Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_02026
• Subject: NM_001024628.2
• Aligned Length: 1932
• Identities: 1827
• Gaps: 105

Alignment

Query    1  ATGGAGAGGGGGCTGCCGCTCCTCTGCGCCGTGCTCGCCCTCGTCCTCGCCCCGGCCGGCGCTTTTCGCAACGA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGAGAGGGGGCTGCCGCTCCTCTGCGCCGTGCTCGCCCTCGTCCTCGCCCCGGCCGGCGCTTTTCGCAACGA  74

Query   75  TAAATGTGGCGATACTATAAAAATTGAAAGCCCCGGGTACCTTACATCTCCTGGTTATCCTCATTCTTATCACC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TAAATGTGGCGATACTATAAAAATTGAAAGCCCCGGGTACCTTACATCTCCTGGTTATCCTCATTCTTATCACC  148

Query  149  CAAGTGAAAAATGCGAATGGCTGATTCAGGCTCCGGACCCATACCAGAGAATTATGATCAACTTCAACCCTCAC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CAAGTGAAAAATGCGAATGGCTGATTCAGGCTCCGGACCCATACCAGAGAATTATGATCAACTTCAACCCTCAC  222

Query  223  TTCGATTTGGAGGACAGAGACTGCAAGTATGACTACGTGGAAGTCTTCGATGGAGAAAATGAAAATGGACATTT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  TTCGATTTGGAGGACAGAGACTGCAAGTATGACTACGTGGAAGTCTTCGATGGAGAAAATGAAAATGGACATTT  296

Query  297  TAGGGGAAAGTTCTGTGGAAAGATAGCCCCTCCTCCTGTTGTGTCTTCAGGGCCATTTCTTTTTATCAAATTTG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TAGGGGAAAGTTCTGTGGAAAGATAGCCCCTCCTCCTGTTGTGTCTTCAGGGCCATTTCTTTTTATCAAATTTG  370

Query  371  TCTCTGACTACGAAACACATGGTGCAGGATTTTCCATACGTTATGAAATTTTCAAGAGAGGTCCTGAATGTTCC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TCTCTGACTACGAAACACATGGTGCAGGATTTTCCATACGTTATGAAATTTTCAAGAGAGGTCCTGAATGTTCC  444

Query  445  CAGAACTACACAACACCTAGTGGAGTGATAAAGTCCCCCGGATTCCCTGAAAAATATCCCAACAGCCTTGAATG  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CAGAACTACACAACACCTAGTGGAGTGATAAAGTCCCCCGGATTCCCTGAAAAATATCCCAACAGCCTTGAATG  518

Query  519  CACTTATATTGTCTTTGCGCCAAAGATGTCAGAGATTATCCTGGAATTTGAAAGCTTTGACCTGGAGCCTGACT  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CACTTATATTGTCTTTGCGCCAAAGATGTCAGAGATTATCCTGGAATTTGAAAGCTTTGACCTGGAGCCTGACT  592

Query  593  CAAATCCTCCAGGGGGGATGTTCTGTCGCTACGACCGGCTAGAAATCTGGGATGGATTCCCTGATGTTGGCCCT  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CAAATCCTCCAGGGGGGATGTTCTGTCGCTACGACCGGCTAGAAATCTGGGATGGATTCCCTGATGTTGGCCCT  666

Query  667  CACATTGGGCGTTACTGTGGACAGAAAACACCAGGTCGAATCCGATCCTCATCGGGCATTCTCTCCATGGTTTT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CACATTGGGCGTTACTGTGGACAGAAAACACCAGGTCGAATCCGATCCTCATCGGGCATTCTCTCCATGGTTTT  740

Query  741  TTACACCGACAGCGCGATAGCAAAAGAAGGTTTCTCAGCAAACTACAGTGTCTTGCAGAGCAGTGTCTCAGAAG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TTACACCGACAGCGCGATAGCAAAAGAAGGTTTCTCAGCAAACTACAGTGTCTTGCAGAGCAGTGTCTCAGAAG  814

Query  815  ATTTCAAATGTATGGAAGCTCTGGGCATGGAATCAGGAGAAATTCATTCTGACCAGATCACAGCTTCTTCCCAG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  ATTTCAAATGTATGGAAGCTCTGGGCATGGAATCAGGAGAAATTCATTCTGACCAGATCACAGCTTCTTCCCAG  888

Query  889  TATAGCACCAACTGGTCTGCAGAGCGCTCCCGCCTGAACTACCCTGAGAATGGGTGGACTCCCGGAGAGGATTC  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  TATAGCACCAACTGGTCTGCAGAGCGCTCCCGCCTGAACTACCCTGAGAATGGGTGGACTCCCGGAGAGGATTC  962

Query  963  CTACCGAGAGTGGATACAGGTAGACTTGGGCCTTCTGCGCTTTGTCACGGCTGTCGGGACACAGGGCGCCATTT  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CTACCGAGAGTGGATACAGGTAGACTTGGGCCTTCTGCGCTTTGTCACGGCTGTCGGGACACAGGGCGCCATTT  1036

Query 1037  CAAAAGAAACCAAGAAGAAATATTATGTCAAGACTTACAAGATCGACGTTAGCTCCAACGGGGAAGACTGGATC  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CAAAAGAAACCAAGAAGAAATATTATGTCAAGACTTACAAGATCGACGTTAGCTCCAACGGGGAAGACTGGATC  1110

Query 1111  ACCATAAAAGAAGGAAACAAACCTGTTCTCTTTCAGGGAAACACCAACCCCACAGATGTTGTGGTTGCAGTATT  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  ACCATAAAAGAAGGAAACAAACCTGTTCTCTTTCAGGGAAACACCAACCCCACAGATGTTGTGGTTGCAGTATT  1184

Query 1185  CCCCAAACCACTGATAACTCGATTTGTCCGAATCAAGCCTGCAACTTGGGAAACTGGCATATCTATGAGATTTG  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  CCCCAAACCACTGATAACTCGATTTGTCCGAATCAAGCCTGCAACTTGGGAAACTGGCATATCTATGAGATTTG  1258

Query 1259  AAGTATACGGTTGCAAGATAACAGATTATCCTTGCTCTGGAATGTTGGGTATGGTGTCTGGACTTATTTCTGAC  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  AAGTATACGGTTGCAAGATAACAGATTATCCTTGCTCTGGAATGTTGGGTATGGTGTCTGGACTTATTTCTGAC  1332

Query 1333  TCCCAGATCACATCATCCAACCAAGGGGACAGAAACTGGATGCCTGAAAACATCCGCCTGGTAACCAGTCGCTC  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  TCCCAGATCACATCATCCAACCAAGGGGACAGAAACTGGATGCCTGAAAACATCCGCCTGGTAACCAGTCGCTC  1406

Query 1407  TGGCTGGGCACTTCCACCCGCACCTCATTCCTACATCAATGAGTGGCTCCAAATAGACCTGGGGGAGGAGAAGA  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  TGGCTGGGCACTTCCACCCGCACCTCATTCCTACATCAATGAGTGGCTCCAAATAGACCTGGGGGAGGAGAAGA  1480

Query 1481  TCGTGAGGGGCATCATCATTCAGGGTGGGAAGCACCGAGAGAACAAGGTGTTCATGAGGAAGTTCAAGATCGGG  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  TCGTGAGGGGCATCATCATTCAGGGTGGGAAGCACCGAGAGAACAAGGTGTTCATGAGGAAGTTCAAGATCGGG  1554

Query 1555  TACAGCAACAACGGCTCGGACTGGAAGATGATCATGGATGACAGCAAACGCAAGGCGAAGTCTTTTGAGGGCAA  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  TACAGCAACAACGGCTCGGACTGGAAGATGATCATGGATGACAGCAAACGCAAGGCGAAGTCTTTTGAGGGCAA  1628

Query 1629  CAACAACTATGATACACCTGAGCTGCGGACTTTTCCAGCTCTCTCCACGCGATTCATCAGGATCTACCCCGAGA  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  CAACAACTATGATACACCTGAGCTGCGGACTTTTCCAGCTCTCTCCACGCGATTCATCAGGATCTACCCCGAGA  1702

Query 1703  GAGCCACTCATGGCGGACTGGGGCTCAGAATGGAGCTGCTGGGCTGTGAAGTGGA-------------------  1757
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                   
Sbjct 1703  GAGCCACTCATGGCGGACTGGGGCTCAGAATGGAGCTGCTGGGCTGTGAAGTGGAAGCCCCTACAGCTGGACCG  1776

Query 1758  --------------------------------------------------------------------------  1757
                                                                                      
Sbjct 1777  ACCACTCCCAACGGGAACTTGGTGGATGAATGTGATGACGACCAGGCCAACTGCCACAGTGGAACAGGTGATGA  1850

Query 1758  ------------AGGTGGCACCACTGTGCTGGCCACAGAAAAGCCCACGGTCATAGACAGCACCATACAATCAG  1819
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  CTTCCAGCTCACAGGTGGCACCACTGTGCTGGCCACAGAAAAGCCCACGGTCATAGACAGCACCATACAATCAG  1924

Query 1820  GTATCAAA  1827
            ||||||||
Sbjct 1925  GTATCAAA  1932