Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_02227
- Subject:
- XM_006532840.3
- Aligned Length:
- 1876
- Identities:
- 1613
- Gaps:
- 83
Alignment
Query 1 ATGTTGAACATGTGGAAGGTGCGCGAGCTGGTGGACAAAGCCACCAATGTTGTTATGAATTATTCAGAGATCGA 74
|||.|||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.||
Sbjct 1 ATGCTGAACATGTGGAAGGTGCGGGAGCTGGTGGACAAAGCCACCAATGTGGTTATGAATTACTCAGAGATTGA 74
Query 75 GTCTAAGGTTCGAGAGGCAACGAACGATGATCCTTGGGGACCTTCTGGGCAACTCATGGGAGAGATTGCCAAGG 148
|||||||||||||||.||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 GTCTAAGGTTCGAGAAGCAACGAATGATGATCCCTGGGGACCTTCTGGGCAGCTCATGGGAGAGATTGCCAAGG 148
Query 149 CTACATTTATGTATGAACAATTTCCAGAACTTATGAACATGCTTTGGTCACGAATGTTAAAAGACAACAAAAAG 222
||||.|||||||||||.||.||.||||||||.|||||||||||||||||.||.|||.|||||||||||||||||
Sbjct 149 CTACCTTTATGTATGAGCAGTTCCCAGAACTCATGAACATGCTTTGGTCCCGGATGCTAAAAGACAACAAAAAG 222
Query 223 AATTGGAGAAGAGTTTATAAGTCGTTGCTGCTCCTAGCTTACCTCATAAGGAATGGATCAGAGCGTGTTGTTAC 296
||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.||||||||
Sbjct 223 AACTGGAGAAGAGTTTATAAGTCGTTGCTGCTCCTAGCTTACCTCATAAGAAATGGATCGGAGCGAGTTGTTAC 296
Query 297 AAGTGCCAGAGAACACATTTATGATTTACGATCCCTGGAAAATTACCACTTTGTAGATGAGCATGGTAAGGATC 370
|||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 297 AAGTGCCAGAGAACACATTTATGATTTGCGATCCCTGGAAAATTACCACTTTGTAGATGAGCATGGCAAGGATC 370
Query 371 AAGGTATAAATATTCGACAGAAGGTGAAGGAATTGGTTGAATTTGCCCAGGATGACGACAGGCTTCGTGAAGAG 444
||||||||||.|||||||||||.||.||||||.|||||||.|||||.||||||||.|||||||||||.||||||
Sbjct 371 AAGGTATAAACATTCGACAGAAAGTAAAGGAACTGGTTGAGTTTGCACAGGATGATGACAGGCTTCGAGAAGAG 444
Query 445 CGAAAGAAAGCAAAGAAGAACAAAGACAAGTATGTTGGGGTTTCCTCAGACAGTGTTGGAGGATTCAGATACAG 518
|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.||||||||.|||||.||||||.||||||.
Sbjct 445 CGAAAGAAAGCAAAGAAGAACAAAGACAAGTATGTCGGGGTCTCTTCAGACAGCGTTGGTGGATTCCGATACAA 518
Query 519 TGAAAGATATGATCCTGAGCCCAAATCAAAATGGGATGAGGAGTGGGATAAAAACAAGAGTGCTTTTCCATTCA 592
|||..|.||.||||||||||||||.||.||||||||.||.|||||||||||.||||||||.||.|||||.||||
Sbjct 519 TGAGCGGTACGATCCTGAGCCCAAGTCCAAATGGGACGAAGAGTGGGATAAGAACAAGAGCGCGTTTCCGTTCA 592
Query 593 GTGATAAATTAGGTGAGCTGAGTGATAAAATTGGAAGCACAATTGATGACACCATCAGCAAGTTCCGGAGGAAA 666
||||.||..|.||.||||||||.||.||.||.||.|||||.||.||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 GTGACAAGCTGGGCGAGCTGAGCGACAAGATCGGGAGCACGATCGACGACACCATCAGCAAGTTCCGGAGGAAA 666
Query 667 GATAGAGAAGACTCTCCAGAAAGATGCAGCGACAGCGATGAGGAAAAGAAAGCGAGAAGAGGCAGATCTCCCAA 740
||..|.||.||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||
Sbjct 667 GACCGGGAGGACTCTCCGGAAAGGTGCAGCGACAGTGATGAGGAAAAGAAAGCAAGAAGAGGTAGATCTCCCAA 740
Query 741 AGGTGAATTCAAAGATGAAGAGGAGACTGTGACGACAAAGCATATTCATATCACACAGGCCACAGAGACCACCA 814
||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 AGGTGAATTCAAAGATGAAGAGGAAACGGTGACGACGAAGCATATCCACATCACACAGGCCACAGAGACCACCA 814
Query 815 CAACCAGACACAAGCGCACAGCAAATCCTTCCAAAACCATTGATCTTGGAGCAGCAGCACATTACACAGGGGAC 888
|||||.|.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 815 CAACCCGGCACAAGCGCACAGCAAACCCTTCCAAAACCATTGATCTTGGAGCAGCAGCACATTACACGGGGGAC 888
Query 889 AAAGCAAGTCCAGATCAGAATGCTTCAACCCACACACCTCAGTCTTCAGTTAAGACTTCAGTGCCTAGCAGCAA 962
|||||.||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||..|||.|.||.|||||.||||||||
Sbjct 889 AAAGCCAGCCCAGATCAGAATGCTTCAACCCACACGCCTCAGTCGTCAGCCAAGCCATCGGTGCCGAGCAGCAA 962
Query 963 GTCATCTGGTGACCTTGTTGATCTGTTTGATGGCACCAGCCAGTCAACAGGAGGATCAGCTGATTTATTCGGAG 1036
|||.||.||.|||||.|||||.|||||||||||||..||||||||
Sbjct 963 GTCCTCGGGGGACCTCGTTGACCTGTTTGATGGCAGTAGCCAGTC----------------------------- 1007
Query 1037 GATTTGCTGACTTTGGCTCAGCTGCTGCATCAGGCAGTTTCCCTTCCCAAGTAACAGCAACAAGTGGGAATGGA 1110
|.|||||||||||||||||||.
Sbjct 1008 ----------------------------------------------------AGCAGCAACAAGTGGGAATGGT 1029
Query 1111 GACTTTGGTGACTGGAGTGCCTTCAACCAAGCCCCATCAGGCCCTGTTGCTTCCAGTGGCGAGTTCTTTGGCAG 1184
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||..||||.|||.||||.|||||
Sbjct 1030 GACTTTGGTGACTGGAGTGCCTTCAACCAAGCCCCATCAGGCCCTGTGGCTTCTGGTGGTGAGCTCTTCGGCAG 1103
Query 1185 TGCCTCACAGCCAGCGGTAGAACTTGTTAGTGGCTCACAATCAGCTCTAGGCCCACCTCCTGCTGCCTCAAATT 1258
||||.|||||.|.||.||.||.|||.|.||||..|||||..|||||.||||||||||.||||||||||||||.|
Sbjct 1104 TGCCCCACAGTCGGCTGTGGAGCTTATCAGTGCTTCACAGCCAGCTTTAGGCCCACCGCCTGCTGCCTCAAACT 1177
Query 1259 CTTCAGACCTGTTTGATCTTATGGGCTCGTCCCAGGCAACCATGACATCTTCCCAGAGTATGAATTTCTCTATG 1332
|..|||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||.|.
Sbjct 1178 CGGCAGACCTGTTTGATCTTATGGGCTCATCCCAGGCAACCATGACGTCTTCCCAGAGCATGAATTTCTCTCTC 1251
Query 1333 ATGAGCACTAACACTGTGGGACTTGGTTTGCCTATGTCAAGATCACAGAATACAGATATGGTCCAGAAATCAGT 1406
||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.|.
Sbjct 1252 ATGAGCACTAACACCGTGGGACTTGGTTTGCCCATGTCCAGATCACAGAATACAGATATGGTCCAGAAGTCGGC 1325
Query 1407 CAGCAAAACCTTGCCCTCTACTTGGTCTGACCCCAGTGTAAACATCAGCCTAGACAACTTACTACCTGGTATGC 1480
||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1326 CAGCAAAACCCTGCCCTCTACTTGGTCTGACCCCAGTGTCAACATCAGCCTAGACAACTTACTACCTGGTATGC 1399
Query 1481 AGCCTTCCAAACCCCAGCAGCCATCACTGAATACAATGATTCAGCAACAGAATATGCAGCAGCCTATGAATGTG 1554
||||||||||.||||||||||||||.||.||||||||||||||.||||||||||||||.||||||.||||||||
Sbjct 1400 AGCCTTCCAAGCCCCAGCAGCCATCGCTTAATACAATGATTCAACAACAGAATATGCAACAGCCTCTGAATGTG 1473
Query 1555 ATGACTCAAAGTTTTGGAGCTGTGAACCTCAGTTCTCCATCGAACATGCTTCCTGTCCGGCCCCAAACTAATGC 1628
|||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||..|
Sbjct 1474 ATGACACAAAGCTTTGGAGCTGTGAACCTCAGTTCTCCATCAAACATGCTTCCTGTCCGGCCTCAAACTAACCC 1547
Query 1629 TTTGATAGGGGGACCCATGCCTATGAGCATGCCCAATGTGATGACTGGCACCATGGGAATGGCCCCTCTTGGAA 1702
|.|..|.|||||||||||||||||||.|||||||..|||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||.|
Sbjct 1548 TCTCCTGGGGGGACCCATGCCTATGAACATGCCCGGTGTAATGACGGGCACCATGGGAATGGCCCCTCTGGGGA 1621
Query 1703 ATA-CTCCGATGATGAACCAGAGCATGATGGGCATGAACATGAACATAGGGATGTCCGCTGCTGGGATGGGCTT 1775
|.| |.|.| .|||||.||||.|||||.|||||||||||||||||||.||||||||.||..|.|||||||||||
Sbjct 1622 ACAGCGCAG-GGATGAGCCAGGGCATGGTGGGCATGAACATGAACATGGGGATGTCGGCCTCGGGGATGGGCTT 1694
Query 1776 GACAGGCACAATGGGAATGGGCATGCCCAACATAGCCATGACTTCTGGAACTGTGCAACCCAAGCAAGATGCCT 1849
|.|.|||||.|||||||||||||||||||.|||.||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1695 GTCGGGCACCATGGGAATGGGCATGCCCAGCATGGCCATGCCTTCTGGAACTGTGCAACCCAAGCAAGATGCCT 1768
Query 1850 TTGCAAATTTCGCCAATTTTAGCAAA 1875
|||||||.||.|||||.|||||||||
Sbjct 1769 TTGCAAACTTTGCCAACTTTAGCAAA 1794