Protein Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_02081
• Subject: NM_001252580.1
• Aligned Length: 1132
• Identities: 917
• Gaps: 55

Alignment

Query    1  MPAVASVPKELYLSSSLKDLNKKTEVKPEKISTK-----------SYVHSALKIFKTAEECRLDRDEERAYVLY  63
            ||||||||||||||||||||||||||||||.|||           ||.|||.||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  MPAVASVPKELYLSSSLKDLNKKTEVKPEKTSTKNTKFCKFSSFLSYIHSAQKIFKTAEECRLDRDEERAYVLY  74

Query   64  MKYVTVYNLIKKRPDFKQQQDYFHSILGPGNIKKAVEEAERLSESLKLRYEEAEVRKKLEEKDRQEEAQRLQQK  137
            ||||.|||||||||||||||||..|||||.|||||.|||||||||||||||||||||.||||||.||.|..|||
Sbjct   75  MKYVAVYNLIKKRPDFKQQQDYYLSILGPANIKKAIEEAERLSESLKLRYEEAEVRKQLEEKDRREEEQLQQQK  148

Query  138  RQETGREDGGTLAKGSLENVLDSKDKTQKSNGEKNEKCETKEKGAITAKELYTMMTDKNISLIIMDARRMQDYQ  211
            |||.||||.|..||.|.||.||||.|||..||||.|.....|.||||||||||||.|||.||||||||..||||
Sbjct  149  RQEMGREDSGAAAKRSVENLLDSKTKTQRINGEKSEGAAAAERGAITAKELYTMMMDKNTSLIIMDARKIQDYQ  222

Query  212  DSCILHSLSVPEEAISPGVTASWIEAHLPDDSKDTWKKRGNVEYVVLLDWFSSAKDLQIGTTLRSLKDALFKWE  285
            .||||.||||||||||||||||||||.|.|||||||||||.|.||||||||||||||..|||||||||||||||
Sbjct  223  HSCILDSLSVPEEAISPGVTASWIEANLSDDSKDTWKKRGSVDYVVLLDWFSSAKDLLLGTTLRSLKDALFKWE  296

Query  286  SKTVLRNEPLVLEGGYENWLLCYPQYTTNAKVTPPPRRQNEEVSISLDFTYPSLEESIPSKPAAQTPPASIEVD  359
            ||||||.||||||||||||||||||.|||||||||||...||||.|||||||||||..|||...|.||..||..
Sbjct  297  SKTVLRHEPLVLEGGYENWLLCYPQFTTNAKVTPPPRSRAEEVSVSLDFTYPSLEEPVPSKLPTQMPPPPIETN  370

Query  360  ENIELISGQNERMGPLNISTP---VEPVAASKSDVSPIIQPVPSIKNVPQIDRTKKPAVKLPEEHRIKSESTNH  430
            |...|...|.|.   |..||.   ..|.||.....||||||.|..|.|||.||||||.|||||.||||||.|. 
Sbjct  371  EKALLVTDQDEK---LRLSTQPALAGPGAAPRAEASPIIQPAPATKSVPQVDRTKKPSVKLPEDHRIKSENTD-  440

Query  431  EQQSPQSGKVIPDRSTKPVVFSPTLMLTDEEKARIHAETALLMEKNKQEKELRERQQEEQKEKLRKEEQEQKAK  504
                 |||.|..|||||||..|||.|||||||||||.|||||||||||||||...||.|||||||.||||.||.
Sbjct  441  -----QSGRVLSDRSTKPVFPSPTTMLTDEEKARIHQETALLMEKNKQEKELWDKQQKEQKEKLRREEQERKAG  509

Query  505  KKQEAEENEITEKQQKAKEEMEKKESEQAKKEDKETSAKRGKEITGVKRQSKSEHETSDAKKSVEDRGKRCPTP  578
            |.|.|.|...||.|.|||...|||.|.|.|.||.|.||....|.||..||||||||.||||..||  ||||||.
Sbjct  510  KTQDADERDSTENQHKAKDGQEKKDSKQTKTEDRELSADGAQEATGTQRQSKSEHEASDAKVPVE--GKRCPTS  581

Query  579  EIQKKSTGDVPHTSVTGDSGSGKPFKIKGQPESGILRTGTFREDTDDTERNKAQREPLTRARSEEMGRIVPGLP  652
            |.||. ..||...||.|....|                             |||||||||||||||||||||||
Sbjct  582  EAQKR-PADVSPASVSGELNAG-----------------------------KAQREPLTRARSEEMGRIVPGLP  625

Query  653  SGWAKFLDPITGTFRYYHSPTNTVHMYPPEMAPSSAPPSTPPTHKAKPQIPAERDREPSKLKRSYSSPDITQAI  726
            .||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||.|||||||||||||||||||||||.
Sbjct  626  LGWAKFLDPITGTFRYYHSPTNTVHMYPPEMAPSSAPPSTPPTHKVKPQVPAERDREPSKLKRSYSSPDITQAL  699

Query  727  QEEEKRKPTVTPTVNRENKPTCYPKAEISRLSASQIRNLNPVFGGSGPALTGLRNLGNTCYMNSILQCLCNAPH  800
            ||||||.|.|||.|||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  700  QEEEKRRPAVTPMVNRENKPPCYPKAEISRLSASQIRNLNPVFGGSGPALTGLRNLGNTCYMNSILQCLCNAPH  773

Query  801  LADYFNRNCYQDDINRSNLLGHKGEVAEEFGIIMKALWTGQYRYISPKDFKITIGKINDQFAGYSQQDSQELLL  874
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||
Sbjct  774  LADYFNRNCYQDDINRSNLLGHKGEVAEEFGIIMKALWTGQYRYISPKDFKVTIGKINDQFAGSSQQDSQELLL  847

Query  875  FLMDGLHEDLNKADNRKRYKEENNDHLDDFKAAEHAWQKHKQLNESIIVALFQGQFKSTVQCLTCHKKSRTFEA  948
            ||||||||||||||||||.|||||.||||..||||||||||||||||||||||||||||||||||...||||||
Sbjct  848  FLMDGLHEDLNKADNRKRHKEENNEHLDDLQAAEHAWQKHKQLNESIIVALFQGQFKSTVQCLTCRRRSRTFEA  921

Query  949  FMYLSLPLASTSKCTLQDCLRLFSKEEKLTDNNRFYCSHCRARRDSLKKIEIWKLPPVLLVHLKRFSYDGRWKQ  1022
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Sbjct  922  FMYLSLPLASTSKCTLQDCLRLFSKEEKLTDNNRFYCSHCRARRDSLKKIEIWKLPPVLLVHLKRFSYDGRWKQ  995

Query 1023  KLQTSVDFPLENLDLSQYVIGPKNNLKKYNLFSVSNHYGGLDGGHYTAYCKNAARQRWFKFDDHEVSDISVSSV  1096
            ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  996  KLQTSVDFPLENLDLSQYVIGPKNSLKKYNLFSVSNHYGGLDGGHYTAYCKNAARQRWFKFDDHEVSDISVSSV  1069

Query 1097  KSSAAYILFYTSLGPRVTDVAT  1118
            .|||||||||||||||.|||||
Sbjct 1070  RSSAAYILFYTSLGPRITDVAT  1091