Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_02232
- Subject:
- NM_144794.2
- Aligned Length:
- 2426
- Identities:
- 2117
- Gaps:
- 19
Alignment
Query 1 ATGATGGACTCCCCGTTCCTGGAGCTGTGGCAGTCCAAGGCAGTGTCCATCAGGGAGCAGCTGGGACTCGGGGA 74
||||....|||||||||||||||.|..||||.|||||||||.||||...||.|.||||..|||||.||.||.||
Sbjct 1 ATGACCAGCTCCCCGTTCCTGGATCCCTGGCCGTCCAAGGCTGTGTTTGTCCGTGAGCGCCTGGGTCTTGGCGA 74
Query 75 CCGGCCCAACGACTCCTATTGCTACAACTCGGCCAAAAACAGCACCGTGCTCCAGGGGGTCACCTTTGGTGGCA 148
.||.|||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.||||
Sbjct 75 ACGTCCCAATGACTCCTATTGCTACAACTCAGCCAAAAACAGCACTGTGCTCCAAGGGGTCACCTTTGGAGGCA 148
Query 149 TCCCCACTGTCCTGCTCATAGACGTCAGCTGCTTCCTGTTCTTAATCTTGGTGTTTTCTATTATAAGAAGAAGA 222
|||||||||||||||||.||||.|||||.|||||.|||||..|||||.||||||||||.||.|||||.||||||
Sbjct 149 TCCCCACTGTCCTGCTCTTAGATGTCAGTTGCTTTCTGTTTCTAATCCTGGTGTTTTCCATCATAAGGAGAAGA 222
Query 223 TTCTGGGACTATGGCCGCATTGCCCTGGTGTCAGAAGCAGACAGCGAGTCCAGATTTCAGAGATTGTCATCGAC 296
||||||||.|||||||||||.||||||||.||||||||||.|||.|||.||||.||.||||||.||||.| |
Sbjct 223 TTCTGGGATTATGGCCGCATAGCCCTGGTATCAGAAGCAGGCAGTGAGGCCAGGTTCCAGAGACTGTCCT---C 293
Query 297 TTCCTCCTCAGGTCAACAAGACTTTGAAAATGAGCTGGGATGCTGTCCCTGGCTGACTGCCATCTTCCGTCTGC 370
||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.||||
Sbjct 294 TTCCTCCTCAGGGCAACAAGACTTTGAAAACGAGCTGGGATGCTGTCCTTGGCTGACGGCCATCTTCCGCCTGC 367
Query 371 ATGATGACCAGATCCTGGAATGGTGTGGGGAGGACGCCATCCACTACCTGTCCTTCCAGAGGCACATCATCTTC 444
||||.||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||
Sbjct 368 ATGACGACCAGATCCTGGAGTGGTGCGGAGAGGACGCCATCCACTACCTGTCTTTTCAGAGGCACATCATCTTC 441
Query 445 CTGTTGGTGGTGGTCAGCTTTTTGTCCCTGTGTGTCATCCTGCCTGTCAACCTCTCAGGGGACTTGCTGGACAA 518
|||.||||||||.|||||||.||||||||||||||||||.||||||||||||||||.||.||||||||||..||
Sbjct 442 CTGCTGGTGGTGATCAGCTTCTTGTCCCTGTGTGTCATCTTGCCTGTCAACCTCTCGGGAGACTTGCTGGGTAA 515
Query 519 AGACCCGTATAGTTTTGGGAGGACAACAATAGCAAACCTACAGACTGACAATGACCTCCTTTGGCTGCACACCA 592
||||||.||.||.||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||..
Sbjct 516 AGACCCTTACAGCTTTGGGAGGACAACGATAGCTAACCTGCAGACTGACAATGACCTCCTCTGGCTGCACACTG 589
Query 593 TCTT-TGCTGTCATTTACCTCTTCCTCACTGTGGGTTTCATGCGGCACCACACTCAGTCCATTAAGTACAAAGA 665
|||| .|| |||||.||||||||||||||.|||||.||||||.||||.|||||.|.||||||.|..||||||||
Sbjct 590 TCTTCAGC-GTCATCTACCTCTTCCTCACGGTGGGCTTCATGTGGCATCACACACGGTCCATCAGATACAAAGA 662
Query 666 GGAGAACCTGGTGAGGCGGACCCTGTTCATCACAGGACTCCCCAGAGATGCCAGGAAGGAGACTGTGGAGAGCC 739
|||||..||||||||.|..|||.|||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 663 GGAGAGTCTGGTGAGACAAACCTTGTTCATCACAGGACTCCCCAGAGAAGCCAGAAAGGAGACTGTGGAGAGCC 736
Query 740 ACTTCCGGGACGCGTATCCCACGTGTGAGGTGGTTGATGTGCAGCTGTGCTACAACGTGGCCAAACTGATCTAC 813
|||||||.||.|||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||.||||||.||.|||||||||
Sbjct 737 ACTTCCGAGATGCGTATCCCACGTGTGAGGTGGTGGATGTCCAGCTGTGCTACAGCGTGGCTAAGCTGATCTAC 810
Query 814 CTGTGCAAGGAGAAAAAGAAGACTGAGAAGAGCCTGACCTATTACACAAACCTGCAGGTGAAGACAGGCCAGCG 887
||||||||.||||.|||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||.|||||||||||..||
Sbjct 811 CTGTGCAAAGAGAGAAAGAAGACCGAGAAGAGCCTTACCTATTACACAAACCTGCAGGCGAAGACAGGCCGACG 884
Query 888 GACCCTCATCAACCCCAAGCCCTGTGGCCAGTTTTGCTGCTGTGAAGTGCTGGGCTGTGAGTGGGAAGACGCCA 961
|||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.|.|||.||||||.|||||||.||.|
Sbjct 885 GACCCTCATCAACCCCAAGCCTTGTGGCCAGTTCTGCTGCTGTGAAGTTCAGGGTTGTGAGCGGGAAGATGCTA 958
Query 962 TCTCTTACTACACACGGATGAAGGACAGGCTGCTGGAGAGGATCACAGAGGAAGAACGCCACGTCCAGGACCAG 1035
|.|||||||||||.||.|||||.|||||.|||||||||||||||||||..|||||..|||..||||||||||||
Sbjct 959 TTTCTTACTACACTCGAATGAATGACAGCCTGCTGGAGAGGATCACAGCCGAAGAGAGCCGGGTCCAGGACCAG 1032
Query 1036 CCCCTGGGAATGGCCTTCGTCACCTTCCAGGAGAAGTCCATGGCCACCTACATCCTGAAAGATTTCAATGCCTG 1109
|||||||||||||||||.||||||||||..||||||||||||||.||||||||.||||||||.|||||||||||
Sbjct 1033 CCCCTGGGAATGGCCTTTGTCACCTTCCGTGAGAAGTCCATGGCTACCTACATACTGAAAGACTTCAATGCCTG 1106
Query 1110 CAAGTGTCAGAGCCTTCAGTGCAAAGGTGAGCCCCAGCCGTCCTCCCATAGCAGGGAGCTCTATACCTCCAAGT 1183
||||||.|||.||||||.|||||||||.|||||||||||.||||||.|||||||.|||||||.|..||||||||
Sbjct 1107 CAAGTGCCAGGGCCTTCGGTGCAAAGGGGAGCCCCAGCCATCCTCCTATAGCAGAGAGCTCTGTGTCTCCAAGT 1180
Query 1184 GGACAGTCACCTTTG-CTGCTGACCCTGAGGACATCTGCTGGAAGAACCTCTCTATCCAGGGCCTCCGCTGGTG 1256
||||.|||||.|||| ||.|| |.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||.|.||||||||
Sbjct 1181 GGACGGTCACTTTTGCCTCCT-ATCCTGAGGACATCTGCTGGAAGAACCTCTCCATCCAGGGCGTTCGCTGGTG 1253
Query 1257 GCTACAGTGGCTGGGCATCAACTTCACCCTCTTCCTGGGGCTATTTTTCCTGACCACACCCTCCATCATCCTGT 1330
|||.|||||||||||.|||||||||.|.||.||..|||.|||.||||||||||||||.|||||||||||..|||
Sbjct 1254 GCTCCAGTGGCTGGGTATCAACTTCTCTCTGTTTGTGGTGCTGTTTTTCCTGACCACGCCCTCCATCATTATGT 1327
Query 1331 CCACCATGGACAAGTTTAATGTCACCAAACCCATCCATGCGCTGAATAACCCGATCATCAGCCAGTTCTTCCCC 1404
|.||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||.|||||||||||..||||||||||||||||||||
Sbjct 1328 CTACCATGGACAAGTTCAATGTTACCAAACCCATCCACGCACTGAATAACCCCGTCATCAGCCAGTTCTTCCCC 1401
Query 1405 ACCCTCCTGCTCTGGTCCTTCTCGGCCCTGCTCCCCTCCATTGTCTACTACTCTACACTGCTGGAGTCTCACTG 1478
||.||||||||.|||||||||||.||.|||||.||.|||||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||
Sbjct 1402 ACACTCCTGCTGTGGTCCTTCTCTGCGCTGCTTCCGTCCATTGTCTACTACTCCACGCTGCTGGAGTCCCACTG 1475
Query 1479 GACCAAGTCGGGGGAAAACCAGATCATGATGACCAAAGTCTACATATTCTTGATCTTCATGGTGCTGATCCTGC 1552
|||.|.|||.||||||||||.|||||||.||.|.||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1476 GACAAGGTCAGGGGAAAACCGGATCATGGTGTCGAAGGTCTACATATTTTTGATCTTCATGGTGCTGATCCTGC 1549
Query 1553 CCTCCCTGGGTCTCACCAGTCTAGATTTTTTCTTCCGGTGGCTCTTTGACAAAACTTCCTCGGAGGCCTCCATC 1626
|||||||.|||||||||||..|.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||..||||.|||
Sbjct 1550 CCTCCCTCGGTCTCACCAGCTTGGATTTCTTCTTCCGGTGGCTCTTTGACAAAACTTCCTCGGAAACCTCAATC 1623
Query 1627 AGGTTGGAGTGCGTCTTCCTGCCTGACCAGGGTGCCTTCTTTGTGAACTATGTCATCGCCTCGGCCTTCATCGG 1700
|||.|.|||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||
Sbjct 1624 AGGCTAGAGTGTGTCTTCCTGCCAGACCAGGGTGCCTTCTTTGTGAACTACGTCATCGCCTCAGCCTTCATCGG 1697
Query 1701 CAATGGCATGGAGCTGCTGCGGCTGCCAGGTCTCATCCTCTATACCTTCCGCATGATCATGGCCAAGACGGCTG 1774
||.|||||||||||||.||||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 1698 CAGTGGCATGGAGCTGTTGCGCCTGCCCGGCCTCATCCTCTATACCTTCCGCATGATCATGGCCAAGACGGCCG 1771
Query 1775 CTGACCGCAGGAATGTCAAGCAGAACCAGGCCTTCCAGTACGAGTTTGGAGCCATGTATGCATGGATGCTGTGT 1848
||||||||||||||||.||||||||||||||.||..|.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct 1772 CTGACCGCAGGAATGTTAAGCAGAACCAGGCTTTTGAATACGAGTTTGGAGCCATGTATGCGTGGATGCTGTGT 1845
Query 1849 GTCTTCACTGTCATCGTGGCCTACAGCATCACTTGTCCCATCATCGCGCCATTTGGCCTCATCTACATCCTGCT 1922
||||||||.||||||.||||.|||||||||||.||.|||||.||||.|||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 1846 GTCTTCACCGTCATCATGGCTTACAGCATCACCTGCCCCATTATCGTGCCCTTTGGCCTCATCTACATCCTGCT 1919
Query 1923 CAAGCACATGGTGGACCGGCACAACCTCTACTTCGTCTACCTCCCAGCCAAGCTGGAGAAGGGGATCCACTTTG 1996
.||||||||||||||||||||.|||||||||||||..||||||||.||.||.|||||||||.||||||||||.|
Sbjct 1920 TAAGCACATGGTGGACCGGCATAACCTCTACTTCGCTTACCTCCCGGCTAAACTGGAGAAGAGGATCCACTTCG 1993
Query 1997 CCGCTGTGAACCAGGCCTTGGCAGCCCCCATCCTGTGCCTCTTCTGGCTCTACTTCTTTTCCTTCCTGCGCCTG 2070
||||.||||||||||||.||||.|||||||||||.||||||||||||||||.|||.||.||||||||.||.|||
Sbjct 1994 CCGCCGTGAACCAGGCCCTGGCCGCCCCCATCCTCTGCCTCTTCTGGCTCTTCTTTTTCTCCTTCCTCCGTCTG 2067
Query 2071 GGTATGAAGGCCCCCGCCACTCTGTTCACCTTCCTGGTGCTGCTGCTCACCATCCTGGTCTGCCTGGCT-CACA 2143
|||.|||.||||||.|||||.||.||||||||||||||..|.||||||||||||||||.|||||| ||| .|||
Sbjct 2068 GGTCTGACGGCCCCGGCCACGCTCTTCACCTTCCTGGTTGTTCTGCTCACCATCCTGGCCTGCCT-GCTGTACA 2140
Query 2144 CCTGCTTTGGATGCTTCAAGCACCTCAGCCCTCTGAACTACAAAACAGAAGAGCCTGCAAGTGACAAAGGAAGT 2217
|||||||||||||||||||||||||||||||...|||||||||.||||||||..|.||.||||||||||||||.
Sbjct 2141 CCTGCTTTGGATGCTTCAAGCACCTCAGCCCATGGAACTACAAGACAGAAGAATCAGCTAGTGACAAAGGAAGC 2214
Query 2218 GAGGCAGAGGCCCACATGCCCCCACCGTTCACACCCTACGTGCCTCGGATTCTGAACGGCTTGGCCTCGGAGAG 2291
||.||.|||||||||.|||||||.||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.|||||
Sbjct 2215 GAAGCCGAGGCCCACGTGCCCCCGCCATTCACACCCTATGTGCCTCGGATTCTGAACGGTTTGGCCTCAGAGAG 2288
Query 2292 GACAGCACTG-TCTCCGCAGCAGCAGCAGCAGCAGACCTATGGTGCCATCCACAACATCAGCGGGACTATCCCT 2364
|||||| | |.|||.|| |||||||||||||||||.||||||||||..||||||||.||||||.|.|||
Sbjct 2289 GACAGC---GTTATCCCCA----CAGCAGCAGCAGACCTACGGTGCCATCCGTAACATCAGTGGGACTCTTCCT 2355
Query 2365 GGACAGTGCTTGGCGC-AGAGCGCCACGGGCAGTGTGGCTGCTGCCCCCCAGGAGGCC 2421
||.|||..|.||||.| |||.| |.|..||||.||.||||..||||..||||||..||
Sbjct 2356 GGGCAGCCCGTGGCTCAAGATC-CTAGTGGCACTGCGGCTTATGCCTACCAGGAATCC 2412