Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_02135
- Subject:
- XM_017016928.2
- Aligned Length:
- 1173
- Identities:
- 906
- Gaps:
- 267
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGTCTGAGTCCTGTGCACTCTTGCTTAATCCACTCTGCAGCCCTGTGAAGGATTCTAGTGATAACGACAAAGC 74
Query 1 ----------------------------------------------------ATGTCTTCCTTAAGTGGAAAAG 22
||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 TAAGAAAAAAGAAATCCTCTTTTTAGAACATCTCTTGGTGGTACCATCAGAAATGTCTTCCTTAAGTGGAAAAG 148
Query 23 TCCAAACCGTTTTGGGCCTTGTAGAGCCAAGCAAACTGGGCCGTACCCTGACCCATGAACACCTGGCCATGACC 96
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 TCCAAACCGTTTTGGGCCTTGTAGAGCCAAGCAAACTGGGCCGTACCCTGACCCATGAACACCTGGCCATGACC 222
Query 97 TTTGACTGCTGTTACTGTCCACCTCCCCCGTGCCAGGAAGCTATTTCCAAAGAACCTATCGTGATGAAAAATTT 170
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 TTTGACTGCTGTTACTGTCCACCTCCCCCGTGCCAGGAAGCTATTTCCAAAGAACCTATCGTGATGAAAAATTT 296
Query 171 ATATTGGATTCAGAAAAACGCCTATTCCCATAAAGAAAACCTTCAATTAAATCAGGAGACAGAAGCCATAAAGG 244
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 ATATTGGATTCAGAAAAACGCCTATTCCCATAAAGAAAACCTTCAATTAAATCAGGAGACAGAAGCCATAAAGG 370
Query 245 AAGAACTGTTGTATTTTAAAGCTAATGGTGGAGGGGCTTTGGTGGAAAACACAACCACTGGGATTAGCCGAGAC 318
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 AAGAACTGTTGTATTTTAAAGCTAATGGTGGAGGGGCTTTGGTGGAAAACACAACCACTGGGATTAGCCGAGAC 444
Query 319 ACACAGACGTTGAAGAGGCTTGCAGAAGAGACTGGCGTCCATATCATATCTGGAGCCGGGTTTTATGTGGATGC 392
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 ACACAGACGTTGAAGAGGCTTGCAGAAGAGACTGGCGTCCATATCATATCTGGAGCCGGGTTTTATGTGGATGC 518
Query 393 AACTCACTCCTCAGAGACCAGGGCCATGTCAGTGGAGCAGCTTACCGATGTCCTTATGAATGAAATTCTCCATG 466
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 AACTCACTCCTCAGAGACCAGGGCCATGTCAGTGGAGCAGCTTACCGATGTCCTTATGAATGAAATTCTCCATG 592
Query 467 GAGCTGATGGAACCAGTATCAAGTGTGGCATTATTGGAGAAATTGGTTGCTCCTGGCCTTTGACTGAGAGTGAA 540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 GAGCTGATGGAACCAGTATCAAGTGTGGCATTATTGGAGAAATTGGTTGCTCCTGGCCTTTGACTGAGAGTGAA 666
Query 541 AGAAAGGTTCTCCAGGCCACAGCTCATGCCCAGGCTCAGCTTGGTTGTCCTGTTATTATCCATCCTGGACGGAG 614
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 AGAAAGGTTCTCCAGGCCACAGCTCATGCCCAGGCTCAGCTTGGTTGTCCTGTTATTATCCATCCTGGACGGAG 740
Query 615 CTCCAGGGCACCATTTCAGATTATCCGAATATTGCAAGAAGCAGGCGCAGACATCTCCAAAACAGTCATGTCAC 688
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 CTCCAGGGCACCATTTCAGATTATCCGAATATTGCAAGAAGCAGGCGCAGACATCTCCAAAACAGTCATGTCAC 814
Query 689 ACCTGGATAGGACTATTCTTGATAAGAAAGAGCTCTTGGAGTTTGCTCAACTTGGCTGCTACTTGGAATATGAT 762
||||||||
Sbjct 815 ACCTGGAT------------------------------------------------------------------ 822
Query 763 CTCTTTGGTACTGAACTACTTCATTACCAACTCGGCCCAGATATTGACATGCCTGATGATAACAAAAGAATTAG 836
Sbjct 823 -------------------------------------------------------------------------- 822
Query 837 AAGGGTGCGTCTCCTGGTGGAAGAGGGCTGTGAAGATCGAATTCTGGTAGCACATGACATACATACGAAAACCC 910
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 823 -AGGGTGCGTCTCCTGGTGGAAGAGGGCTGTGAAGATCGAATTCTGGTAGCACATGACATACATACGAAAACCC 895
Query 911 GGCTGATGAAATATGGAGGTCACGGCTATTCTCATATACTCACCAATGTTGTTCCTAAAATGTTGCTGAGAGGC 984
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 896 GGCTGATGAAATATGGAGGTCACGGCTATTCTCATATACTCACCAATGTTGTTCCTAAAATGTTGCTGAGAGGC 969
Query 985 ATAACTGAGAATGTGCTTGATAAGATTCTAATAGAGAACCCTAAGCAATGGCTAACTTTCAAA 1047
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 970 ATAACTGAGAATGTGCTTGATAAGATTCTAATAGAGAACCCTAAGCAATGGCTAACTTTCAAA 1032