Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_02164
• Subject: XM_011536260.2
• Aligned Length: 1023
• Identities: 879
• Gaps: 144

Alignment

Query    1  ATGGTCGGGGAAATGGAAACGAAGGAGAAGCCGAAGCCCACCCCAGATTACCTGATGCAGCTGATGAACGACAA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGTCGGGGAAATGGAAACGAAGGAGAAGCCGAAGCCCACCCCAGATTACCTGATGCAGCTGATGAACGACAA  74

Query   75  GAAGCTCATGAGCAGCCTGCCCAACTTCTGCGGGATCTTCAACCACCTCGAGCGGCTGCTGGACGAAGAAATTA  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GAAGCTCATGAGCAGCCTGCCCAACTTCTGCGGGATCTTCAACCACCTCGAGCGGCTGCTGGACGAAGAAATTA  148

Query  149  GCAGAGTACGGAAAGACATGTACAATGACACATTAAATGGCAGTACAGAGAAAAGGAGTGCAGAATTGCCTGAT  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GCAGAGTACGGAAAGACATGTACAATGACACATTAAATGGCAGTACAGAGAAAAGGAGTGCAGAATTGCCTGAT  222

Query  223  GCTGTGGGACCTATTGTTCAGTTACAAGAGAAACTTTATGTGCCTGTAAAAGAATACCCAGATTTTAATTTTGT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GCTGTGGGACCTATTGTTCAGTTACAAGAGAAACTTTATGTGCCTGTAAAAGAATACCCAGATTTTAATTTTGT  296

Query  297  TGGGAGAATCCTTGGACCTAGAGGACTTACAGCCAAACAACTTGAAGCAGAAACCGGATGTAAAATCATGGTCC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TGGGAGAATCCTTGGACCTAGAGGACTTACAGCCAAACAACTTGAAGCAGAAACCGGATGTAAAATCATGGTCC  370

Query  371  GAGGCAAAGGCTCAATGAGGGATAAAAAAAAGGAGGAGCAAAATAGAGGCAAGCCCAATTGGGAGCATCTAAAT  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||                                          
Sbjct  371  GAGGCAAAGGCTCAATGAGGGATAAAAAAAAG------------------------------------------  402

Query  445  GAAGATTTACATGTACTAATCACTGTGGAAGATGCTCAGAACAGAGCAGAAATCAAATTGAAGAGAGCAGTTGA  518
                                                                                      
Sbjct  403  --------------------------------------------------------------------------  402

Query  519  AGAAGTGAAGAAATTATTGGTACCTGCAGCAGAAGGAGAAGACAGCCTGAAGAAGATGCAGCTGATGGAGCTTG  592
                                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  403  ----------------------------GCAGAAGGAGAAGACAGCCTGAAGAAGATGCAGCTGATGGAGCTTG  448

Query  593  CGATTCTGAATGGCACCTACAGAGATGCCAACATTAAATCACCAGCCCTTGCCTTTTCTCTTGCAGCAACAGCC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  449  CGATTCTGAATGGCACCTACAGAGATGCCAACATTAAATCACCAGCCCTTGCCTTTTCTCTTGCAGCAACAGCC  522

Query  667  CAGGCTGCTCCAAGGATCATTACTGGGCCTGCGCCGGTTCTCCCACCAGCTGCCCTGCGTACTCCTACGCCAGC  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  523  CAGGCTGCTCCAAGGATCATTACTGGGCCTGCGCCGGTTCTCCCACCAGCTGCCCTGCGTACTCCTACGCCAGC  596

Query  741  TGGCCCTACCATAATGCCTTTGATCAGACAAATACAGACCGCTGTCATGCCAAACGGAACTCCTCACCCAACTG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  597  TGGCCCTACCATAATGCCTTTGATCAGACAAATACAGACCGCTGTCATGCCAAACGGAACTCCTCACCCAACTG  670

Query  815  CTGCAATAGTTCCTCCAGGGCCCGAAGCTGGTTTAATCTATACACCCTATGAGTACCCCTACACATTGGCACCA  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  671  CTGCAATAGTTCCTCCAGGGCCCGAAGCTGGTTTAATCTATACACCCTATGAGTACCCCTACACATTGGCACCA  744

Query  889  GCTACATCAATCCTTGAGTATCCTATTGAACCTAGTGGTGTATTAGGTGCGGTGGCTACTAAAGTTCGAAGGCA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  745  GCTACATCAATCCTTGAGTATCCTATTGAACCTAGTGGTGTATTAGGTGCGGTGGCTACTAAAGTTCGAAGGCA  818

Query  963  CGATATGCGTGTCCATCCTTACCAAAGGATTGTGACCGCAGACCGAGCCGCCACCGGCAAC  1023
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  819  CGATATGCGTGTCCATCCTTACCAAAGGATTGTGACCGCAGACCGAGCCGCCACCGGCAAC  879