Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_01933
• Subject: XM_005259334.4
• Aligned Length: 1341
• Identities: 1233
• Gaps: 108

Alignment

Query    1  ATGGGGGAACCCCGGGCTGGGGCCGCCCTGGACGATGGCAGCGGCTGGACGGGCAGTGAGGAAGGCAGTGAGGA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGGGGAACCCCGGGCTGGGGCCGCCCTGGACGATGGCAGCGGCTGGACGGGCAGTGAGGAAGGCAGTGAGGA  74

Query   75  GGGTACCGGCGGCAGTGAGGGGGCTGGGGGTGACGGGGGCCCGGATGCAGAGGGGGTGTGGAGCCCAGACATTG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GGGTACCGGCGGCAGTGAGGGGGCTGGGGGTGACGGGGGCCCGGATGCAGAGGGGGTGTGGAGCCCAGACATTG  148

Query  149  AGCAGAGCTTCCAGGAGGCCCTGGCCATCTATCCACCCTGCGGCCGCCGGAAAATAATTTTGTCTGATGAAGGC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  AGCAGAGCTTCCAGGAGGCCCTGGCCATCTATCCACCCTGCGGCCGCCGGAAAATAATTTTGTCTGATGAAGGC  222

Query  223  AAGATGTATGGTCGGAATGAACTGATCGCCCGCTACATCAAGCTGAGAACGGGGAAGACCCGAACTCGAAAACA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  AAGATGTATGGTCGGAATGAACTGATCGCCCGCTACATCAAGCTGAGAACGGGGAAGACCCGAACTCGAAAACA  296

Query  297  GGTTTCTAGTCACATCCAGGTTTTGGCCCGAAGGAAATCAAGGGAAATCCAGTCCAAGTTGAAGGACCAGGTTT  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||            
Sbjct  297  GGTTTCTAGTCACATCCAGGTTTTGGCCCGAAGGAAATCAAGGGAAATCCAGTCCAAGTTGA------------  358

Query  371  CCAAGGACAAGGCTTTCCAGACAATGGCAACCATGTCCTCTGCCCAGCTCATCTCCGCGCCTTCTCTGCAGGCC  444
                                                                                      
Sbjct  359  --------------------------------------------------------------------------  358

Query  445  AAACTGGGTCCCACTGGTCCTCAGGCCTCTGAGCTTTTCCAGTTTTGGTCTGGAGGATCTGGGCCCCCCTGGAA  518
                                  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  359  ----------------------AGGCCTCTGAGCTTTTCCAGTTTTGGTCTGGAGGATCTGGGCCCCCCTGGAA  410

Query  519  TGTTCCAGATGTGAAGCCATTCTCACAGACACCGTTCACCTTGTCACTGACTCCCCCATCTACTGACCTCCCAG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  411  TGTTCCAGATGTGAAGCCATTCTCACAGACACCGTTCACCTTGTCACTGACTCCCCCATCTACTGACCTCCCAG  484

Query  593  GGTACGAGCCCCCCCAAGCCCTCTCACCCCTGCCCCCACCTACCCCATCGCCCCCAGCCTGGCAGGCTCGGGGC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  485  GGTACGAGCCCCCCCAAGCCCTCTCACCCCTGCCCCCACCTACCCCATCGCCCCCAGCCTGGCAGGCTCGGGGC  558

Query  667  CTGGGCACCGCCCGGTTGCAGCTGGTAGAGTTCTCAGCCTTCGTGGAACCGCCAGATGCAGTTGATTCTTACCA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  559  CTGGGCACCGCCCGGTTGCAGCTGGTAGAGTTCTCAGCCTTCGTGGAACCGCCAGATGCAGTTGATTCTTACCA  632

Query  741  GAGGCACCTGTTCGTGCACATCAGCCAGCACTGCCCCAGCCCCGGAGCGCCGCCGCTCGAGAGTGTGGACGTCC  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  633  GAGGCACCTGTTCGTGCACATCAGCCAGCACTGCCCCAGCCCCGGAGCGCCGCCGCTCGAGAGTGTGGACGTCC  706

Query  815  GGCAGATCTACGACAAATTCCCTGAGAAAAAGGGTGGCCTCCGAGAGCTATATGATCGTGGCCCCCCCCATGCC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  707  GGCAGATCTACGACAAATTCCCTGAGAAAAAGGGTGGCCTCCGAGAGCTATATGATCGTGGCCCCCCCCATGCC  780

Query  889  TTCTTCCTGGTCAAGTTCTGGGCGGACCTGAACTGGGGCCCAAGTGGTGAGGAGGCAGGGGCCGGTGGCAGCAT  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  781  TTCTTCCTGGTCAAGTTCTGGGCGGACCTGAACTGGGGCCCAAGTGGTGAGGAGGCAGGGGCCGGTGGCAGCAT  854

Query  963  CAGCAGTGGTGGCTTCTACGGAGTGAGCAGCCAGTATGAGAGCCTGGAACACATGACCCTCACCTGTTCCTCCA  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  855  CAGCAGTGGTGGCTTCTACGGAGTGAGCAGCCAGTATGAGAGCCTGGAACACATGACCCTCACCTGTTCCTCCA  928

Query 1037  AGGTCTGCTCTTTTGGCAAGCAGGTGGTGGAGAAGGTGGAGACGGAACGGGCCCAGCTGGAGGACGGCAGATTT  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  929  AGGTCTGCTCTTTTGGCAAGCAGGTGGTGGAGAAGGTGGAGACGGAACGGGCCCAGCTGGAGGACGGCAGATTT  1002

Query 1111  GTGTACCGCCTGCTGCGCTCGCCCATGTGCGAGTACCTGGTGAATTTCTTGCACAAGTTGCGGCAGCTGCCTGA  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1003  GTGTACCGCCTGCTGCGCTCGCCCATGTGCGAGTACCTGGTGAATTTCTTGCACAAGTTGCGGCAGCTGCCTGA  1076

Query 1185  GCGATACATGATGAACAGCGTCCTGGAAAACTTCACCATCCTCCAGGTGGTGACAAACAGAGACACCCAGGAAC  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1077  GCGATACATGATGAACAGCGTCCTGGAAAACTTCACCATCCTCCAGGTGGTGACAAACAGAGACACCCAGGAAC  1150

Query 1259  TGCTGCTCTGCACCGCCTATGTCTTCGAGGTCTCCACCAGCGAGCGTGGGGCCCAGCATCACATTTACCGCCTG  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1151  TGCTGCTCTGCACCGCCTATGTCTTCGAGGTCTCCACCAGCGAGCGTGGGGCCCAGCATCACATTTACCGCCTG  1224

Query 1333  GTCAGGGAC  1341
            |||||||||
Sbjct 1225  GTCAGGGAC  1233