Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroad304_01965
Subject:
NM_001286675.2
Aligned Length:
733
Identities:
525
Gaps:
203

Alignment

Query   1  ATGCGCACGGCGGACGGAGGCGAGCCGGCCGGGGCTTCCTCCCCGGCCGGCAGGGTGGACGGTGGGCTCCAGAT  74
                                                                                     
Sbjct   1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  75  GGGATCAGAGCGGATGGAGATGCGGAAGCGGCAGATGCCCGCCGCCCAGGACACACCAGGCGCCGCCCCAGGCC  148
                                                                                     
Sbjct   1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query 149  AGCCCGGAGCGGGGAGTCGCGGGTCCAACGCATG--------CTGCTTCTGCTGGTGCTGCTGTTGTAGCTG--  212
                                          |||        ||       |.||    ||||||   .|||  
Sbjct   1  -------------------------------ATGAAGGAGACCT-------CAGG----GCTGTT---CCTGAT  29

Query 213  CTCGTGTCTCACTGTTAGAAACCAGGAAGATCAGAGGCCCACAATAGCTTCCCACGAACTCAGAGCAGATCTTC  286
           .||..|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  30  ATCAAGTCTCACTGTTAGAAACCAGGAAGATCAGAGGCCCACAATAGCTTCCCACGAACTCAGAGCAGATCTTC  103

Query 287  CAACCTGGGAAGAAAGCCCTGCTCCTACTCTGGAAGAAGTCAACGCCTGGGCTCAGTCATTTGACAAATTAATG  360
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 104  CAACCTGGGAAGAAAGCCCTGCTCCTACTCTGGAAGAAGTCAACGCCTGGGCTCAGTCATTTGACAAATTAATG  177

Query 361  GTCACTCCAGCAGGAAGGAATGCATTCCGTGAATTCCTCCGAACAGAATTCAGTGAGGAAAATATGCTCTTCTG  434
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 178  GTCACTCCAGCAGGAAGGAATGCATTCCGTGAATTCCTCCGAACAGAATTCAGTGAGGAAAATATGCTCTTCTG  251

Query 435  GATGGCCTGTGAGGAACTGAAAAAGGAAGCTAATAAAAACATTATTGAAGAGAAAGCAAGGATAATCTATGAAG  508
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 252  GATGGCCTGTGAGGAACTGAAAAAGGAAGCTAATAAAAACATTATTGAAGAGAAAGCAAGGATAATCTATGAAG  325

Query 509  ACTACATTTCTATACTTTCTCCTAAGGAGGTGAGCTTAGACTCCCGGGTGAGAGAAGTGATCAACAGAAACATG  582
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 326  ACTACATTTCTATACTTTCTCCTAAGGAGGTGAGCTTAGACTCCCGGGTGAGAGAAGTGATCAACAGAAACATG  399

Query 583  GTGGAGCCATCCCAACACATATTCGATGATGCTCAACTTCAGATTTACACCCTGATGCACAGAGACTCATATCC  656
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 400  GTGGAGCCATCCCAACACATATTCGATGATGCTCAACTTCAGATTTACACCCTGATGCACAGAGACTCATATCC  473

Query 657  TCGATTCATGAACTCTGCTGTCTATAAGGACTTGCTTCAGTCCTTATCGGAGAAATCTATTGAAGCA  723
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 474  TCGATTCATGAACTCTGCTGTCTATAAGGACTTGCTTCAGTCCTTATCGGAGAAATCTATTGAAGCA  540