Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_02125
- Subject:
- XM_006517344.3
- Aligned Length:
- 1372
- Identities:
- 1129
- Gaps:
- 104
Alignment
Query 1 ATGGATTCCTTCAAAGTAGTGCTGGAGGGGCCAGCACCTTGGGGCTTCCGGCTGCAAGGGGGCAAGGACTTCAA 74
||||||||||||||.||.||||||||.||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGATTCCTTCAAGGTGGTGCTGGAAGGGCCAGCCCCTTGGGGCTTCCGTCTGCAAGGGGGCAAGGACTTCAA 74
Query 75 TGTGCCCCTCTCCATTTCCCGGCTCACTCCTGGGGGCAAAGCGGCGCAGGCCGGAGTGGCCGTGGGTGACTGGG 148
||||||||||||.||.||.||||||||.||.||.||||||||.||.||||||||.|||||.|||||.|||||||
Sbjct 75 TGTGCCCCTCTCTATCTCTCGGCTCACGCCCGGAGGCAAAGCTGCACAGGCCGGTGTGGCTGTGGGAGACTGGG 148
Query 149 TGCTGAGCATCGATGGCGAGAATGCGGGTAGCCTCACACACATCGAAGCTCAGAACAAGATCCGGGCCTGCGGG 222
|.||||..||.||.||.|||||.|||||.||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||.|||
Sbjct 149 TACTGAATATTGACGGTGAGAACGCGGGCAGCCTCACGCACATCGAAGCCCAGAACAAGATCCGCGCCTGTGGG 222
Query 223 GAGCGCCTCAGCCTGGGCCTCAGCAGGGCCCAGCCGGTTCAGAGCAAACCGCAGAAGGCCTCCGCCCCCGCCGC 296
|||||||||||||||||.||.|||||.||||||||.||||||||||||||.|||||||
Sbjct 223 GAGCGCCTCAGCCTGGGTCTTAGCAGAGCCCAGCCTGTTCAGAGCAAACCACAGAAGG---------------- 280
Query 297 GGACCCTCCGCGGTACACCTTTGCACCCAGCGTCTCCCTCAACAAGACGGCCCGGCCCTTTGGGGCGCCCCCGC 370
|||| |.
Sbjct 281 ---------------------TGCA-----------------------------------------------GA 286
Query 371 CCGCTGACAGCGCCCCGCAGCAGAATGGACAGCCGCTCCGACCGCTGGTCCCAGATGCCAGCAAGCAGCGGCTG 444
||.|||||| .||||..||||.|||.||.||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 287 CCTCTGACA------------------AACAGTTGCTCAGACAGCCGGTCCCCGATGCCAGCAAGCAGCGGCTG 342
Query 445 ATGGAGAACACAGAGGACTGGCGGCCGCGGCCGGGGACAGGCCAGTCGCGTTCCTTCCGCATCCTTGCCCACCT 518
||||||.|.||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 343 ATGGAGGATACCGAAGACTGGCGGCCGCGGCCGGGGACAGGCCAGTCCCGCTCCTTCCGCATCCTTGCCCACCT 416
Query 519 CACAGGCACCGAGTTCATGCAAGACCCGGATGAGGAGCACCTGAAGAAATCAAGCCAGGTGCCCAGGACAGAAG 592
|||.|||||.||||||||||||||||||||||||||...|.|||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 417 CACGGGCACAGAGTTCATGCAAGACCCGGATGAGGAATTCATGAAGAAGTCAAGCCAGGTGCCCAGGACAGAAG 490
Query 593 CCCCAGCCCCAGCCTCATCTACACCCCAGGAGCCCTGGCCTGGCCCTACCGCCCCCAGCCCTACCAGCCGCCCG 666
|||||||||||||||||.|||.|||||||||..|||||||||||||.|||.|.||||||||.|||||||||||.
Sbjct 491 CCCCAGCCCCAGCCTCAACTATACCCCAGGAATCCTGGCCTGGCCCCACCACTCCCAGCCCCACCAGCCGCCCA 564
Query 667 CCCTGGGCTGTGGACCCTGCGTTTGCCGAGCGCTATGCCCCGGACAAAACGAGCACAGTGCTGACCCGGCACAG 740
||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 565 CCCTGGGCTGTGGATCCTGCATTTGCTGAGCGCTATGCCCCAGACAAAACCAGCACAGTGCTGACCCGGCACAG 638
Query 741 CCAGCCGGCCACGCCCACGCCGCTGCAGAGCCGCACCTCCATTGTGCAGGCAGCTGCCGGAGGGGTGC-CAGGA 813
||||||.|||||.||||||||.|||||||.||||||||||||.||||||||.||.||.||||||| || |||||
Sbjct 639 CCAGCCAGCCACACCCACGCCTCTGCAGAACCGCACCTCCATAGTGCAGGCCGCAGCTGGAGGGG-GCACAGGA 711
Query 814 GGGGGCAGCAACAACGGCAAGACTCCCGTGTGTCACCAGTGCCACAAGGTCATCCGGGGCCGCTACCTGGTGGC 887
||||||||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||||||.|||||||.||||||||||||||.||
Sbjct 712 GGGGGCAGCAACAACGGCAAGACTCCTGTATGCCACCAGTGCCACAAGATCATCCGCGGCCGCTACCTGGTAGC 785
Query 888 GCTGGGCCACGCGTACCACCCGGAGGAGTTTGTGTGTAGCCAGTGTGGGAAGGTCCTGGAAGAGGGTGGCTTCT 961
.|||||||||||.|||||.||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 786 ACTGGGCCACGCATACCATCCCGAGGAGTTTGTGTGCAGCCAGTGTGGAAAGGTCCTGGAAGAGGGTGGCTTCT 859
Query 962 TTGAGGAGAAGGGCGCCATCTTCTGCCCACCATGCTATGACGTGCGCTATGCACCCAGCTGTGCCAAGTGCAAG 1035
|.|||||||||||.||.|||||.|||||..|.||||||||.||||||||||||||||.|||||||||.||||||
Sbjct 860 TCGAGGAGAAGGGAGCTATCTTTTGCCCCTCCTGCTATGATGTGCGCTATGCACCCAACTGTGCCAAATGCAAG 933
Query 1036 AAGAAGATTACAGGCGAGATCATGCACGCCCTGAAGATGACCTGGCACGTGCACTGCTTTACCTGTGCTGCCTG 1109
||||||||.||.||.|||||||||||.||.||||||||||||||||||||.||.|||||.||||||||||||||
Sbjct 934 AAGAAGATCACTGGAGAGATCATGCATGCTCTGAAGATGACCTGGCACGTCCATTGCTTCACCTGTGCTGCCTG 1007
Query 1110 CAAGACGCCCATCCGGAACAGGGCCTTCTACATGGAGGAGGGCGTGCCCTATTGCGAGCGAGACTATGAGAAGA 1183
|||.|||||.||.||.|||||.|||||.||||||||.||.||.|..|||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 1008 CAAAACGCCAATTCGCAACAGAGCCTTTTACATGGAAGAAGGGGCCCCCTACTGCGAGCGAGACTATGAGAAGA 1081
Query 1184 TGTTTGGCACGAAATGCCATGGCTGTGACTTCAAGATCGACGCTGGGGACCGCTTCCTGGAGGCCCTGGGCTTC 1257
||||||||||.|||||.|..|||||||||||||||||.||.|||||.||||||||||||||.||.|||||||||
Sbjct 1082 TGTTTGGCACAAAATGTCGAGGCTGTGACTTCAAGATTGATGCTGGAGACCGCTTCCTGGAAGCGCTGGGCTTC 1155
Query 1258 AGCTGGCATGACACCTGCTTCGTCTGTGCGATATGTCAGATCAACCTGGAAGGAAAGACCTTCTACTCCAAGAA 1331
||||||||||||||.|||||.||.||.||.|||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1156 AGCTGGCATGACACATGCTTTGTTTGCGCAATATGTCAGATCAACTTGGAAGGAAAGACCTTCTACTCCAAGAA 1229
Query 1332 GGACAGGCCTCTCTGCAAGAGCCATGCCTTCTCTCATGTG 1371
|||||.|||.||||||||||||||.|||||||||||.||.
Sbjct 1230 GGACAAGCCCCTCTGCAAGAGCCACGCCTTCTCTCACGTA 1269