Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroad304_02164
Subject:
NM_001159517.1
Aligned Length:
1023
Identities:
986
Gaps:
0

Alignment

Query    1  ATGGTCGGGGAAATGGAAACGAAGGAGAAGCCGAAGCCCACCCCAGATTACCTGATGCAGCTGATGAACGACAA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGTCGGGGAAATGGAAACGAAGGAGAAGCCGAAGCCCACCCCAGATTATTTGATGCAGCTGATGAACGACAA  74

Query   75  GAAGCTCATGAGCAGCCTGCCCAACTTCTGCGGGATCTTCAACCACCTCGAGCGGCTGCTGGACGAAGAAATTA  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GAAGCTCATGAGCAGCCTGCCCAACTTCTGCGGGATCTTCAACCACCTCGAGCGGCTGCTGGACGAAGAAATTA  148

Query  149  GCAGAGTACGGAAAGACATGTACAATGACACATTAAATGGCAGTACAGAGAAAAGGAGTGCAGAATTGCCTGAT  222
            |||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.
Sbjct  149  GCAGAGTACGGAAAGACATGTACAATGACACGTTAAATGGCAGTACAGAGAAAAGAAGTGCAGAATTGCCTGAC  222

Query  223  GCTGTGGGACCTATTGTTCAGTTACAAGAGAAACTTTATGTGCCTGTAAAAGAATACCCAGATTTTAATTTTGT  296
            ||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct  223  GCGGTGGGACCCATTGTTCAGTTACAAGAGAAACTTTATGTGCCTGTAAAAGAATACCCTGATTTTAATTTTGT  296

Query  297  TGGGAGAATCCTTGGACCTAGAGGACTTACAGCCAAACAACTTGAAGCAGAAACCGGATGTAAAATCATGGTCC  370
            |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||
Sbjct  297  TGGGAGAATCCTTGGACCTAGAGGACTTACAGCTAAACAACTTGAAGCAGAAACGGGATGTAAAATAATGGTCC  370

Query  371  GAGGCAAAGGCTCAATGAGGGATAAAAAAAAGGAGGAGCAAAATAGAGGCAAGCCCAATTGGGAGCATCTAAAT  444
            ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GAGGCAAAGGCTCAATGAGGGATAAAAAGAAGGAGGAGCAAAATAGAGGCAAGCCCAATTGGGAGCATCTAAAT  444

Query  445  GAAGATTTACATGTACTAATCACTGTGGAAGATGCTCAGAACAGAGCAGAAATCAAATTGAAGAGAGCAGTTGA  518
            |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..||||||||||.|||||
Sbjct  445  GAAGACTTACATGTACTAATCACTGTGGAAGATGCTCAGAACAGAGCAGAAATCAAGCTGAAGAGAGCGGTTGA  518

Query  519  AGAAGTGAAGAAATTATTGGTACCTGCAGCAGAAGGAGAAGACAGCCTGAAGAAGATGCAGCTGATGGAGCTTG  592
            ||||||||||||.|||.||||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  AGAAGTGAAGAAGTTACTGGTACCTGCGGCTGAAGGTGAAGACAGCCTGAAGAAGATGCAGCTGATGGAGCTTG  592

Query  593  CGATTCTGAATGGCACCTACAGAGATGCCAACATTAAATCACCAGCCCTTGCCTTTTCTCTTGCAGCAACAGCC  666
            |.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct  593  CAATTCTGAATGGCACCTACAGAGACGCCAACATTAAATCACCAGCCCTTGCCTTTTCTCTTGCAGCAACTGCC  666

Query  667  CAGGCTGCTCCAAGGATCATTACTGGGCCTGCGCCGGTTCTCCCACCAGCTGCCCTGCGTACTCCTACGCCAGC  740
            ||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||.||||||||||||||.||||||||.|||||||||||
Sbjct  667  CAGGCTGCTCCAAGGATCATCACTGGGCCTGCGCCTGTCCTCCCACCAGCTGCTCTGCGTACACCTACGCCAGC  740

Query  741  TGGCCCTACCATAATGCCTTTGATCAGACAAATACAGACCGCTGTCATGCCAAACGGAACTCCTCACCCAACTG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TGGCCCTACCATAATGCCTTTGATCAGACAAATACAGACCGCTGTCATGCCAAACGGAACTCCTCACCCAACTG  814

Query  815  CTGCAATAGTTCCTCCAGGGCCCGAAGCTGGTTTAATCTATACACCCTATGAGTACCCCTACACATTGGCACCA  888
            ||||||||||.|||||||||||.||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct  815  CTGCAATAGTCCCTCCAGGGCCTGAAGCTGGGTTAATCTACACACCCTATGAATACCCCTACACATTGGCACCA  888

Query  889  GCTACATCAATCCTTGAGTATCCTATTGAACCTAGTGGTGTATTAGGTGCGGTGGCTACTAAAGTTCGAAGGCA  962
            ||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GCTACATCAATCCTTGAGTACCCTATTGAACCCAGTGGTGTGTTAGGTGCGGTGGCTACTAAAGTTCGAAGGCA  962

Query  963  CGATATGCGTGTCCATCCTTACCAAAGGATTGTGACCGCAGACCGAGCCGCCACCGGCAAC  1023
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CGATATGCGTGTCCATCCTTACCAAAGGATTGTGACCGCAGACCGAGCCGCCACCGGCAAC  1023