Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_02211
- Subject:
- XM_011519216.2
- Aligned Length:
- 1523
- Identities:
- 1325
- Gaps:
- 190
Alignment
Query 1 ATGTGTGCCGCTCAGATGCCGCCCCTGGCGCACATCTTCCGAGGGACGTTCGTCCACTCCACCTGGACCTGCCC 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGTGTGCCGCTCAGATGCCGCCCCTGGCGCACATCTTCCGAGGGACGTTCGTCCACTCCACCTGGACCTGCCC 74
Query 75 CATGGAGGTGCTGCGGGATCACCTCCTCGGCGTGAGCGACAGCGGCAAAATAGTGTTTTTAGAAGAAGCATCTC 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 CATGGAGGTGCTGCGGGATCACCTCCTCGGCGTGAGCGACAGCGGCAAAATAGTGTTTTTAGAAGAAGCATCTC 148
Query 149 AACAGGAAAAACTGGCCAAAGAATGGTGCTTCAAGCCGTGTGAAATAAGAGAACTGAGCCACCATGAGTTCTTC 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 AACAGGAAAAACTGGCCAAAGAATGGTGCTTCAAGCCGTGTGAAATAAGAGAACTGAGCCACCATGAGTTCTTC 222
Query 223 ATGCCTGGGCTGGTTGATACACACATCCATGCCTCTCAGTATTCCTTTGCTGGAAGTAGCATAGACCTGCCACT 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 ATGCCTGGGCTGGTTGATACACACATCCATGCCTCTCAGTATTCCTTTGCTGGAAGTAGCATAGACCTGCCACT 296
Query 297 CTTGGAGTGGCTGACCAAGTACACATTTCCTGCAGAACACAGATTCCAGAACATCGACTTTGCAGAAGAAGTAT 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 CTTGGAGTGGCTGACCAAGTACACATTTCCTGCAGAACACAGATTCCAGAACATCGACTTTGCAGAAGAAGTAT 370
Query 371 ATACCAGAGTTGT------------------------------------------------------------- 383
|||||||||||||
Sbjct 371 ATACCAGAGTTGTCACACTTGAGCTTCTGATGTCTGTACTAGTCAAGAAAACCCTGTTTTTTCACAAAGGAGGA 444
Query 384 -----------------------------------------------------CAGGAGAACACTAAAGAATGG 404
|||||||||||||||||||||
Sbjct 445 AACATGGAATGTAAGCAACCTTCTCAAGGTCACGTAGCTAATAACAGGCAAAACAGGAGAACACTAAAGAATGG 518
Query 405 AACAACCACAGCTTGTTACTTTGCAACAATTCACACTGACTCATCTCTGCTCCTTGCCGACATTACAGATAAAT 478
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 AACAACCACAGCTTGTTACTTTGCAACAATTCACACTGACTCATCTCTGCTCCTTGCCGACATTACAGATAAAT 592
Query 479 TTGGACAGCGGGCATTTGTGGGCAAAGTTTGCATGGATTTGAATGACACTTTTCCAGAATACAAGGAGACCACT 552
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 TTGGACAGCGGGCATTTGTGGGCAAAGTTTGCATGGATTTGAATGACACTTTTCCAGAATACAAGGAGACCACT 666
Query 553 GAGGAATCGATCAAGGAAACTGAGAGATTTGTGTCAGAAATGCTCCAAAAGAACTATTCTAGAGTGAAGCCCAT 626
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 GAGGAATCGATCAAGGAAACTGAGAGATTTGTGTCAGAAATGCTCCAAAAGAACTATTCTAGAGTGAAGCCCAT 740
Query 627 AGTGACACCACGTTTTTCCCTCTCCTGCTCTGAGACTTTGATGGGTGAACTGGGCAACATTGCTAAAACCCGTG 700
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 AGTGACACCACGTTTTTCCCTCTCCTGCTCTGAGACTTTGATGGGTGAACTGGGCAACATTGCTAAAACCCGTG 814
Query 701 ATTTGCACATTCAGAGCCATATAAGTGAAAATCGTGATGAAGTTGAAGCTGTGAAAAACTTATACCCCAGTTAT 774
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 ATTTGCACATTCAGAGCCATATAAGTGAAAATCGTGATGAAGTTGAAGCTGTGAAAAACTTATACCCCAGTTAT 888
Query 775 AAAAACTACACATCTGTGTATGATAAAAACAATCTTTTGACAAATAAGACAGTGATGGCACACGGCTGCTACCT 848
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 AAAAACTACACATCTGTGTATGATAAAAACAATCTTTTGACAAATAAGACAGTGATGGCACACGGCTGCTACCT 962
Query 849 CTCTGCAGAAGAACTGAACGTATTCCATGAACGAGGAGCATCCATCGCACACTGTCCCAATTCTAATTTATCGC 922
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 CTCTGCAGAAGAACTGAACGTATTCCATGAACGAGGAGCATCCATCGCACACTGTCCCAATTCTAATTTATCGC 1036
Query 923 TCAGCAGTGGATTTCTAAATGTGCTAGAAGTCCTGAAACATGAAGTCAAGATAGGGCTGGGTACAGACGTGGCT 996
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 TCAGCAGTGGATTTCTAAATGTGCTAGAAGTCCTGAAACATGAAGTCAAGATAGGGCTGGGTACAGACGTGGCT 1110
Query 997 GGTGGCTATTCATATTCCATGCTTGATGCAATCAGAAGAGCAGTGATGGTTTCCAATATCCTTTTAATTAATAA 1070
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 GGTGGCTATTCATATTCCATGCTTGATGCAATCAGAAGAGCAGTGATGGTTTCCAATATCCTTTTAATTAATAA 1184
Query 1071 GGTAAATGAGAAAAGCCTCACCCTCAAAGAAGTCTTCAGACTAGCTACTCTTGGAGGAAGCCAAGCCCTGGGGC 1144
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 GGTAAATGAGAAAAGCCTCACCCTCAAAGAAGTCTTCAGACTAGCTACTCTTGGAGGAAGCCAAGCCCTGGGGC 1258
Query 1145 TGGATGGTGAGATTGGAAACTTTGAAGTGGGCAAGGAATTTGATGCCATCCTGATCAACCCCAAAGCATCCGAC 1218
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 TGGATGGTGAGATTGGAAACTTTGAAGTGGGCAAGGAATTTGATGCCATCCTGATCAACCCCAAAGCATCCGAC 1332
Query 1219 TCTCCCATTGACCTGTTTTATGGGGACTTTTTTGGTGATATTTCTGAGGCTGTTATCCAGAAGTTCCTCTATCT 1292
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 TCTCCCATTGACCTGTTTTATGGGGACTTTTTTGGTGATATTTCTGAGGCTGTTATCCAGAAGTTCCTCTATCT 1406
Query 1293 AGGAGATGATCGAAA-TATTGA------AG----------------------AGGTTT-----ATG-----TGG 1327
||||.| |||| .|||.| || | ||| ||| |||
Sbjct 1407 AGGAAA-----GAAACAATTCACTTACCAGCCTCCTCACCCCATCCTCCACCA--TTTCCTTAATGTTCCATGG 1473
Query 1328 --------GCGGAAAGCAGGTGGTTCCGTTTTCCAGCTCAGTG 1362
.|||||..||..|
Sbjct 1474 TATTTTCAACGGAATACACTT---------------------- 1494