Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_02125
• Subject: XM_011534698.2
• Aligned Length: 1371
• Identities: 1092
• Gaps: 279

Alignment

Query    1  ATGGATTCCTTCAAAGTAGTGCTGGAGGGGCCAGCACCTTGGGGCTTCCGGCTGCAAGGGGGCAAGGACTTCAA  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  TGTGCCCCTCTCCATTTCCCGGCTCACTCCTGGGGGCAAAGCGGCGCAGGCCGGAGTGGCCGTGGGTGACTGGG  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  TGCTGAGCATCGATGGCGAGAATGCGGGTAGCCTCACACACATCGAAGCTCAGAACAAGATCCGGGCCTGCGGG  222
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ------------ATGGCGAGAATGCGGGTAGCCTCACACACATCGAAGCTCAGAACAAGATCCGGGCCTGCGGG  62

Query  223  GAGCGCCTCAGCCTGGGCCTCAGCAGGGCCCAGCCGGTTCAGAGCAAACCGCAGAAGGCCTCCGCCCCCGCCGC  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                  
Sbjct   63  GAGCGCCTCAGCCTGGGCCTCAGCAGGGCCCAGCCGGTTCAGAGCAAACCGCAGAA------------------  118

Query  297  GGACCCTCCGCGGTACACCTTTGCACCCAGCGTCTCCCTCAACAAGACGGCCCGGCCCTTTGGGGCGCCCCCGC  370
                                                                                      
Sbjct  119  --------------------------------------------------------------------------  118

Query  371  CCGCTGACAGCGCCCCGCAGCAGAATGGACAGCCGCTCCGACCGCTGGTCCCAGATGCCAGCAAGCAGCGGCTG  444
                                       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  119  ---------------------------GACAGCCGCTCCGACCGCTGGTCCCAGATGCCAGCAAGCAGCGGCTG  165

Query  445  ATGGAGAACACAGAGGACTGGCGGCCGCGGCCGGGGACAGGCCAGTCGCGTTCCTTCCGCATCCTTGCCCACCT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  166  ATGGAGAACACAGAGGACTGGCGGCCGCGGCCGGGGACAGGCCAGTCGCGTTCCTTCCGCATCCTTGCCCACCT  239

Query  519  CACAGGCACCGAGTTCATGCAAGACCCGGATGAGGAGCACCTGAAGAAATCAAGCCAGGTGCCCAGGACAGAAG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  240  CACAGGCACCGAGTTCATGCAAGACCCGGATGAGGAGCACCTGAAGAAATCAAGCCAGGTGCCCAGGACAGAAG  313

Query  593  CCCCAGCCCCAGCCTCATCTACACCCCAGGAGCCCTGGCCTGGCCCTACCGCCCCCAGCCCTACCAGCCGCCCG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  314  CCCCAGCCCCAGCCTCATCTACACCCCAGGAGCCCTGGCCTGGCCCTACCGCCCCCAGCCCTACCAGCCGCCCG  387

Query  667  CCCTGGGCTGTGGACCCTGCGTTTGCCGAGCGCTATGCCCCGGACAAAACGAGCACAGTGCTGACCCGGCACAG  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  388  CCCTGGGCTGTGGACCCTGCGTTTGCCGAGCGCTATGCCCCGGACAAAACGAGCACAGTGCTGACCCGGCACAG  461

Query  741  CCAGCCGGCCACGCCCACGCCGCTGCAGAGCCGCACCTCCATTGTGCAGGCAGCTGCCGGAGGGGTGCCAGGAG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  462  CCAGCCGGCCACGCCCACGCCGCTGCAGAGCCGCACCTCCATTGTGCAGGCAGCTGCCGGAGGGGTGCCAGGAG  535

Query  815  GGGGCAGCAACAACGGCAAGACTCCCGTGTGTCACCAGTGCCACAAGGTCATCCGGGGCCGCTACCTGGTGGCG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  536  GGGGCAGCAACAACGGCAAGACTCCCGTGTGTCACCAGTGCCACAAGGTCATCCGGGGCCGCTACCTGGTGGCG  609

Query  889  CTGGGCCACGCGTACCACCCGGAGGAGTTTGTGTGTAGCCAGTGTGGGAAGGTCCTGGAAGAGGGTGGCTTCTT  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  610  CTGGGCCACGCGTACCACCCGGAGGAGTTTGTGTGTAGCCAGTGTGGGAAGGTCCTGGAAGAGGGTGGCTTCTT  683

Query  963  TGAGGAGAAGGGCGCCATCTTCTGCCCACCATGCTATGACGTGCGCTATGCACCCAGCTGTGCCAAGTGCAAGA  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  684  TGAGGAGAAGGGCGCCATCTTCTGCCCACCATGCTATGACGTGCGCTATGCACCCAGCTGTGCCAAGTGCAAGA  757

Query 1037  AGAAGATTACAGGCGAGATCATGCACGCCCTGAAGATGACCTGGCACGTGCACTGCTTTACCTGTGCTGCCTGC  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  758  AGAAGATTACAGGCGAGATCATGCACGCCCTGAAGATGACCTGGCACGTGCACTGCTTTACCTGTGCTGCCTGC  831

Query 1111  AAGACGCCCATCCGGAACAGGGCCTTCTACATGGAGGAGGGCGTGCCCTATTGCGAGCGAGACTATGAGAAGAT  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  832  AAGACGCCCATCCGGAACAGGGCCTTCTACATGGAGGAGGGCGTGCCCTATTGCGAGCGAGACTATGAGAAGAT  905

Query 1185  GTTTGGCACGAAATGCCATGGCTGTGACTTCAAGATCGACGCTGGGGACCGCTTCCTGGAGGCCCTGGGCTTCA  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  906  GTTTGGCACGAAATGCCATGGCTGTGACTTCAAGATCGACGCTGGGGACCGCTTCCTGGAGGCCCTGGGCTTCA  979

Query 1259  GCTGGCATGACACCTGCTTCGTCTGTGCGATATGTCAGATCAACCTGGAAGGAAAGACCTTCTACTCCAAGAAG  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  980  GCTGGCATGACACCTGCTTCGTCTGTGCGATATGTCAGATCAACCTGGAAGGAAAGACCTTCTACTCCAAGAAG  1053

Query 1333  GACAGGCCTCTCTGCAAGAGCCATGCCTTCTCTCATGTG  1371
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1054  GACAGGCCTCTCTGCAAGAGCCATGCCTTCTCTCATGTG  1092