Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_02211
- Subject:
- XM_024447720.1
- Aligned Length:
- 1409
- Identities:
- 1325
- Gaps:
- 76
Alignment
Query 1 ATGTGTGCCGCTCAGATGCCGCCCCTGGCGCACATCTTCCGAGGGACGTTCGTCCACTCCACCTGGACCTGCCC 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGTGTGCCGCTCAGATGCCGCCCCTGGCGCACATCTTCCGAGGGACGTTCGTCCACTCCACCTGGACCTGCCC 74
Query 75 CATGGAGGTGCTGCGGGATCACCTCCTCGGCGTGAGCGACAGCGGCAAAATAGTGTTTTTAGAAGAAGCATCTC 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 CATGGAGGTGCTGCGGGATCACCTCCTCGGCGTGAGCGACAGCGGCAAAATAGTGTTTTTAGAAGAAGCATCTC 148
Query 149 AACAGGAAAAACTGGCCAAAGAATGGTGCTTCAAGCCGTGTGAAATAAGAGAACTGAGCCACCATGAGTTCTTC 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 AACAGGAAAAACTGGCCAAAGAATGGTGCTTCAAGCCGTGTGAAATAAGAGAACTGAGCCACCATGAGTTCTTC 222
Query 223 ATGCCTGGGCTGGTTGATACACACATCCATGCCTCTCAGTATTCCTTTGCTGGAAGTAGCATAGACCTGCCACT 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 ATGCCTGGGCTGGTTGATACACACATCCATGCCTCTCAGTATTCCTTTGCTGGAAGTAGCATAGACCTGCCACT 296
Query 297 CTTGGAGTGGCTGACCAAGTACACATTTCCTGCAGAACACAGATTCCAGAACATCGACTTTGCAGAAGAAGTAT 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 CTTGGAGTGGCTGACCAAGTACACATTTCCTGCAGAACACAGATTCCAGAACATCGACTTTGCAGAAGAAGTAT 370
Query 371 ATACCAGAGTTGTCAGGAGAACACTAAAGAATGGAACAACCACAGCTTGTTACTTTGCAACAATTCACACTGAC 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 ATACCAGAGTTGTCAGGAGAACACTAAAGAATGGAACAACCACAGCTTGTTACTTTGCAACAATTCACACTGAC 444
Query 445 TCATCTCTGCTCCTTGCCGACATTACAGATAAATTTGGACAGCGGGCATTTGTGGGCAAAGTTTGCATGGATTT 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 TCATCTCTGCTCCTTGCCGACATTACAGATAAATTTGGACAGCGGGCATTTGTGGGCAAAGTTTGCATGGATTT 518
Query 519 GAATGACACTTTTCCAGAATACAAGGAGACCACTGAGGAATCGATCAAGGAAACTGAGAGATTTGTGTCAGAAA 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 GAATGACACTTTTCCAGAATACAAGGAGACCACTGAGGAATCGATCAAGGAAACTGAGAGATTTGTGTCAGAAA 592
Query 593 TGCTCCAAAAGAACTATTCTAGAGTGAAGCCCATAGTGACACCACGTTTTTCCCTCTCCTGCTCTGAGACTTTG 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 TGCTCCAAAAGAACTATTCTAGAGTGAAGCCCATAGTGACACCACGTTTTTCCCTCTCCTGCTCTGAGACTTTG 666
Query 667 ATGGGTGAACTGGGCAACATTGCTAAAACCCGTGATTTGCACATTCAGAGCCATATAAGTGAAAATCGTGATGA 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 ATGGGTGAACTGGGCAACATTGCTAAAACCCGTGATTTGCACATTCAGAGCCATATAAGTGAAAATCGTGATGA 740
Query 741 AGTTGAAGCTGTGAAAAACTTATACCCCAGTTATAAAAACTACACATCTGTGTATGATAAAAACAATCTTTTGA 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 AGTTGAAGCTGTGAAAAACTTATACCCCAGTTATAAAAACTACACATCTGTGTATGATAAAAACAATCTTTTGA 814
Query 815 CAAATAAGACAGTGATGGCACACGGCTGCTACCTCTCTGCAGAAGAACTGAACGTATTCCATGAACGAGGAGCA 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 CAAATAAGACAGTGATGGCACACGGCTGCTACCTCTCTGCAGAAGAACTGAACGTATTCCATGAACGAGGAGCA 888
Query 889 TCCATCGCACACTGTCCCAATTCTAATTTATCGCTCAGCAGTGGATTTCTAAATGTGCTAGAAGTCCTGAAACA 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 TCCATCGCACACTGTCCCAATTCTAATTTATCGCTCAGCAGTGGATTTCTAAATGTGCTAGAAGTCCTGAAACA 962
Query 963 TGAAGTCAAGATAGGGCTGGGTACAGACGTGGCTGGTGGCTATTCATATTCCATGCTTGATGCAATCAGAAGAG 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 TGAAGTCAAGATAGGGCTGGGTACAGACGTGGCTGGTGGCTATTCATATTCCATGCTTGATGCAATCAGAAGAG 1036
Query 1037 CAGTGATGGTTTCCAATATCCTTTTAATTAATAAGGTAAATGAGAAAAGCCTCACCCTCAAAGAAGTCTTCAGA 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 CAGTGATGGTTTCCAATATCCTTTTAATTAATAAGGTAAATGAGAAAAGCCTCACCCTCAAAGAAGTCTTCAGA 1110
Query 1111 CTAGCTACTCTTGGAGGAAGCCAAGCCCTGGGGCTGGATGGTGAGATTGGAAACTTTGAAGTGGGCAAGGAATT 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 CTAGCTACTCTTGGAGGAAGCCAAGCCCTGGGGCTGGATGGTGAGATTGGAAACTTTGAAGTGGGCAAGGAATT 1184
Query 1185 TGATGCCATCCTGATCAACCCCAAAGCATCCGACTCTCCCATTGACCTGTTTTATGGGGACTTTTTTGGTGATA 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 TGATGCCATCCTGATCAACCCCAAAGCATCCGACTCTCCCATTGACCTGTTTTATGGGGACTTTTTTGGTGATA 1258
Query 1259 TTTCTGAGGCTGTTATCCAGAAGTTCCTCTATCTAGGAGATGATCGAAA-TATTGA------AG---------- 1315
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.| |||| .|||.| ||
Sbjct 1259 TTTCTGAGGCTGTTATCCAGAAGTTCCTCTATCTAGGAAA-----GAAACAATTCACTTACCAGCCTCCTCACC 1327
Query 1316 ------------AGGTTT-----ATG-----TGG--------GCGGAAAGCAGGTGGTTCCGTTTTCCAGCTCA 1359
| ||| ||| ||| .|||||..||..|
Sbjct 1328 CCATCCTCCACCA--TTTCCTTAATGTTCCATGGTATTTTCAACGGAATACACTT------------------- 1380
Query 1360 GTG 1362
Sbjct 1381 --- 1380