Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_02232
- Subject:
- XM_006711841.4
- Aligned Length:
- 2421
- Identities:
- 1890
- Gaps:
- 531
Alignment
Query 1 ATGATGGACTCCCCGTTCCTGGAGCTGTGGCAGTCCAAGGCAGTGTCCATCAGGGAGCAGCTGGGACTCGGGGA 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 CCGGCCCAACGACTCCTATTGCTACAACTCGGCCAAAAACAGCACCGTGCTCCAGGGGGTCACCTTTGGTGGCA 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 TCCCCACTGTCCTGCTCATAGACGTCAGCTGCTTCCTGTTCTTAATCTTGGTGTTTTCTATTATAAGAAGAAGA 222
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 223 TTCTGGGACTATGGCCGCATTGCCCTGGTGTCAGAAGCAGACAGCGAGTCCAGATTTCAGAGATTGTCATCGAC 296
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 297 TTCCTCCTCAGGTCAACAAGACTTTGAAAATGAGCTGGGATGCTGTCCCTGGCTGACTGCCATCTTCCGTCTGC 370
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 371 ATGATGACCAGATCCTGGAATGGTGTGGGGAGGACGCCATCCACTACCTGTCCTTCCAGAGGCACATCATCTTC 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGATGACCAGATCCTGGAATGGTGTGGGGAGGACGCCATCCACTACCTGTCCTTCCAGAGGCACATCATCTTC 74
Query 445 CTGTTGGTGGTGGTCAGCTTTTTGTCCCTGTGTGTCATCCTGCCTGTCAACCTCTCAGGGGACTTGCTGGACAA 518
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 CTGTTGGTGGTGGTCAGCTTTTTGTCCCTGTGTGTCATCCTGCCTGTCAACCTCTCAGGGGACTTGCTG----- 143
Query 519 AGACCCGTATAGTTTTGGGAGGACAACAATAGCAAACCTACAGACTGACAATGACCTCCTTTGGCTGCACACCA 592
Sbjct 144 -------------------------------------------------------------------------- 143
Query 593 TCTTTGCTGTCATTTACCTCTTCCTCACTGTGGGTTTCATGCGGCACCACACTCAGTCCATTAAGTACAAAGAG 666
Sbjct 144 -------------------------------------------------------------------------- 143
Query 667 GAGAACCTGGTGAGGCGGACCCTGTTCATCACAGGACTCCCCAGAGATGCCAGGAAGGAGACTGTGGAGAGCCA 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 144 --------GGTGAGGCGGACCCTGTTCATCACAGGACTCCCCAGAGATGCCAGGAAGGAGACTGTGGAGAGCCA 209
Query 741 CTTCCGGGACGCGTATCCCACGTGTGAGGTGGTTGATGTGCAGCTGTGCTACAACGTGGCCAAACTGATCTACC 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 210 CTTCCGGGACGCGTATCCCACGTGTGAGGTGGTTGATGTGCAGCTGTGCTACAACGTGGCCAAACTGATCTACC 283
Query 815 TGTGCAAGGAGAAAAAGAAGACTGAGAAGAGCCTGACCTATTACACAAACCTGCAGGTGAAGACAGGCCAGCGG 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 284 TGTGCAAGGAGAAAAAGAAGACTGAGAAGAGCCTGACCTATTACACAAACCTGCAGGTGAAGACAGGCCAGCGG 357
Query 889 ACCCTCATCAACCCCAAGCCCTGTGGCCAGTTTTGCTGCTGTGAAGTGCTGGGCTGTGAGTGGGAAGACGCCAT 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 358 ACCCTCATCAACCCCAAGCCCTGTGGCCAGTTTTGCTGCTGTGAAGTGCTGGGCTGTGAGTGGGAAGACGCCAT 431
Query 963 CTCTTACTACACACGGATGAAGGACAGGCTGCTGGAGAGGATCACAGAGGAAGAACGCCACGTCCAGGACCAGC 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 432 CTCTTACTACACACGGATGAAGGACAGGCTGCTGGAGAGGATCACAGAGGAAGAACGCCACGTCCAGGACCAGC 505
Query 1037 CCCTGGGAATGGCCTTCGTCACCTTCCAGGAGAAGTCCATGGCCACCTACATCCTGAAAGATTTCAATGCCTGC 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 506 CCCTGGGAATGGCCTTCGTCACCTTCCAGGAGAAGTCCATGGCCACCTACATCCTGAAAGATTTCAATGCCTGC 579
Query 1111 AAGTGTCAGAGCCTTCAGTGCAAAGGTGAGCCCCAGCCGTCCTCCCATAGCAGGGAGCTCTATACCTCCAAGTG 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 580 AAGTGTCAGAGCCTTCAGTGCAAAGGTGAGCCCCAGCCGTCCTCCCATAGCAGGGAGCTCTATACCTCCAAGTG 653
Query 1185 GACAGTCACCTTTGCTGCTGACCCTGAGGACATCTGCTGGAAGAACCTCTCTATCCAGGGCCTCCGCTGGTGGC 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 654 GACAGTCACCTTTGCTGCTGACCCTGAGGACATCTGCTGGAAGAACCTCTCTATCCAGGGCCTCCGCTGGTGGC 727
Query 1259 TACAGTGGCTGGGCATCAACTTCACCCTCTTCCTGGGGCTATTTTTCCTGACCACACCCTCCATCATCCTGTCC 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 728 TACAGTGGCTGGGCATCAACTTCACCCTCTTCCTGGGGCTATTTTTCCTGACCACACCCTCCATCATCCTGTCC 801
Query 1333 ACCATGGACAAGTTTAATGTCACCAAACCCATCCATGCGCTGAATAACCCGATCATCAGCCAGTTCTTCCCCAC 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 802 ACCATGGACAAGTTTAATGTCACCAAACCCATCCATGCGCTGAATAACCCGATCATCAGCCAGTTCTTCCCCAC 875
Query 1407 CCTCCTGCTCTGGTCCTTCTCGGCCCTGCTCCCCTCCATTGTCTACTACTCTACACTGCTGGAGTCTCACTGGA 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 876 CCTCCTGCTCTGGTCCTTCTCGGCCCTGCTCCCCTCCATTGTCTACTACTCTACACTGCTGGAGTCTCACTGGA 949
Query 1481 CCAAGTCGGGGGAAAACCAGATCATGATGACCAAAGTCTACATATTCTTGATCTTCATGGTGCTGATCCTGCCC 1554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 950 CCAAGTCGGGGGAAAACCAGATCATGATGACCAAAGTCTACATATTCTTGATCTTCATGGTGCTGATCCTGCCC 1023
Query 1555 TCCCTGGGTCTCACCAGTCTAGATTTTTTCTTCCGGTGGCTCTTTGACAAAACTTCCTCGGAGGCCTCCATCAG 1628
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1024 TCCCTGGGTCTCACCAGTCTAGATTTTTTCTTCCGGTGGCTCTTTGACAAAACTTCCTCGGAGGCCTCCATCAG 1097
Query 1629 GTTGGAGTGCGTCTTCCTGCCTGACCAGGGTGCCTTCTTTGTGAACTATGTCATCGCCTCGGCCTTCATCGGCA 1702
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1098 GTTGGAGTGCGTCTTCCTGCCTGACCAGGGTGCCTTCTTTGTGAACTATGTCATCGCCTCGGCCTTCATCGGCA 1171
Query 1703 ATGGCATGGAGCTGCTGCGGCTGCCAGGTCTCATCCTCTATACCTTCCGCATGATCATGGCCAAGACGGCTGCT 1776
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1172 ATGGCATGGAGCTGCTGCGGCTGCCAGGTCTCATCCTCTATACCTTCCGCATGATCATGGCCAAGACGGCTGCT 1245
Query 1777 GACCGCAGGAATGTCAAGCAGAACCAGGCCTTCCAGTACGAGTTTGGAGCCATGTATGCATGGATGCTGTGTGT 1850
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1246 GACCGCAGGAATGTCAAGCAGAACCAGGCCTTCCAGTACGAGTTTGGAGCCATGTATGCATGGATGCTGTGTGT 1319
Query 1851 CTTCACTGTCATCGTGGCCTACAGCATCACTTGTCCCATCATCGCGCCATTTGGCCTCATCTACATCCTGCTCA 1924
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1320 CTTCACTGTCATCGTGGCCTACAGCATCACTTGTCCCATCATCGCGCCATTTGGCCTCATCTACATCCTGCTCA 1393
Query 1925 AGCACATGGTGGACCGGCACAACCTCTACTTCGTCTACCTCCCAGCCAAGCTGGAGAAGGGGATCCACTTTGCC 1998
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1394 AGCACATGGTGGACCGGCACAACCTCTACTTCGTCTACCTCCCAGCCAAGCTGGAGAAGGGGATCCACTTTGCC 1467
Query 1999 GCTGTGAACCAGGCCTTGGCAGCCCCCATCCTGTGCCTCTTCTGGCTCTACTTCTTTTCCTTCCTGCGCCTGGG 2072
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1468 GCTGTGAACCAGGCCTTGGCAGCCCCCATCCTGTGCCTCTTCTGGCTCTACTTCTTTTCCTTCCTGCGCCTGGG 1541
Query 2073 TATGAAGGCCCCCGCCACTCTGTTCACCTTCCTGGTGCTGCTGCTCACCATCCTGGTCTGCCTGGCTCACACCT 2146
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1542 TATGAAGGCCCCCGCCACTCTGTTCACCTTCCTGGTGCTGCTGCTCACCATCCTGGTCTGCCTGGCTCACACCT 1615
Query 2147 GCTTTGGATGCTTCAAGCACCTCAGCCCTCTGAACTACAAAACAGAAGAGCCTGCAAGTGACAAAGGAAGTGAG 2220
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1616 GCTTTGGATGCTTCAAGCACCTCAGCCCTCTGAACTACAAAACAGAAGAGCCTGCAAGTGACAAAGGAAGTGAG 1689
Query 2221 GCAGAGGCCCACATGCCCCCACCGTTCACACCCTACGTGCCTCGGATTCTGAACGGCTTGGCCTCGGAGAGGAC 2294
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1690 GCAGAGGCCCACATGCCCCCACCGTTCACACCCTACGTGCCTCGGATTCTGAACGGCTTGGCCTCGGAGAGGAC 1763
Query 2295 AGCACTGTCTCCGCAGCAGCAGCAGCAGCAGACCTATGGTGCCATCCACAACATCAGCGGGACTATCCCTGGAC 2368
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1764 AGCACTGTCTCCGCAGCAGCAGCAGCAGCAGACCTATGGTGCCATCCACAACATCAGCGGGACTATCCCTGGAC 1837
Query 2369 AGTGCTTGGCGCAGAGCGCCACGGGCAGTGTGGCTGCTGCCCCCCAGGAGGCC 2421
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1838 AGTGCTTGGCGCAGAGCGCCACGGGCAGTGTGGCTGCTGCCCCCCAGGAGGCC 1890