Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_02125
• Subject: NM_001114088.2
• Aligned Length: 1373
• Identities: 1216
• Gaps: 4

Alignment

Query    1  ATGGATTCCTTCAAAGTAGTGCTGGAGGGGCCAGCACCTTGGGGCTTCCGGCTGCAAGGGGGCAAGGACTTCAA  74
            ||||||||||||||.||.||||||||.||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGATTCCTTCAAGGTGGTGCTGGAAGGGCCAGCCCCTTGGGGCTTCCGTCTGCAAGGGGGCAAGGACTTCAA  74

Query   75  TGTGCCCCTCTCCATTTCCCGGCTCACTCCTGGGGGCAAAGCGGCGCAGGCCGGAGTGGCCGTGGGTGACTGGG  148
            ||||||||||||.||.||.||||||||.||.||.||||||||.||.||||||||.|||||.|||||.|||||||
Sbjct   75  TGTGCCCCTCTCTATCTCTCGGCTCACGCCCGGAGGCAAAGCTGCACAGGCCGGTGTGGCTGTGGGAGACTGGG  148

Query  149  TGCTGAGCATCGATGGCGAGAATGCGGGTAGCCTCACACACATCGAAGCTCAGAACAAGATCCGGGCCTGCGGG  222
            |.||||..||.||.||.|||||.|||||.||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||.|||
Sbjct  149  TACTGAATATTGACGGTGAGAACGCGGGCAGCCTCACGCACATCGAAGCCCAGAACAAGATCCGCGCCTGTGGG  222

Query  223  GAGCGCCTCAGCCTGGGCCTCAGCAGGGCCCAGCCGGTTCAGAGCAAACCGCAGAAGGCCTCCG-CCCCCGCCG  295
            |||||||||||||||||.||.|||||.||||||||.||||||||||||||.||||||||| |.| ||||..|||
Sbjct  223  GAGCGCCTCAGCCTGGGTCTTAGCAGAGCCCAGCCTGTTCAGAGCAAACCACAGAAGGCC-CTGACCCCTCCCG  295

Query  296  CGGACCCTCCGCGGTACACCTTTGCACCCAGCGTCTCCCTCAACAAGACGGCCCGGCCCTTTGGGGCGCCCCCG  369
            |.|||||.|||.|||||||.||||||||.||||.|||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.
Sbjct  296  CCGACCCCCCGAGGTACACTTTTGCACCAAGCGCCTCCCTCAACAAGACGGCCCGGCCCTTCGGGGCACCCCCA  369

Query  370  CCCGCTGACAGCGCCCCGCAGCAGAATGGACAGCCGCTCCGACCGCTGGTCCCAGATGCCAGCAAGCAGCGGCT  443
            ||..||||||||.|||.||.|||||||||||||..||||.|||.||.||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct  370  CCTACTGACAGCACCCTGCGGCAGAATGGACAGTTGCTCAGACAGCCGGTCCCCGATGCCAGCAAGCAGCGGCT  443

Query  444  GATGGAGAACACAGAGGACTGGCGGCCGCGGCCGGGGACAGGCCAGTCGCGTTCCTTCCGCATCCTTGCCCACC  517
            |||||||.|.||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||
Sbjct  444  GATGGAGGATACCGAAGACTGGCGGCCGCGGCCGGGGACAGGCCAGTCCCGCTCCTTCCGCATCCTTGCCCACC  517

Query  518  TCACAGGCACCGAGTTCATGCAAGACCCGGATGAGGAGCACCTGAAGAAATCAAGCCAGGTGCCCAGGACAGAA  591
            ||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||...|.|||||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct  518  TCACGGGCACAGAGTTCATGCAAGACCCGGATGAGGAATTCATGAAGAAGTCAAGCCAGGTGCCCAGGACAGAA  591

Query  592  GCCCCAGCCCCAGCCTCATCTACACCCCAGGAGCCCTGGCCTGGCCCTACCGCCCCCAGCCCTACCAGCCGCCC  665
            ||||||||||||||||||.|||.|||||||||..|||||||||||||.|||.|.||||||||.|||||||||||
Sbjct  592  GCCCCAGCCCCAGCCTCAACTATACCCCAGGAATCCTGGCCTGGCCCCACCACTCCCAGCCCCACCAGCCGCCC  665

Query  666  GCCCTGGGCTGTGGACCCTGCGTTTGCCGAGCGCTATGCCCCGGACAAAACGAGCACAGTGCTGACCCGGCACA  739
            .||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct  666  ACCCTGGGCTGTGGATCCTGCATTTGCTGAGCGCTATGCCCCAGACAAAACCAGCACAGTGCTGACCCGGCACA  739

Query  740  GCCAGCCGGCCACGCCCACGCCGCTGCAGAGCCGCACCTCCATTGTGCAGGCAGCTGCCGGAGGGGTGC-CAGG  812
            |||||||.|||||.||||||||.|||||||.||||||||||||.||||||||.||.||.||||||| || ||||
Sbjct  740  GCCAGCCAGCCACACCCACGCCTCTGCAGAACCGCACCTCCATAGTGCAGGCCGCAGCTGGAGGGG-GCACAGG  812

Query  813  AGGGGGCAGCAACAACGGCAAGACTCCCGTGTGTCACCAGTGCCACAAGGTCATCCGGGGCCGCTACCTGGTGG  886
            |||||||||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||||||.|||||||.||||||||||||||.|
Sbjct  813  AGGGGGCAGCAACAACGGCAAGACTCCTGTATGCCACCAGTGCCACAAGATCATCCGCGGCCGCTACCTGGTAG  886

Query  887  CGCTGGGCCACGCGTACCACCCGGAGGAGTTTGTGTGTAGCCAGTGTGGGAAGGTCCTGGAAGAGGGTGGCTTC  960
            |.|||||||||||.|||||.||.||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct  887  CACTGGGCCACGCATACCATCCCGAGGAGTTTGTGTGCAGCCAGTGTGGAAAGGTCCTGGAAGAGGGTGGCTTC  960

Query  961  TTTGAGGAGAAGGGCGCCATCTTCTGCCCACCATGCTATGACGTGCGCTATGCACCCAGCTGTGCCAAGTGCAA  1034
            ||.|||||||||||.||.|||||.|||||..|.||||||||.||||||||||||||||.|||||||||.|||||
Sbjct  961  TTCGAGGAGAAGGGAGCTATCTTTTGCCCCTCCTGCTATGATGTGCGCTATGCACCCAACTGTGCCAAATGCAA  1034

Query 1035  GAAGAAGATTACAGGCGAGATCATGCACGCCCTGAAGATGACCTGGCACGTGCACTGCTTTACCTGTGCTGCCT  1108
            |||||||||.||.||.|||||||||||.||.||||||||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||||
Sbjct 1035  GAAGAAGATCACTGGAGAGATCATGCATGCTCTGAAGATGACCTGGCACGTCCATTGCTTCACCTGTGCTGCCT  1108

Query 1109  GCAAGACGCCCATCCGGAACAGGGCCTTCTACATGGAGGAGGGCGTGCCCTATTGCGAGCGAGACTATGAGAAG  1182
            ||||.|||||.||.||.|||||.|||||.||||||||.||.||.|..|||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 1109  GCAAAACGCCAATTCGCAACAGAGCCTTTTACATGGAAGAAGGGGCCCCCTACTGCGAGCGAGACTATGAGAAG  1182

Query 1183  ATGTTTGGCACGAAATGCCATGGCTGTGACTTCAAGATCGACGCTGGGGACCGCTTCCTGGAGGCCCTGGGCTT  1256
            |||||||||||.|||||.|..|||||||||||||||||.||.|||||.||||||||||||||.||.||||||||
Sbjct 1183  ATGTTTGGCACAAAATGTCGAGGCTGTGACTTCAAGATTGATGCTGGAGACCGCTTCCTGGAAGCGCTGGGCTT  1256

Query 1257  CAGCTGGCATGACACCTGCTTCGTCTGTGCGATATGTCAGATCAACCTGGAAGGAAAGACCTTCTACTCCAAGA  1330
            |||||||||||||||.|||||.||.||.||.|||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1257  CAGCTGGCATGACACATGCTTTGTTTGCGCAATATGTCAGATCAACTTGGAAGGAAAGACCTTCTACTCCAAGA  1330

Query 1331  AGGACAGGCCTCTCTGCAAGAGCCATGCCTTCTCTCATGTG  1371
            ||||||.|||.||||||||||||||.|||||||||||.||.
Sbjct 1331  AGGACAAGCCCCTCTGCAAGAGCCACGCCTTCTCTCACGTA  1371