Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_02027
• Subject: XM_017016865.2
• Aligned Length: 2718
• Identities: 1908
• Gaps: 807

Alignment

Query    1  ATGGAGAGGGGGCTGCCGCTCCTCTGCGCCGTGCTCGCCCTCGTCCTCGCCCCGGCCGGCGCTTTTCGCAACGA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGAGAGGGGGCTGCCGCTCCTCTGCGCCGTGCTCGCCCTCGTCCTCGCCCCGGCCGGCGCTTTTCGCAACGA  74

Query   75  TAAATGTGGCGATACTATAAAAATTGAAAGCCCCGGGTACCTTACATCTCCTGGTTATCCTCATTCTTATCACC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TAAATGTGGCGATACTATAAAAATTGAAAGCCCCGGGTACCTTACATCTCCTGGTTATCCTCATTCTTATCACC  148

Query  149  CAAGTGAAAAATGCGAATGGCTGATTCAGGCTCCGGACCCATACCAGAGAATTATGATCAACTTCAACCCTCAC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CAAGTGAAAAATGCGAATGGCTGATTCAGGCTCCGGACCCATACCAGAGAATTATGATCAACTTCAACCCTCAC  222

Query  223  TTCGATTTGGAGGACAGAGACTGCAAGTATGACTACGTGGAAGTCTTCGATGGAGAAAATGAAAATGGACATTT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  TTCGATTTGGAGGACAGAGACTGCAAGTATGACTACGTGGAAGTCTTCGATGGAGAAAATGAAAATGGACATTT  296

Query  297  TAGGGGAAAGTTCTGTGGAAAGATAGCCCCTCCTCCTGTTGTGTCTTCAGGGCCATTTCTTTTTATCAAATTTG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TAGGGGAAAGTTCTGTGGAAAGATAGCCCCTCCTCCTGTTGTGTCTTCAGGGCCATTTCTTTTTATCAAATTTG  370

Query  371  TCTCTGACTACGAAACACATGGTGCAGGATTTTCCATACGTTATGAAATTTTCAAGAGAGGTCCTGAATGTTCC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TCTCTGACTACGAAACACATGGTGCAGGATTTTCCATACGTTATGAAATTTTCAAGAGAGGTCCTGAATGTTCC  444

Query  445  CAGAACTACACAACACCTAGTGGAGTGATAAAGTCCCCCGGATTCCCTGAAAAATATCCCAACAGCCTTGAATG  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CAGAACTACACAACACCTAGTGGAGTGATAAAGTCCCCCGGATTCCCTGAAAAATATCCCAACAGCCTTGAATG  518

Query  519  CACTTATATTGTCTTTGCGCCAAAGATGTCAGAGATTATCCTGGAATTTGAAAGCTTTGACCTGGAGCCTGACT  592
            |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CACTTATATTGTCTTTGTGCCAAAGATGTCAGAGATTATCCTGGAATTTGAAAGCTTTGACCTGGAGCCTGACT  592

Query  593  CAAATCCTCCAGGGGGGATGTTCTGTCGCTACGACCGGCTAGAAATCTGGGATGGATTCCCTGATGTTGGCCCT  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CAAATCCTCCAGGGGGGATGTTCTGTCGCTACGACCGGCTAGAAATCTGGGATGGATTCCCTGATGTTGGCCCT  666

Query  667  CACATTGGGCGTTACTGTGGACAGAAAACACCAGGTCGAATCCGATCCTCATCGGGCATTCTCTCCATGGTTTT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CACATTGGGCGTTACTGTGGACAGAAAACACCAGGTCGAATCCGATCCTCATCGGGCATTCTCTCCATGGTTTT  740

Query  741  TTACACCGACAGCGCGATAGCAAAAGAAGGTTTCTCAGCAAACTACAGTGTCTTGCAGAGCAGTGTCTCAGAAG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TTACACCGACAGCGCGATAGCAAAAGAAGGTTTCTCAGCAAACTACAGTGTCTTGCAGAGCAGTGTCTCAGAAG  814

Query  815  ATTTCAAATGTATGGAAGCTCTGGGCATGGAATCAGGAGAAATTCATTCTGACCAGATCACAGCTTCTTCCCAG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  ATTTCAAATGTATGGAAGCTCTGGGCATGGAATCAGGAGAAATTCATTCTGACCAGATCACAGCTTCTTCCCAG  888

Query  889  TATAGCACCAACTGGTCTGCAGAGCGCTCCCGCCTGAACTACCCTGAGAATGGGTGGACTCCCGGAGAGGATTC  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  TATAGCACCAACTGGTCTGCAGAGCGCTCCCGCCTGAACTACCCTGAGAATGGGTGGACTCCCGGAGAGGATTC  962

Query  963  CTACCGAGAGTGGATACAGGTAGACTTGGGCCTTCTGCGCTTTGTCACGGCTGTCGGGACACAGGGCGCCATTT  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CTACCGAGAGTGGATACAGGTAGACTTGGGCCTTCTGCGCTTTGTCACGGCTGTCGGGACACAGGGCGCCATTT  1036

Query 1037  CAAAAGAAACCAAGAAGAAATATTATGTCAAGACTTACAAGATCGACGTTAGCTCCAACGGGGAAGACTGGATC  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CAAAAGAAACCAAGAAGAAATATTATGTCAAGACTTACAAGATCGACGTTAGCTCCAACGGGGAAGACTGGATC  1110

Query 1111  ACCATAAAAGAAGGAAACAAACCTGTTCTCTTTCAGGGAAACACCAACCCCACAGATGTTGTGGTTGCAGTATT  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  ACCATAAAAGAAGGAAACAAACCTGTTCTCTTTCAGGGAAACACCAACCCCACAGATGTTGTGGTTGCAGTATT  1184

Query 1185  CCCCAAACCACTGATAACTCGATTTGTCCGAATCAAGCCTGCAACTTGGGAAACTGGCATATCTATGAGATTTG  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  CCCCAAACCACTGATAACTCGATTTGTCCGAATCAAGCCTGCAACTTGGGAAACTGGCATATCTATGAGATTTG  1258

Query 1259  AAGTATACGGTTGCAAGATAACAGATTATCCTTGCTCTGGAATGTTGGGTATGGTGTCTGGACTTATTTCTGAC  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  AAGTATACGGTTGCAAGATAACAGATTATCCTTGCTCTGGAATGTTGGGTATGGTGTCTGGACTTATTTCTGAC  1332

Query 1333  TCCCAGATCACATCATCCAACCAAGGGGACAGAAACTGGATGCCTGAAAACATCCGCCTGGTAACCAGTCGCTC  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  TCCCAGATCACATCATCCAACCAAGGGGACAGAAACTGGATGCCTGAAAACATCCGCCTGGTAACCAGTCGCTC  1406

Query 1407  TGGCTGGGCACTTCCACCCGCACCTCATTCCTACATCAATGAGTGGCTCCAAATAGACCTGGGGGAGGAGAAGA  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  TGGCTGGGCACTTCCACCCGCACCTCATTCCTACATCAATGAGTGGCTCCAAATAGACCTGGGGGAGGAGAAGA  1480

Query 1481  TCGTGAGGGGCATCATCATTCAGGGTGGGAAGCACCGAGAGAACAAGGTGTTCATGAGGAAGTTCAAGATCGGG  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  TCGTGAGGGGCATCATCATTCAGGGTGGGAAGCACCGAGAGAACAAGGTGTTCATGAGGAAGTTCAAGATCGGG  1554

Query 1555  TACAGCAACAACGGCTCGGACTGGAAGATGATCATGGATGACAGCAAACGCAAGGCGAAGTCTTTTGAGGGCAA  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  TACAGCAACAACGGCTCGGACTGGAAGATGATCATGGATGACAGCAAACGCAAGGCGAAGTCTTTTGAGGGCAA  1628

Query 1629  CAACAACTATGATACACCTGAGCTGCGGACTTTTCCAGCTCTCTCCACGCGATTCATCAGGATCTACCCCGAGA  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  CAACAACTATGATACACCTGAGCTGCGGACTTTTCCAGCTCTCTCCACGCGATTCATCAGGATCTACCCCGAGA  1702

Query 1703  GAGCCACTCATGGCGGACTGGGGCTCAGAATGGAGCTGCTGGGCTGTGAAGTGGAAGCCCCTACAGCTGGACCG  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  GAGCCACTCATGGCGGACTGGGGCTCAGAATGGAGCTGCTGGGCTGTGAAGTGGAAGCCCCTACAGCTGGACCG  1776

Query 1777  ACCACTCCCAACGGGAACTTGGTGGATGAATGTGATGACGACCAGGCCAACTGCCACAGTGGAACAGGTGATGA  1850
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           
Sbjct 1777  ACCACTCCCAACGGGAACTTGGTGGATGAATGTGATGACGACCAGGCCAACTGCCACAGTGGA-----------  1839

Query 1851  CTTCCAGCTCACAGGTGGCACCACTGTGCTGGCCACAGAAAAGCCCACGGTCATAGACAGCACCATACAATCAG  1924
                      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1840  ----------ACAGGTGGCACCACTGTGCTGGCCACAGAAAAGCCCACGGTCATAGACAGCACCATACAATCAG  1903

Query 1925  -GTATCAAA-----------------------------------------------------------------  1932
             ||.||.||                                                                 
Sbjct 1904  AGTTTCCAACATATGGTTTTAACTGTGAATTTGGCTGGGGCTCTCACAAGACCTTCTGCCACTGGGAACATGAC  1977

Query 1933  --------------------------------------------------------------------------  1932
                                                                                      
Sbjct 1978  AATCACGTGCAGCTCAAGTGGAGTGTGTTGACCAGCAAGACGGGACCCATTCAGGATCACACAGGAGATGGCAA  2051

Query 1933  --------------------------------------------------------------------------  1932
                                                                                      
Sbjct 2052  CTTCATCTATTCCCAAGCTGACGAAAATCAGAAGGGCAAAGTGGCTCGCCTGGTGAGCCCTGTGGTTTATTCCC  2125

Query 1933  --------------------------------------------------------------------------  1932
                                                                                      
Sbjct 2126  AGAACTCTGCCCACTGCATGACCTTCTGGTATCACATGTCTGGGTCCCACGTCGGCACACTCAGGGTCAAACTG  2199

Query 1933  --------------------------------------------------------------------------  1932
                                                                                      
Sbjct 2200  CGCTACCAGAAGCCAGAGGAGTACGATCAGCTGGTCTGGATGGCCATTGGACACCAAGGTGACCACTGGAAGGA  2273

Query 1933  --------------------------------------------------------------------------  1932
                                                                                      
Sbjct 2274  AGGGCGTGTCTTGCTCCACAAGTCTCTGAAACTTTATCAGGTGATTTTCGAGGGCGAAATCGGAAAAGGAAACC  2347

Query 1933  --------------------------------------------------------------------------  1932
                                                                                      
Sbjct 2348  TTGGTGGGATTGCTGTGGATGACATTAGTATTAATAACCACATTTCACAAGAAGATTGTGCAAGGAGCACGCCA  2421

Query 1933  --------------------------------------------------------------------------  1932
                                                                                      
Sbjct 2422  GGATACGAAGGTGAAGGAGAAGGTGACAAGAACATCTCCAGGAAGCCAGGCAATGTGTTGAAGACCTTAGACCC  2495

Query 1933  --------------------------------------------------------------------------  1932
                                                                                      
Sbjct 2496  CATCCTCATCACCATCATAGCCATGAGTGCCCTGGGGGTCCTCCTGGGGGCTGTCTGTGGGGTCGTGCTGTACT  2569

Query 1933  --------------------------------------------------------------------------  1932
                                                                                      
Sbjct 2570  GTGCCTGTTGGCATAATGGGATGTCAGAAAGAAACTTGTCTGCCCTGGAGAACTATAACTTTGAACTTGTGGAT  2643

Query 1933  ------------------------------------------------------  1932
                                                                  
Sbjct 2644  GGTGTGAAGTTGAAAAAAGACAAACTGAATACACAGAGTACTTATTCGGAGGCA  2697