Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_02081
- Subject:
- XM_017022718.1
- Aligned Length:
- 3354
- Identities:
- 3267
- Gaps:
- 87
Alignment
Query 1 ATGCCTGCTGTGGCTTCAGTTCCTAAAGAACTCTACCTCAGTTCTTCACTAAAAGACCTTAATAAGAAGACAGA 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGCCTGCTGTGGCTTCAGTTCCTAAAGAACTCTACCTCAGTTCTTCACTAAAAGACCTTAATAAGAAGACAGA 74
Query 75 AGTTAAACCAGAGAAAATAAGCACTAAGAGTTATGTGCACAGTGCCCTGAAGATCTTTAAGACAGCAGAAGAAT 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 AGTTAAACCAGAGAAAATAAGCACTAAGAGTTATGTGCACAGTGCCCTGAAGATCTTTAAGACAGCAGAAGAAT 148
Query 149 GCAGATTAGATCGTGATGAGGAAAGGGCCTATGTACTATATATGAAATACGTGACTGTTTATAATCTTATCAAA 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 GCAGATTAGATCGTGATGAGGAAAGGGCCTATGTACTATATATGAAATACGTGACTGTTTATAATCTTATCAAA 222
Query 223 AAAAGACCTGATTTCAAGCAACAGCAGGATTATTTCCATTCAATACTTGGACCTGGAAACATCAAAAAAGCTGT 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 AAAAGACCTGATTTCAAGCAACAGCAGGATTATTTCCATTCAATACTTGGACCTGGAAACATCAAAAAAGCTGT 296
Query 297 CGAAGAAGCTGAAAGACTCTCTGAAAGCCTTAAATTAAGATATGAAGAAGCTGAAGTCCGGAAAAAACTTGAGG 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 CGAAGAAGCTGAAAGACTCTCTGAAAGCCTTAAATTAAGATATGAAGAAGCTGAAGTCCGGAAAAAACTTGAGG 370
Query 371 AAAAAGACAGGCAGGAGGAAGCACAGCGGCTACAACAAAAAAGGCAGGAAACAGGAAGAGAGGATGGTGGCACA 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 AAAAAGACAGGCAGGAGGAAGCACAGCGGCTACAACAAAAAAGGCAGGAAACAGGAAGAGAGGATGGTGGCACA 444
Query 445 TTGGCTAAAGGCTCTTTGGAGAATGTTTTGGATTCCAAAGACAAAACCCAAAAGAGCAATGGTGAAAAGAATGA 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 TTGGCTAAAGGCTCTTTGGAGAATGTTTTGGATTCCAAAGACAAAACCCAAAAGAGCAATGGTGAAAAGAATGA 518
Query 519 AAAATGTGAGACCAAAGAGAAAGGAGCAATCACAGCAAAGGAACTATACACAATGATGACGGATAAAAACATCA 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 AAAATGTGAGACCAAAGAGAAAGGAGCAATCACAGCAAAGGAACTATACACAATGATGACGGATAAAAACATCA 592
Query 593 GCTTGATTATAATGGATGCTCGAAGAATGCAGGATTATCAGGATTCCTGTATTTTACATTCTCTCAGTGTTCCT 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 GCTTGATTATAATGGATGCTCGAAGAATGCAGGATTATCAGGATTCCTGTATTTTACATTCTCTCAGTGTTCCT 666
Query 667 GAAGAAGCCATCAGTCCAGGAGTCACTGCTAGTTGGATTGAAGCACACCTGCCAGATGATTCTAAAGACACATG 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 GAAGAAGCCATCAGTCCAGGAGTCACTGCTAGTTGGATTGAAGCACACCTGCCAGATGATTCTAAAGACACATG 740
Query 741 GAAGAAGAGGGGGAATGTGGAGTATGTGGTACTTCTTGACTGGTTTAGTTCTGCCAAAGATTTACAGATTGGAA 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 GAAGAAGAGGGGGAATGTGGAGTATGTGGTACTTCTTGACTGGTTTAGTTCTGCCAAAGATTTACAGATTGGAA 814
Query 815 CAACTCTCCGGAGTCTGAAAGATGCACTTTTCAAGTGGGAAAGTAAAACTGTCCTGCGCAATGAGCCTTTGGTT 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 CAACTCTCCGGAGTCTGAAAGATGCACTTTTCAAGTGGGAAAGTAAAACTGTCCTGCGCAATGAGCCTTTGGTT 888
Query 889 TTAGAGGGAGGCTATGAAAACTGGCTCCTTTGTTATCCCCAGTATACAACAAATGCTAAGGTCACTCCACCCCC 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 TTAGAGGGAGGCTATGAAAACTGGCTCCTTTGTTATCCCCAGTATACAACAAATGCTAAGGTCACTCCACCCCC 962
Query 963 ACGACGCCAGAATGAAGAGGTGTCTATCTCATTGGATTTTACTTATCCCTCATTGGAAGAATCAATTCCTTCTA 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 ACGACGCCAGAATGAAGAGGTGTCTATCTCATTGGATTTTACTTATCCCTCATTGGAAGAATCAATTCCTTCTA 1036
Query 1037 AACCTGCTGCCCAGACGCCACCTGCATCTATAGAAGTAGATGAAAATATAGAATTGATAAGTGGTCAAAATGAG 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 AACCTGCTGCCCAGACGCCACCTGCATCTATAGAAGTAGATGAAAATATAGAATTGATAAGTGGTCAAAATGAG 1110
Query 1111 AGAATGGGACCACTGAATATATCAACTCCAGTTGAACCAGTTGCTGCTTCTAAATCTGATGTTTCACCCATAAT 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 AGAATGGGACCACTGAATATATCAACTCCAGTTGAACCAGTTGCTGCTTCTAAATCTGATGTTTCACCCATAAT 1184
Query 1185 TCAGCCAGTGCCTAGTATAAAGAATGTTCCACAGATTGATCGTACTAAAAAACCAGCAGTCAAATTGCCTGAAG 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 TCAGCCAGTGCCTAGTATAAAGAATGTTCCACAGATTGATCGTACTAAAAAACCAGCAGTCAAATTGCCTGAAG 1258
Query 1259 AGCATAGAATAAAATCTGAAAGTACAAACCATGAGCAACAATCTCCTCAGAGTGGAAAAGTTATTCCTGATCGT 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 AGCATAGAATAAAATCTGAAAGTACAAACCATGAGCAACAATCTCCTCAGAGTGGAAAAGTTATTCCTGATCGT 1332
Query 1333 TCCACCAAGCCAGTAGTTTTTTCTCCAACTCTCATGTTAACAGATGAAGAAAAGGCTCGTATTCATGCAGAAAC 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 TCCACCAAGCCAGTAGTTTTTTCTCCAACTCTCATGTTAACAGATGAAGAAAAGGCTCGTATTCATGCAGAAAC 1406
Query 1407 TGCTCTTCTAATGGAAAAAAACAAACAAGAAAAAGAACTTCGGGAAAGGCAGCAAGAGGAACAGAAAGAGAAAC 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 TGCTCTTCTAATGGAAAAAAACAAACAAGAAAAAGAACTTCGGGAAAGGCAGCAAGAGGAACAGAAAGAGAAAC 1480
Query 1481 TGAGGAAGGAAGAACAAGAACAAAAAGCCAAAAAGAAACAAGAAGCTGAAGAAAATGAAATTACAGAGAAGCAA 1554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 TGAGGAAGGAAGAACAAGAACAAAAAGCCAAAAAGAAACAAGAAGCTGAAGAAAATGAAATTACAGAGAAGCAA 1554
Query 1555 CAAAAAGCAAAAGAAGAAATGGAGAAGAAAGAAAGTGAACAGGCCAAGAAAGAAGATAAAGAAACCTCAGCAAA 1628
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 CAAAAAGCAAAAGAAGAAATGGAGAAGAAAGAAAGTGAACAGGCCAAGAAAGAAGATAAAGAAACCTCAGCAAA 1628
Query 1629 GAGGGGCAAAGAAATAACAGGAGTAAAAAGACAAAGTAAAAGTGAACATGAAACTTCTGATGCCAAGAAATCTG 1702
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 GAGGGGCAAAGAAATAACAGGAGTAAAAAGACAAAGTAAAAGTGAACATGAAACTTCTGATGCCAAGAAATCTG 1702
Query 1703 TAGAAGATAGGGGGAAAAGGTGTCCAACCCCAGAAATACAGAAAAAGTCAACAGGAGATGTGCCCCATACATCT 1776
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 TAGAAGATAGGGGGAAAAGGTGTCCAACCCCAGAAATACAGAAAAAGTCAACAGGAGATGTGCCCCATACATCT 1776
Query 1777 GTGACAGGGGATTCAGGTTCAGGCAAGCCATTTAAGATTAAAGGACAACCAGAAAGTGGAATTCTAAGGACAGG 1850
|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777 GTGACAGGGGATTCAGGTTCAGGCAAG----------------------------------------------- 1803
Query 1851 AACTTTTAGAGAGGATACAGACGATACCGAAAGAAATAAAGCTCAACGAGAACCTTTGACAAGAGCACGAAGTG 1924
||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1804 ----------------------------------------GCTCAACGAGAACCTTTGACAAGAGCACGAAGTG 1837
Query 1925 AAGAAATGGGGAGGATCGTACCAGGACTGCCTTCAGGCTGGGCCAAGTTTCTTGACCCAATCACTGGAACCTTT 1998
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1838 AAGAAATGGGGAGGATCGTACCAGGACTGCCTTCAGGCTGGGCCAAGTTTCTTGACCCAATCACTGGAACCTTT 1911
Query 1999 CGTTATTATCATTCACCCACCAACACTGTTCATATGTACCCACCGGAAATGGCTCCTTCATCTGCACCTCCTTC 2072
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1912 CGTTATTATCATTCACCCACCAACACTGTTCATATGTACCCACCGGAAATGGCTCCTTCATCTGCACCTCCTTC 1985
Query 2073 CACCCCTCCAACTCATAAAGCCAAGCCACAGATTCCTGCTGAGCGGGATAGGGAACCTTCCAAACTGAAGCGCT 2146
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1986 CACCCCTCCAACTCATAAAGCCAAGCCACAGATTCCTGCTGAGCGGGATAGGGAACCTTCCAAACTGAAGCGCT 2059
Query 2147 CCTACTCCTCCCCAGATATAACCCAGGCTATTCAAGAGGAAGAGAAGAGGAAGCCAACAGTAACTCCAACAGTT 2220
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2060 CCTACTCCTCCCCAGATATAACCCAGGCTATTCAAGAGGAAGAGAAGAGGAAGCCAACAGTAACTCCAACAGTT 2133
Query 2221 AATCGGGAAAACAAGCCAACATGTTATCCTAAAGCTGAGATCTCAAGGCTTTCTGCTTCTCAGATTCGGAACCT 2294
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2134 AATCGGGAAAACAAGCCAACATGTTATCCTAAAGCTGAGATCTCAAGGCTTTCTGCTTCTCAGATTCGGAACCT 2207
Query 2295 CAATCCTGTTTTTGGAGGTTCTGGACCAGCTCTTACTGGACTTCGTAACTTAGGAAATACTTGTTATATGAACT 2368
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2208 CAATCCTGTTTTTGGAGGTTCTGGACCAGCTCTTACTGGACTTCGTAACTTAGGAAATACTTGTTATATGAACT 2281
Query 2369 CAATATTGCAGTGCCTATGTAACGCTCCACATTTGGCTGATTATTTCAACCGAAACTGTTATCAGGATGATATT 2442
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2282 CAATATTGCAGTGCCTATGTAACGCTCCACATTTGGCTGATTATTTCAACCGAAACTGTTATCAGGATGATATT 2355
Query 2443 AACAGGTCAAATTTGTTGGGGCATAAAGGTGAAGTGGCAGAAGAATTTGGTATAATCATGAAAGCCCTGTGGAC 2516
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2356 AACAGGTCAAATTTGTTGGGGCATAAAGGTGAAGTGGCAGAAGAATTTGGTATAATCATGAAAGCCCTGTGGAC 2429
Query 2517 AGGACAGTATAGATATATCAGTCCAAAGGACTTTAAAATCACCATTGGGAAGATCAATGACCAGTTTGCAGGAT 2590
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2430 AGGACAGTATAGATATATCAGTCCAAAGGACTTTAAAATCACCATTGGGAAGATCAATGACCAGTTTGCAGGAT 2503
Query 2591 ACAGTCAGCAAGATTCACAAGAATTGCTTCTGTTCCTAATGGATGGTCTCCATGAAGATCTAAATAAAGCTGAT 2664
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2504 ACAGTCAGCAAGATTCACAAGAATTGCTTCTGTTCCTAATGGATGGTCTCCATGAAGATCTAAATAAAGCTGAT 2577
Query 2665 AATCGGAAGAGATATAAAGAAGAAAATAATGATCATCTCGATGACTTTAAAGCTGCAGAACATGCCTGGCAGAA 2738
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2578 AATCGGAAGAGATATAAAGAAGAAAATAATGATCATCTCGATGACTTTAAAGCTGCAGAACATGCCTGGCAGAA 2651
Query 2739 ACACAAGCAGCTCAATGAGTCTATTATTGTTGCACTTTTTCAGGGTCAATTCAAATCTACAGTACAGTGCCTCA 2812
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2652 ACACAAGCAGCTCAATGAGTCTATTATTGTTGCACTTTTTCAGGGTCAATTCAAATCTACAGTACAGTGCCTCA 2725
Query 2813 CATGTCACAAAAAGTCTAGGACATTTGAGGCCTTCATGTATTTGTCTCTACCACTAGCATCCACAAGTAAATGT 2886
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2726 CATGTCACAAAAAGTCTAGGACATTTGAGGCCTTCATGTATTTGTCTCTACCACTAGCATCCACAAGTAAATGT 2799
Query 2887 ACATTACAGGATTGCCTTAGATTATTTTCCAAAGAAGAAAAACTCACAGATAACAACAGATTTTACTGCAGTCA 2960
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2800 ACATTACAGGATTGCCTTAGATTATTTTCCAAAGAAGAAAAACTCACAGATAACAACAGATTTTACTGCAGTCA 2873
Query 2961 TTGCAGAGCTCGACGGGATTCTCTAAAAAAGATAGAAATCTGGAAGTTACCACCTGTGCTTTTAGTGCATCTGA 3034
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2874 TTGCAGAGCTCGACGGGATTCTCTAAAAAAGATAGAAATCTGGAAGTTACCACCTGTGCTTTTAGTGCATCTGA 2947
Query 3035 AACGTTTTTCCTACGATGGCAGGTGGAAACAAAAATTACAGACATCTGTGGACTTCCCGTTAGAAAATCTTGAC 3108
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2948 AACGTTTTTCCTACGATGGCAGGTGGAAACAAAAATTACAGACATCTGTGGACTTCCCGTTAGAAAATCTTGAC 3021
Query 3109 TTGTCACAGTATGTTATTGGTCCAAAGAACAATTTGAAGAAATATAATTTGTTTTCTGTTTCAAATCACTACGG 3182
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3022 TTGTCACAGTATGTTATTGGTCCAAAGAACAATTTGAAGAAATATAATTTGTTTTCTGTTTCAAATCACTACGG 3095
Query 3183 TGGGCTGGATGGAGGCCACTACACAGCCTATTGTAAAAATGCAGCAAGACAACGGTGGTTTAAGTTTGATGATC 3256
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3096 TGGGCTGGATGGAGGCCACTACACAGCCTATTGTAAAAATGCAGCAAGACAACGGTGGTTTAAGTTTGATGATC 3169
Query 3257 ATGAAGTTTCTGATATCTCCGTTTCTTCTGTGAAATCTTCAGCAGCTTATATCCTCTTTTATACTTCATTGGGA 3330
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3170 ATGAAGTTTCTGATATCTCCGTTTCTTCTGTGAAATCTTCAGCAGCTTATATCCTCTTTTATACTTCATTGGGA 3243
Query 3331 CCACGAGTAACTGATGTAGCCACA 3354
||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3244 CCACGAGTAACTGATGTAGCCACA 3267