Protein Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroad304_02081
Subject:
NM_001128610.3
Aligned Length:
1118
Identities:
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Gaps:
0

Alignment

Query    1  MPAVASVPKELYLSSSLKDLNKKTEVKPEKISTKSYVHSALKIFKTAEECRLDRDEERAYVLYMKYVTVYNLIK  74
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Sbjct    1  MPAVASVPKELYLSSSLKDLNKKTEVKPEKISTKSYVHSALKIFKTAEECRLDRDEERAYVLYMKYVTVYNLIK  74

Query   75  KRPDFKQQQDYFHSILGPGNIKKAVEEAERLSESLKLRYEEAEVRKKLEEKDRQEEAQRLQQKRQETGREDGGT  148
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Sbjct   75  KRPDFKQQQDYFHSILGPGNIKKAVEEAERLSESLKLRYEEAEVRKKLEEKDRQEEAQRLQQKRQETGREDGGT  148

Query  149  LAKGSLENVLDSKDKTQKSNGEKNEKCETKEKGAITAKELYTMMTDKNISLIIMDARRMQDYQDSCILHSLSVP  222
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Sbjct  149  LAKGSLENVLDSKDKTQKSNGEKNEKCETKEKGAITAKELYTMMTDKNISLIIMDARRMQDYQDSCILHSLSVP  222

Query  223  EEAISPGVTASWIEAHLPDDSKDTWKKRGNVEYVVLLDWFSSAKDLQIGTTLRSLKDALFKWESKTVLRNEPLV  296
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Sbjct  223  EEAISPGVTASWIEAHLPDDSKDTWKKRGNVEYVVLLDWFSSAKDLQIGTTLRSLKDALFKWESKTVLRNEPLV  296

Query  297  LEGGYENWLLCYPQYTTNAKVTPPPRRQNEEVSISLDFTYPSLEESIPSKPAAQTPPASIEVDENIELISGQNE  370
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Sbjct  297  LEGGYENWLLCYPQYTTNAKVTPPPRRQNEEVSISLDFTYPSLEESIPSKPAAQTPPASIEVDENIELISGQNE  370

Query  371  RMGPLNISTPVEPVAASKSDVSPIIQPVPSIKNVPQIDRTKKPAVKLPEEHRIKSESTNHEQQSPQSGKVIPDR  444
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Sbjct  371  RMGPLNISTPVEPVAASKSDVSPIIQPVPSIKNVPQIDRTKKPAVKLPEEHRIKSESTNHEQQSPQSGKVIPDR  444

Query  445  STKPVVFSPTLMLTDEEKARIHAETALLMEKNKQEKELRERQQEEQKEKLRKEEQEQKAKKKQEAEENEITEKQ  518
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Sbjct  445  STKPVVFSPTLMLTDEEKARIHAETALLMEKNKQEKELRERQQEEQKEKLRKEEQEQKAKKKQEAEENEITEKQ  518

Query  519  QKAKEEMEKKESEQAKKEDKETSAKRGKEITGVKRQSKSEHETSDAKKSVEDRGKRCPTPEIQKKSTGDVPHTS  592
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Sbjct  519  QKAKEEMEKKESEQAKKEDKETSAKRGKEITGVKRQSKSEHETSDAKKSVEDRGKRCPTPEIQKKSTGDVPHTS  592

Query  593  VTGDSGSGKPFKIKGQPESGILRTGTFREDTDDTERNKAQREPLTRARSEEMGRIVPGLPSGWAKFLDPITGTF  666
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Sbjct  593  VTGDSGSGKPFKIKGQPESGILRTGTFREDTDDTERNKAQREPLTRARSEEMGRIVPGLPSGWAKFLDPITGTF  666

Query  667  RYYHSPTNTVHMYPPEMAPSSAPPSTPPTHKAKPQIPAERDREPSKLKRSYSSPDITQAIQEEEKRKPTVTPTV  740
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Sbjct  667  RYYHSPTNTVHMYPPEMAPSSAPPSTPPTHKAKPQIPAERDREPSKLKRSYSSPDITQAIQEEEKRKPTVTPTV  740

Query  741  NRENKPTCYPKAEISRLSASQIRNLNPVFGGSGPALTGLRNLGNTCYMNSILQCLCNAPHLADYFNRNCYQDDI  814
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Sbjct  741  NRENKPTCYPKAEISRLSASQIRNLNPVFGGSGPALTGLRNLGNTCYMNSILQCLCNAPHLADYFNRNCYQDDI  814

Query  815  NRSNLLGHKGEVAEEFGIIMKALWTGQYRYISPKDFKITIGKINDQFAGYSQQDSQELLLFLMDGLHEDLNKAD  888
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Sbjct  815  NRSNLLGHKGEVAEEFGIIMKALWTGQYRYISPKDFKITIGKINDQFAGYSQQDSQELLLFLMDGLHEDLNKAD  888

Query  889  NRKRYKEENNDHLDDFKAAEHAWQKHKQLNESIIVALFQGQFKSTVQCLTCHKKSRTFEAFMYLSLPLASTSKC  962
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Sbjct  889  NRKRYKEENNDHLDDFKAAEHAWQKHKQLNESIIVALFQGQFKSTVQCLTCHKKSRTFEAFMYLSLPLASTSKC  962

Query  963  TLQDCLRLFSKEEKLTDNNRFYCSHCRARRDSLKKIEIWKLPPVLLVHLKRFSYDGRWKQKLQTSVDFPLENLD  1036
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Sbjct  963  TLQDCLRLFSKEEKLTDNNRFYCSHCRARRDSLKKIEIWKLPPVLLVHLKRFSYDGRWKQKLQTSVDFPLENLD  1036

Query 1037  LSQYVIGPKNNLKKYNLFSVSNHYGGLDGGHYTAYCKNAARQRWFKFDDHEVSDISVSSVKSSAAYILFYTSLG  1110
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Sbjct 1037  LSQYVIGPKNNLKKYNLFSVSNHYGGLDGGHYTAYCKNAARQRWFKFDDHEVSDISVSSVKSSAAYILFYTSLG  1110

Query 1111  PRVTDVAT  1118
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Sbjct 1111  PRVTDVAT  1118