCAACAAATTAAAGCAAGCCTGTGGTTATGAGTTTACCAGCAAGCTACATCGGATGTATACAGATAT  1628

Query 1440  GAGTGTCAGCGCTGATCTCAACAATAAGTTCAACAATTTTATCAAAAACCAAGACACAGTAATAGATTTGGGAA  1513
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  GAGTGTCAGCGCTGATCTCAACAATAAGTTCAACAATTTTATCAAAAACCAAGACACAGTAATAGATTTGGGAA  1702

Query 1514  TTAGTTTTCAAATATATGTTCTACAGGCTGGTGCGTGGCCTCTTACTCAGGCTCCTTCATCTACGTTTGCAATT  1587
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  TTAGTTTTCAAATATATGTTCTACAGGCTGGTGCGTGGCCTCTTACTCAGGCTCCTTCATCTACGTTTGCAATT  1776

Query 1588  CCCCAGGAATTAGAAAAAAGTGTACAGATGTTTGAATTATTTTATAGCCAACATTTCAGTGGAAGGAAACTTAC  1661
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  CCCCAGGAATTAGAAAAAAGTGTACAGATGTTTGAATTATTTTATAGCCAACATTTCAGTGGAAGGAAACTTAC  1850

Query 1662  ATGGTTACATTATCTGTGTACAGGTGAAGTTAAAATGAACTATTTGGGCAAACCATATGTAGCCATGGTTACAA  1735
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  ATGGTTACATTATCTGTGTACAGGTGAAGTTAAAATGAACTATTTGGGCAAACCATATGTAGCCATGGTTACAA  1924

Query 1736  CATACCAAATGGCAGTTCTTCTTGCCTTTAACAACAGTGAAACTGTCAGTTATAAAGAGCTTCAGGACAGCACT  1809
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  CATACCAAATGGCAGTTCTTCTTGCCTTTAACAACAGTGAAACTGTCAGTTATAAAGAGCTTCAGGACAGCACT  1998

Query 1810  CAGATGAATGAAAAGGAACTGACAAAAACAATCAAATCATTACTTGATGTGAAAATGATTAACCATGATTCAGA  1883
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  CAGATGAATGAAAAGGAACTGACAAAAACAATCAAATCATTACTTGATGTGAAAATGATTAACCATGATTCAGA  2072

Query 1884  AAAGGAAGATATTGATGCAGAATCTTCGTTTTCATTAAATATGAACTTTAGCAGTAAAAGAACAAAATTTAAAA  1957
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073  AAAGGAAGATATTGATGCAGAATCTTCGTTTTCATTAAATATGAACTTTAGCAGTAAAAGAACAAAATTTAAAA  2146

Query 1958  TTACTACATCAATGCAGAAAGACACACCACAAGAAATGGAGCAGACTAGAAGTGCAGTTGATGAGGACCGGAAA  2031
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147  TTACTACATCAATGCAGAAAGACACACCACAAGAAATGGAGCAGACTAGAAGTGCAGTTGATGAGGACCGGAAA  2220

Query 2032  ATGTATCTCCAAGCTGCTATAGTTCGTATCATGAAAGCACGAAAAGTGCTTCGGCACAATGCCCTTATTCAAGA  2105
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221  ATGTATCTCCAAGCTGCTATAGTTCGTATCATGAAAGCACGAAAAGTGCTTCGGCACAATGCCCTTATTCAAGA  2294

Query 2106  GGTGATTAGCCAGTCAAGAGCTAGGTTTAATCCCAGTATCAGCATGATTAAGAAGTGTATTGAAGTTCTGATAG  2179
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295  GGTGATTAGCCAGTCAAGAGCTAGGTTTAATCCCAGTATCAGCATGATTAAGAAGTGTATTGAAGTTCTGATAG  2368

Query 2180  ACAAACAATACATAGAACGCAGCCAGGCGTCGGCAGATGAATACAGCTACGTCGCG  2235
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369  ACAAACAATACATAGAACGCAGCCAGGCGTCGGCAGATGAATACAGCTACGTCGCG  2424