Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_02169
• Subject: NM_001284189.2
• Aligned Length: 1062
• Identities: 968
• Gaps: 0

Alignment

Query    1  ATGGGGGAACAACCTATCTTCAGCACTCGAGCTCATGTCTTCCAAATTGACCCAAACACAAAGAAGAACTGGGT  74
            ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGGGGAGCAACCTATCTTCAGCACTCGAGCTCATGTCTTCCAGATTGACCCGAACACAAAGAAGAACTGGGT  74

Query   75  ACCCACCAGCAAGCATGCAGTTACTGTGTCTTATTTCTATGACAGCACAAGAAATGTGTATAGGATAATCAGTT  148
            |||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  ACCCACCAGCAAGCATGCAGTTACTGTATCTTATTTTTATGACAGCACAAGAAATGTGTATAGGATAATCAGTT  148

Query  149  TAGATGGCTCAAAGGCAATAATAAATAGTACCATCACCCCAAACATGACATTTACTAAAACATCTCAGAAGTTT  222
            ||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct  149  TAGATGGCTCAAAGGCAATAATAAATAGCACCATCACACCAAACATGACATTTACTAAAACATCTCAAAAGTTT  222

Query  223  GGCCAGTGGGCTGATAGCCGGGCAAACACCGTTTATGGATTGGGATTCTCCTCTGAGCATCATCTTTCGAAATT  296
            |||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||.||||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct  223  GGCCAATGGGCTGATAGCCGGGCAAACACTGTTTATGGACTGGGATTCTCCTCTGAGCATCATCTTTCAAAATT  296

Query  297  TGCAGAAAAGTTTCAGGAATTTAAAGAAGCTGCTCGACTAGCAAAGGAAAAATCACAAGAGAAGATGGAACTTA  370
            .|||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.||||||||.||.||.||.|||||||||||.||.|
Sbjct  297  CGCAGAAAAGTTTCAGGAATTTAAGGAAGCTGCTCGGCTTGCAAAGGAGAAGTCGCAGGAGAAGATGGAGCTGA  370

Query  371  CCAGTACACCTTCACAGGAATCCGCAGGCGGGGATCTTCAGTCTCCTTTAACACCGGAAAGTATCAACGGGACA  444
            |||||||.||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.||||||
Sbjct  371  CCAGTACCCCTTCACAGGAATCAGCAGGAGGAGATCTTCAGTCTCCTTTGACACCAGAAAGTATCAATGGGACA  444

Query  445  GATGATGAAAGAACACCTGATGTGACACAGAACTCAGAGCCAAGGGCTGAACCAACTCAGAATGCATTGCCATT  518
            ||.|||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GACGATGAGAGAACACCCGATGTGACACAGAACTCAGAGCCAAGGGCTGAGCCAACTCAGAATGCATTGCCATT  518

Query  519  TTCACATAGTTCAGCAATCAGCAAACATTGGGAGGCTGAACTGGCTACCCTCAAAGGAAATAATGCCAAACTCA  592
            |.|||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.||||||||||||||.||.|||||||||||||
Sbjct  519  TCCACATAGTTCAGCAATCAGCAAACACTGGGAGGCTGAGCTAGCTACCCTCAAAGGCAACAATGCCAAACTCA  592

Query  593  CTGCAGCCCTGCTGGAGTCCACTGCCAATGTGAAACAATGGAAACAGCAACTTGCTGCCTATCAAGAGGAAGCA  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||.||.||||||||.||.||.|||||||||
Sbjct  593  CTGCAGCCCTGCTGGAGTCCACTGCCAATGTGAAGCAGTGGAAGCAACAGCTTGCTGCGTACCAGGAGGAAGCA  666

Query  667  GAACGTCTGCACAAGCGGGTGACTGAACTTGAATGTGTTAGTAGCCAAGCAAATGCAGTACATACTCATAAGAC  740
            ||.||.||||||||||||||.|||||.||.||.|||||||||||.||||||||.||.||.||.|..||.|||||
Sbjct  667  GAGCGGCTGCACAAGCGGGTCACTGAGCTGGAGTGTGTTAGTAGTCAAGCAAACGCTGTGCACAGCCACAAGAC  740

Query  741  AGAATTAAATCAGACAATACAAGAACTGGAAGAGACACTGAAACTGAAGGAAGAGGAAATAGAAAGGTTAAAAC  814
            |||..|.||.||||||.|.||.||||||||||||||.||||||.|.||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct  741  AGAGCTGAACCAGACAGTGCAGGAACTGGAAGAGACCCTGAAAGTAAAGGAAGAGGAAATAGAAAGATTAAAAC  814

Query  815  AAGAAATTGATAATGCCAGAGAACTACAAGAACAGAGGGATTCTTTGACTCAGAAACTACAGGAAGTAGAAATT  888
            |||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct  815  AAGAAATCGATAATGCCAGAGAACTCCAAGAACAGAGGGACTCTTTGACTCAGAAACTACAGGAAGTTGAAATT  888

Query  889  CGGAACAAAGACCTGGAGGGACAACTGTCTGACTTAGAGCAACGTCTGGAGAAAAGTCAGAATGAACAAGAAGC  962
            ||.||.||||||||||||||.||.|||||||||.||||.||.||.||||||||.||.|||||.||||||||.||
Sbjct  889  CGAAATAAAGACCTGGAGGGGCAGCTGTCTGACCTAGAACAGCGCCTGGAGAAGAGCCAGAACGAACAAGAGGC  962

Query  963  TTTTCGCAATAACCTGAAGACACTCTTAGAAATTCTGGATGGAAAGATATTTGAACTAACAGAATTACGAGATA  1036
            |||.||||.||||||||||||||||.|||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  TTTCCGCAGTAACCTGAAGACACTCCTAGAAATTCTGGATGGAAAAATATTTGAACTAACAGAATTACGAGATA  1036

Query 1037  ACTTGGCCAAGCTACTAGAATGCAGC  1062
            |.||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 1037  ATTTGGCCAAGCTACTGGAATGCAGC  1062