Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_02169
• Subject: NM_147176.4
• Aligned Length: 1098
• Identities: 968
• Gaps: 36

Alignment

Query    1  ATGGGGGAACAACCTATCTTCAGCACTCGAGCTCATGTCTTCCAAATTGACCCAAACACAAAGAAGAACTGGGT  74
            ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGGGGAGCAACCTATCTTCAGCACTCGAGCTCATGTCTTCCAGATTGACCCGAACACAAAGAAGAACTGGGT  74

Query   75  ACCCACCAGCAAGCATGCAGTTACTGTGTCTTATTTCTATGACAGCACAAGAAATGTGTATAGGATAATCAGTT  148
            |||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  ACCCACCAGCAAGCATGCAGTTACTGTATCTTATTTTTATGACAGCACAAGAAATGTGTATAGGATAATCAGTT  148

Query  149  TAGATGGCTCAAAGGCAATAATAAATAGTACCATCACCCCAAACATGACATTTACTAAAACATCTCAGAAGTTT  222
            ||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct  149  TAGATGGCTCAAAGGCAATAATAAATAGCACCATCACACCAAACATGACATTTACTAAAACATCTCAAAAGTTT  222

Query  223  GGCCAGTGGGCTGATAGCCGGGCAAACACCGTTTATGGATTGGGATTCTCCTCTGAGCATCATCTTTCGAAATT  296
            |||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||.||||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct  223  GGCCAATGGGCTGATAGCCGGGCAAACACTGTTTATGGACTGGGATTCTCCTCTGAGCATCATCTTTCAAAATT  296

Query  297  TGCAGAAAAGTTTCAGGAATTTAAAGAAGCTGCTCGACTAGCAAAGGAAAAATCACAAGAGAAGATGGAACTTA  370
            .|||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.||||||||.||.||.||.|||||||||||.||.|
Sbjct  297  CGCAGAAAAGTTTCAGGAATTTAAGGAAGCTGCTCGGCTTGCAAAGGAGAAGTCGCAGGAGAAGATGGAGCTGA  370

Query  371  CCAGTACACCTTCACAGGAATCCGCAGGCGGGGATCTTCAGTCTCCTTTAACACCGGAAAGTATCAACGGGACA  444
            |||||||.||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.||||||
Sbjct  371  CCAGTACCCCTTCACAGGAATCAGCAGGAGGAGATCTTCAGTCTCCTTTGACACCAGAAAGTATCAATGGGACA  444

Query  445  GATGATGAAAGAACACCTGATGTGACACAGAACTCAGAGCCAAGGGCTGAACCAACTCAGAATGCATTGCCATT  518
            ||.|||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GACGATGAGAGAACACCCGATGTGACACAGAACTCAGAGCCAAGGGCTGAGCCAACTCAGAATGCATTGCCATT  518

Query  519  TTCACA------------------------------------TAGTTCAGCAATCAGCAAACATTGGGAGGCTG  556
            |.||||                                    |||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct  519  TCCACATAGTGCTGGGGATCGAACCCAGGCCCTCTCTCATGCTAGTTCAGCAATCAGCAAACACTGGGAGGCTG  592

Query  557  AACTGGCTACCCTCAAAGGAAATAATGCCAAACTCACTGCAGCCCTGCTGGAGTCCACTGCCAATGTGAAACAA  630
            |.||.||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.
Sbjct  593  AGCTAGCTACCCTCAAAGGCAACAATGCCAAACTCACTGCAGCCCTGCTGGAGTCCACTGCCAATGTGAAGCAG  666

Query  631  TGGAAACAGCAACTTGCTGCCTATCAAGAGGAAGCAGAACGTCTGCACAAGCGGGTGACTGAACTTGAATGTGT  704
            |||||.||.||.||||||||.||.||.|||||||||||.||.||||||||||||||.|||||.||.||.|||||
Sbjct  667  TGGAAGCAACAGCTTGCTGCGTACCAGGAGGAAGCAGAGCGGCTGCACAAGCGGGTCACTGAGCTGGAGTGTGT  740

Query  705  TAGTAGCCAAGCAAATGCAGTACATACTCATAAGACAGAATTAAATCAGACAATACAAGAACTGGAAGAGACAC  778
            ||||||.||||||||.||.||.||.|..||.||||||||..|.||.||||||.|.||.||||||||||||||.|
Sbjct  741  TAGTAGTCAAGCAAACGCTGTGCACAGCCACAAGACAGAGCTGAACCAGACAGTGCAGGAACTGGAAGAGACCC  814

Query  779  TGAAACTGAAGGAAGAGGAAATAGAAAGGTTAAAACAAGAAATTGATAATGCCAGAGAACTACAAGAACAGAGG  852
            |||||.|.||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct  815  TGAAAGTAAAGGAAGAGGAAATAGAAAGATTAAAACAAGAAATCGATAATGCCAGAGAACTCCAAGAACAGAGG  888

Query  853  GATTCTTTGACTCAGAAACTACAGGAAGTAGAAATTCGGAACAAAGACCTGGAGGGACAACTGTCTGACTTAGA  926
            ||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.||||||||||||||.||.|||||||||.||||
Sbjct  889  GACTCTTTGACTCAGAAACTACAGGAAGTTGAAATTCGAAATAAAGACCTGGAGGGGCAGCTGTCTGACCTAGA  962

Query  927  GCAACGTCTGGAGAAAAGTCAGAATGAACAAGAAGCTTTTCGCAATAACCTGAAGACACTCTTAGAAATTCTGG  1000
            .||.||.||||||||.||.|||||.||||||||.|||||.||||.||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct  963  ACAGCGCCTGGAGAAGAGCCAGAACGAACAAGAGGCTTTCCGCAGTAACCTGAAGACACTCCTAGAAATTCTGG  1036

Query 1001  ATGGAAAGATATTTGAACTAACAGAATTACGAGATAACTTGGCCAAGCTACTAGAATGCAGC  1062
            |||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 1037  ATGGAAAAATATTTGAACTAACAGAATTACGAGATAATTTGGCCAAGCTACTGGAATGCAGC  1098