Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_02135
- Subject:
- XM_006497402.1
- Aligned Length:
- 1050
- Identities:
- 725
- Gaps:
- 210
Alignment
Query 1 ATGTCTTCCTTAAGTGGAAAAGTCCAAACCGTTTTGGGCCTTGTAGAGCCAAGCAAACTGGGCCGTACCCTGAC 74
|||||||||||||||||.|||||.|||||.|||.|||||||||||||.||.|||.|||||||.||.||||||||
Sbjct 1 ATGTCTTCCTTAAGTGGGAAAGTACAAACAGTTCTGGGCCTTGTAGAACCCAGCCAACTGGGACGCACCCTGAC 74
Query 75 CCATGAACACCTGGCCATGACCTTTGACTGCTGTTACTGTCCACCTCCCCCGTGCCAGGAAGCTATTTCCAAAG 148
|||.||.||.|||.|.||||||||||||.|.|.||||||.||||||||.||.|||||.||||..|..|||||.|
Sbjct 75 CCACGAGCATCTGACAATGACCTTTGACAGTTTTTACTGCCCACCTCCTCCATGCCACGAAGTCACCTCCAAGG 148
Query 149 AACCTATCGTGATGAAAAATTTATATTGGATTCAGAAAAACGCCTATTCCCATAAAGAAAACCTTCAATTAAAT 222
||||||||.|||||||||||.|||.||||||||||||||||.|||||||||||..|||.||||||||.||.|||
Sbjct 149 AACCTATCATGATGAAAAATCTATTTTGGATTCAGAAAAACCCCTATTCCCATCGAGAGAACCTTCAGTTGAAT 222
Query 223 CAGGAGACAGAAGCCATAAAGGAAGAACTGTTGTATTTTAAAGCTAATGGTGGAGGGGCTTTGGTGGAAAACAC 296
||||
Sbjct 223 CAGG---------------------------------------------------------------------- 226
Query 297 AACCACTGGGATTAGCCGAGACACACAGACGTTGAAGAGGCTTGCAGAAGAGACTGGCGTCCATATCATATCTG 370
Sbjct 227 -------------------------------------------------------------------------- 226
Query 371 GAGCCGGGTTTTATGTGGATGCAACTCACTCCTCAGAGACCAGGGCCATGTCAGTGGAGCAGCTTACCGATGTC 444
|||||||.||||||
Sbjct 227 ------------------------------------------------------------AGCTTACAGATGTC 240
Query 445 CTTATGAATGAAATTCTCCATGGAGCTGATGGAACCAGTATCAAGTGTGGCATTATTGGAGAAATTGGTTGCTC 518
|||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||..||||||||||||||||.|||||
Sbjct 241 CTTATTAATGAAATTCTCCATGGAGCTGATGGCACCAGCATCAAGTGTGGAGTTATTGGAGAAATTGGCTGCTC 314
Query 519 CTGGCCTTTGACTGAGAGTGAAAGAAAGGTTCTCCAGGCCACAGCTCATGCCCAGGCTCAGCTTGGTTGTCCTG 592
|||||||||||||||.||.||.||||||.|.||..||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 315 CTGGCCTTTGACTGACAGCGAGAGAAAGATACTTGAGGCTACAGCTCACGCCCAGGCTCAGCTTGGCTGTCCTG 388
Query 593 TTATTATCCATCCTGGACGGAGCTCCAGG-GCACCATTTCAGATTATCCGAATATTGCAAGAAGCAGGCGCAGA 665
|.||.||||||||||||||||.| ||||| ||||||||.|||||.|||||.|||.|||||||||||||.|||||
Sbjct 389 TCATCATCCATCCTGGACGGAAC-CCAGGTGCACCATTCCAGATAATCCGTATACTGCAAGAAGCAGGAGCAGA 461
Query 666 CATCTCCAAAACAGTCATGTCACACCTGGATAGGACTATTCTTGATAAGAAAGAGCTCTTGGAGTTTGCTCAAC 739
|||||||||||||||||||||.|||||.||.||||||||..||||||||||||||||..|||||||||||||||
Sbjct 462 CATCTCCAAAACAGTCATGTCCCACCTTGACAGGACTATATTTGATAAGAAAGAGCTGCTGGAGTTTGCTCAAC 535
Query 740 TTGGCTGCTACTTGGAATATGATCTCTTTGGTACTGAACTACTTCATTACCAACTCGGCCCAGATATTGACATG 813
|||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.|||.|||||||..|..|||||||||||||.|||
Sbjct 536 TTGGCTGCTACTTGGAATACGATCTCTTTGGTACGGAACTCCTTAATTACCAGTTGAGCCCAGATATTGATATG 609
Query 814 CCTGATGATAACAAAAGAATTAGAAGGGTGCGTCTCCTGGTGGAAGAGGGCTGTGAAGATCGAATTCTGGTAGC 887
|||||||||||||||||||||||||||||.|.|.|.||.|||||.|||||||.|||||||||.|||||..|.||
Sbjct 610 CCTGATGATAACAAAAGAATTAGAAGGGTCCATTTTCTAGTGGATGAGGGCTATGAAGATCGGATTCTCATGGC 683
Query 888 ACATGACATACATACGAAAACC--CGGCTGATGAAATATGGAGGTCACGGCTATTCTCATATACTCACCAATGT 959
||||||||||||.|| |||.| |||.|||||||.||.||||||||||||||.||.||.||.||.|||||..|
Sbjct 684 ACATGACATACACAC--AAAGCATCGGTTGATGAAGTACGGAGGTCACGGCTACTCACACATCCTTACCAACAT 755
Query 960 TGTTCCTAAAATGTTGCTGAGAGGCATAACTGAGAATGTGCTTGATAAGATTCTAATAGAGAACCCTAAGCAAT 1033
|||||||||.|||.|.||.|||||..|.|||||||..||||||||.|||||.||.|||||.||||||||.||||
Sbjct 756 TGTTCCTAAGATGCTCCTTAGAGGTCTGACTGAGAGGGTGCTTGACAAGATACTCATAGAAAACCCTAAACAAT 829
Query 1034 GGCTAACTTTCAAA 1047
||||.|||||.|||
Sbjct 830 GGCTGACTTTTAAA 843