Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_02021
• Subject: XM_011537276.1
• Aligned Length: 1074
• Identities: 918
• Gaps: 150

Alignment

Query    1  ATGATGGAGAAGTATGAAAAAATTGGGAAAATTGGAGAAGGATCCTATGGAGTTGTTTTCAAATGTAGAAACAG  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  GGACACGGGTCAGATTGTGGCCATCAAGAAGTTTCTGGAATCAGAAGATGACCCTGTCATAAAGAAAATTGCCC  148
                                                                         |.|||    ||| 
Sbjct    1  -------------------------------------------------------------ATGAA----GCC-  8

Query  149  TTCGGGAAATCCGAATGCTCAAGCAACTCAAGCATCCCAACCTTGTTAACCTCCTGGAAGTCTTCAGGAGGAAA  222
                     .|.||.| |||..||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    9  ---------ACAGACT-CTCGCGCAACTCAAGCATCCCAACCTTGTTAACCTCCTGGAAGTCTTCAGGAGGAAA  72

Query  223  CGGAGGCTTCACCTGGTGTTTGAATATTGTGACCACACAGTTCTCCATGAGTTGGACAGATACCAAAGAGGGGT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   73  CGGAGGCTTCACCTGGTGTTTGAATATTGTGACCACACAGTTCTCCATGAGTTGGACAGATACCAAAGAGGGGT  146

Query  297  ACCAGAACATCTCGTGAAGAGCATAACTTGGCAGACACTGCAAGCTGTAAATTTTTGCCATAAACACAATTGCA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  147  ACCAGAACATCTCGTGAAGAGCATAACTTGGCAGACACTGCAAGCTGTAAATTTTTGCCATAAACACAATTGCA  220

Query  371  TACATAGAGACGTGAAGCCAGAAAATATCCTCATCACGAAACATTCCGTGATTAAGCTTTGTGACTTTGGATTT  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  221  TACATAGAGACGTGAAGCCAGAAAATATCCTCATCACGAAACATTCCGTGATTAAGCTTTGTGACTTTGGATTT  294

Query  445  GCTCGGCTTTTGACTGGACCGAGTGACTACTATACAGACTACGTGGCTACCAGGTGGTACCGCTCCCCTGAGCT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  295  GCTCGGCTTTTGACTGGACCGAGTGACTACTATACAGACTACGTGGCTACCAGGTGGTACCGCTCCCCTGAGCT  368

Query  519  GCTGGTGGGGGACACGCAGTACGGCCCCCCGGTGGATGTTTGGGCAATTGGCTGTGTCTTTGCTGAGCTGCTGT  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  369  GCTGGTGGGGGACACGCAGTACGGCCCCCCGGTGGATGTTTGGGCAATTGGCTGTGTCTTTGCTGAGCTGCTGT  442

Query  593  CAGGAGTGCCTCTGTGGCCAGGAAAATCGGATGTGGATCAGCTGTATCTGATTAGGAAGACCTTGGGGGATCTC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  443  CAGGAGTGCCTCTGTGGCCAGGAAAATCGGATGTGGATCAGCTGTATCTGATTAGGAAGACCTTGGGGGATCTC  516

Query  667  ATTCCTAGGCACCAGCAAGTGTTTAGCACGAATCAGTACTTCAGTGGAGTGAAAATTCCAGACCCTGAAGATAT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  517  ATTCCTAGGCACCAGCAAGTGTTTAGCACGAATCAGTACTTCAGTGGAGTGAAAATTCCAGACCCTGAAGATAT  590

Query  741  GGAACCACTTGAATTAAAATTCCCAAACATCTCTTATCCTGCCCTGGGGCTCCTAAAGGGCTGTCTCCACATGG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  591  GGAACCACTTGAATTAAAATTCCCAAACATCTCTTATCCTGCCCTGGGGCTCCTAAAGGGCTGTCTCCACATGG  664

Query  815  ACCCTACTCAAAGGCTGACATGTGAACAGCTGTTGCATCACCCATATTTTGAAAACATCAGAGAAATAGAGGAT  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  665  ACCCTACTCAAAGGCTGACATGTGAACAGCTGTTGCATCACCCATATTTTGAAAACATCAGAGAAATAGAGGAT  738

Query  889  TTGGCAAAAGAACACAACAAACCAACAAGGAAGACCCTAAGAAAGAGCCGAAAGCACCACTGCTTTACAGAAAC  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  739  TTGGCAAAAGAACACAACAAACCAACAAGGAAGACCCTAAGAAAGAGCCGAAAGCACCACTGCTTTACAGAAAC  812

Query  963  ATCCAAGTTGCAGTACCTACCCCAGCTAACTGGCAGCAGCATCCTTCCAGCTTTGGATAATAAGAAGTACTACT  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  813  ATCCAAGTTGCAGTACCTACCCCAGCTAACTGGCAGCAGCATCCTTCCAGCTTTGGATAATAAGAAGTACTACT  886

Query 1037  GTGATACCAAGAAACTTAACTACCGTTTTCCAAACATT  1074
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  887  GTGATACCAAGAAACTTAACTACCGTTTTCCAAACATT  924