Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_02227
- Subject:
- XM_011534701.3
- Aligned Length:
- 1934
- Identities:
- 1545
- Gaps:
- 385
Alignment
Query 1 ATGTTGAACATGTGGAAGGTGCGCGAGCTGGTGGACAAAGCCACCAATGTTGTTATGAATTATTCAGAGATCGA 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGTTGAACATGTGGAAGGTGCGCGAGCTGGTGGACAAAGCCACCAATGTTGTTATGAATTATTCAGAGATCGA 74
Query 75 GTCTAAGGTTCGAGAGGCAACGAACGATGATCCTTGGGGACCTTCTGGGCAACTCATGGGAGAGATTGCCAAGG 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 GTCTAAGGTTCGAGAGGCAACGAACGATGATCCTTGGGGACCTTCTGGGCAACTCATGGGAGAGATTGCCAAGG 148
Query 149 CTACATTTATGTATGAACAATTTCCAGAACTTATGAACATGCTTTGGTCACGAATGTTAAAAGACAACAAAAAG 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 CTACATTTATGTATGAACAATTTCCAGAACTTATGAACATGCTTTGGTCACGAATGTTAAAAGACAACAAAAAG 222
Query 223 AATTGGAGAAGAGTTTATAAGTCGTTGCTGCTCCTAGCTTACCTCATAAGGAATGGATCAGAGCGTGTTGTTAC 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 AATTGGAGAAGAGTTTATAAGTCGTTGCTGCTCCTAGCTTACCTCATAAGGAATGGATCAGAGCGTGTTGTTAC 296
Query 297 AAGTGCCAGAGAACACATTTATGATTTACGATCCCTGGAAAATTACCACTTTGTAGATGAGCATGGTAAGGATC 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 AAGTGCCAGAGAACACATTTATGATTTACGATCCCTGGAAAATTACCACTTTGTAGATGAGCATGGTAAGGATC 370
Query 371 AAGGTATAAATATTCGACAGAAGGTGAAGGAATTGGTTGAATTTGCCCAGGATGACGACAGGCTTCGTGAAGAG 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 AAGGTATAAATATTCGACAGAAGGTGAAGGAATTGGTTGAATTTGCCCAGGATGACGACAGGCTTCGTGAAGAG 444
Query 445 CGAAAGAAAGCAAAGAAGAACAAAGACAAGTATGTTGGGGTTTCCTCAGACAGTGTTGGAGGATTCAGATACAG 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 CGAAAGAAAGCAAAGAAGAACAAAGACAAGTATGTTGGGGTTTCCTCAGACAGTGTTGGAGGATTCAGATACAG 518
Query 519 TGAAAGATATGATCCTGAGCCCAAATCAAAATGGGATGAGGAGTGGGATAAAAACAAGAGTGCTTTTCCATTCA 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 TGAAAGATATGATCCTGAGCCCAAATCAAAATGGGATGAGGAGTGGGATAAAAACAAGAGTGCTTTTCCATTCA 592
Query 593 GTGATAAATTAGGTGAGCTGAGTGATAAAATTGGAAGCACAATTGATGACACCATCAGCAAGTTCCGGAGGAAA 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 GTGATAAATTAGGTGAGCTGAGTGATAAAATTGGAAGCACAATTGATGACACCATCAGCAAGTTCCGGAGGAAA 666
Query 667 GATAGAGAAGACTCTCCAGAAAGATGCAGCGACAGCGATGAGGAAAAGAAAGCGAGAAGAGGCAGATCTCCCAA 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 GATAGAGAAGACTCTCCAGAAAGATGCAGCGACAGCGATGAGGAAAAGAAAGCGAGAAGAGGCAGATCTCCCAA 740
Query 741 AGGTGAATTCAAAGATGAAGAGGAGACTGTGACGACAAAGCATATTCATATCACACAGGCCACAGAGACCACCA 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 AGGTGAATTCAAAGATGAAGAGGAGACTGTGACGACAAAGCATATTCATATCACACAGGCCACAGAGACCACCA 814
Query 815 CAACCAGACACAAGCGCACAGCAAATCCTTCCAAAACCATTGATCTTGGAGCAGCAGCACATTACACAGGGGAC 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 CAACCAGACACAAGCGCACAGCAAATCCTTCCAAAACCATTGATCTTGGAGCAGCAGCACATTACACAGGGGAC 888
Query 889 AAAGCAAGTCCAGATCAGAATGCTTCAACCCACACACCTCAGTCTTCAGTTAAGACTTCAGTGCCTAGCAGCAA 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 AAAGCAAGTCCAGATCAGAATGCTTCAACCCACACACCTCAGTCTTCAGTTAAGACTTCAGTGCCTAGCAGCAA 962
Query 963 GTCATCTGGTGACCTTGTTGATCTGTTTGATGGCACCAGCCAGTCAACAGGAGGATCAGCTGATTTATTCGGAG 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 GTCATCTGGTGACCTTGTTGATCTGTTTGATGGCACCAGCCAGTCAACAGGAGGATCAGCTGATTTATTCGGAG 1036
Query 1037 GATTTGCTGACTTTGGCTCAGCTGCTGCATCAGGCAGTTTCCCTTCCCAAGTAACAGCAACAAGTGGGAATGGA 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 GATTTGCTGACTTTGGCTCAGCTGCTGCATCAGGCAGTTTCCCTTCCCAAGTAACAGCAACAAGTGGGAATGGA 1110
Query 1111 GACTTTGGTGACTGGAGTGCCTTCAACCAAGCCCCATCAGGCCCTGTTGCTTCCAGTGGCGAGTTCTTTGGCAG 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 GACTTTGGTGACTGGAGTGCCTTCAACCAAGCCCCATCAGGCCCTGTTGCTTCCAGTGGCGAGTTCTTTGGCAG 1184
Query 1185 TGCCTCACAGCCAGCGGTAGAACTTGTTAGTGGCTCACAATCAGCTCTAGGCCCACCTCCTGCTGCCTCAAATT 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 TGCCTCACAGCCAGCGGTAGAACTTGTTAGTGGCTCACAATCAGCTCTAGGCCCACCTCCTGCTGCCTCAAATT 1258
Query 1259 CTTCAGACCTGTTTGATCTTATGGGCTCGTCCCAGGCAACCATGACATCTTCCCAGAGTATGAATTTCTCTATG 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 CTTCAGACCTGTTTGATCTTATGGGCTCGTCCCAGGCAACCATGACATCTTCCCAGAGTATGAATTTCTCTATG 1332
Query 1333 ATGAGCACTAACACTGTGGGACTTGGTTTGCCTATGTCAAGATCA----------------------------- 1377
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 ATGAGCACTAACACTGTGGGACTTGGTTTGCCTATGTCAAGATCACAGCCTTTGCAAAATGTTAGCACAGTGCT 1406
Query 1378 -------------------------CAGAATACAGATATGGTCCAGAAATCAGTCAGCAAAACCTTGCCCTCTA 1426
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 GCAGAAGCCTAATCCTCTCTATAATCAGAATACAGATATGGTCCAGAAATCAGTCAGCAAAACCTTGCCCTCTA 1480
Query 1427 CTTGGTCTGACCCCAGTGTAAACATCAGCCTAGACAACTTACTACCTGGTATGCAGCCTTCCAAACCCCAGCAG 1500
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 CTTGGTCTGACCCCAGTGTAAACATCAGCCTAGACAACTTACTACCTGGTATGCAGCCTTCCAAACCCCAGCAG 1554
Query 1501 CCATCACTGAATACAATGATTCAGCAACAGAATATGCAGCAGCCTATGAATGTGATGACTCAAAGTTT-----T 1569
|||||||||||||||||||||||||||||||.|.|.| ||.|| |||| |
Sbjct 1555 CCATCACTGAATACAATGATTCAGCAACAGATTCTTC------------------TGTCT----GTTTTCGTCT 1606
Query 1570 GGAGCTGTGAACCTCAGTTCTCCATCGAACATGCTTCCTGTCCGGCCCCAAACTAATGCTTTGATAGGGGGACC 1643
||
Sbjct 1607 GG------------------------------------------------------------------------ 1608
Query 1644 CATGCCTATGAGCATGCCCAATGTGATGACTGGCACCATGGGAATGGCCCCTCTTGGAAATACTCCGATGATGA 1717
Sbjct 1609 -------------------------------------------------------------------------- 1608
Query 1718 ACCAGAGCATGATGGGCATGAACATGAACATAGGGATGTCCGCTGCTGGGATGGGCTTGACAGGCACAATGGGA 1791
Sbjct 1609 -------------------------------------------------------------------------- 1608
Query 1792 ATGGGCATGCCCAACATAGCCATGACTTCTGGAACTGTGCAACCCAAGCAAGATGCCTTTGCAAATTTCGCCAA 1865
Sbjct 1609 -------------------------------------------------------------------------- 1608
Query 1866 TTTTAGCAAA 1875
Sbjct 1609 ---------- 1608