Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_02232
- Subject:
- XM_011544332.3
- Aligned Length:
- 2421
- Identities:
- 1980
- Gaps:
- 441
Alignment
Query 1 ATGATGGACTCCCCGTTCCTGGAGCTGTGGCAGTCCAAGGCAGTGTCCATCAGGGAGCAGCTGGGACTCGGGGA 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 CCGGCCCAACGACTCCTATTGCTACAACTCGGCCAAAAACAGCACCGTGCTCCAGGGGGTCACCTTTGGTGGCA 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 TCCCCACTGTCCTGCTCATAGACGTCAGCTGCTTCCTGTTCTTAATCTTGGTGTTTTCTATTATAAGAAGAAGA 222
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 223 TTCTGGGACTATGGCCGCATTGCCCTGGTGTCAGAAGCAGACAGCGAGTCCAGATTTCAGAGATTGTCATCGAC 296
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 297 TTCCTCCTCAGGTCAACAAGACTTTGAAAATGAGCTGGGATGCTGTCCCTGGCTGACTGCCATCTTCCGTCTGC 370
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 371 ATGATGACCAGATCCTGGAATGGTGTGGGGAGGACGCCATCCACTACCTGTCCTTCCAGAGGCACATCATCTTC 444
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 -------------------ATGGTGTGGGGAGGACGCCATCCACTACCTGTCCTTCCAGAGGCACATCATCTTC 55
Query 445 CTGTTGGTGGTGGTCAGCTTTTTGTCCCTGTGTGTCATCCTGCCTGTCAACCTCTCAGGGGACTTGCTGGACAA 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 56 CTGTTGGTGGTGGTCAGCTTTTTGTCCCTGTGTGTCATCCTGCCTGTCAACCTCTCAGGGGACTTGCTGG---- 125
Query 519 AGACCCGTATAGTTTTGGGAGGACAACAATAGCAAACCTACAGACTGACAATGACCTCCTTTGGCTGCACACCA 592
||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 126 ------------------------------------------------CAATGACCTCCTTTGGCTGCACACCA 151
Query 593 TCTTTGCTGTCATTTACCTCTTCCTCACTGTGGGTTTCATGCGGCACCACACTCAGTCCATTAAGTACAAAGAG 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 152 TCTTTGCTGTCATTTACCTCTTCCTCACTGTGGGTTTCATGCGGCACCACACTCAGTCCATTAAGTACAAAGAG 225
Query 667 GAGAACCTGGTGAGGCGGACCCTGTTCATCACAGGACTCCCCAGAGATGCCAGGAAGGAGACTGTGGAGAGCCA 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 226 GAGAACCTGGTGAGGCGGACCCTGTTCATCACAGGACTCCCCAGAGATGCCAGGAAGGAGACTGTGGAGAGCCA 299
Query 741 CTTCCGGGACGCGTATCCCACGTGTGAGGTGGTTGATGTGCAGCTGTGCTACAACGTGGCCAAACTGATCTACC 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 300 CTTCCGGGACGCGTATCCCACGTGTGAGGTGGTTGATGTGCAGCTGTGCTACAACGTGGCCAAACTGATCTACC 373
Query 815 TGTGCAAGGAGAAAAAGAAGACTGAGAAGAGCCTGACCTATTACACAAACCTGCAGGTGAAGACAGGCCAGCGG 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 374 TGTGCAAGGAGAAAAAGAAGACTGAGAAGAGCCTGACCTATTACACAAACCTGCAGGTGAAGACAGGCCAGCGG 447
Query 889 ACCCTCATCAACCCCAAGCCCTGTGGCCAGTTTTGCTGCTGTGAAGTGCTGGGCTGTGAGTGGGAAGACGCCAT 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 448 ACCCTCATCAACCCCAAGCCCTGTGGCCAGTTTTGCTGCTGTGAAGTGCTGGGCTGTGAGTGGGAAGACGCCAT 521
Query 963 CTCTTACTACACACGGATGAAGGACAGGCTGCTGGAGAGGATCACAGAGGAAGAACGCCACGTCCAGGACCAGC 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 522 CTCTTACTACACACGGATGAAGGACAGGCTGCTGGAGAGGATCACAGAGGAAGAACGCCACGTCCAGGACCAGC 595
Query 1037 CCCTGGGAATGGCCTTCGTCACCTTCCAGGAGAAGTCCATGGCCACCTACATCCTGAAAGATTTCAATGCCTGC 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 596 CCCTGGGAATGGCCTTCGTCACCTTCCAGGAGAAGTCCATGGCCACCTACATCCTGAAAGATTTCAATGCCTGC 669
Query 1111 AAGTGTCAGAGCCTTCAGTGCAAAGGTGAGCCCCAGCCGTCCTCCCATAGCAGGGAGCTCTATACCTCCAAGTG 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 670 AAGTGTCAGAGCCTTCAGTGCAAAGGTGAGCCCCAGCCGTCCTCCCATAGCAGGGAGCTCTATACCTCCAAGTG 743
Query 1185 GACAGTCACCTTTGCTGCTGACCCTGAGGACATCTGCTGGAAGAACCTCTCTATCCAGGGCCTCCGCTGGTGGC 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 744 GACAGTCACCTTTGCTGCTGACCCTGAGGACATCTGCTGGAAGAACCTCTCTATCCAGGGCCTCCGCTGGTGGC 817
Query 1259 TACAGTGGCTGGGCATCAACTTCACCCTCTTCCTGGGGCTATTTTTCCTGACCACACCCTCCATCATCCTGTCC 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 818 TACAGTGGCTGGGCATCAACTTCACCCTCTTCCTGGGGCTATTTTTCCTGACCACACCCTCCATCATCCTGTCC 891
Query 1333 ACCATGGACAAGTTTAATGTCACCAAACCCATCCATGCGCTGAATAACCCGATCATCAGCCAGTTCTTCCCCAC 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 892 ACCATGGACAAGTTTAATGTCACCAAACCCATCCATGCGCTGAATAACCCGATCATCAGCCAGTTCTTCCCCAC 965
Query 1407 CCTCCTGCTCTGGTCCTTCTCGGCCCTGCTCCCCTCCATTGTCTACTACTCTACACTGCTGGAGTCTCACTGGA 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 966 CCTCCTGCTCTGGTCCTTCTCGGCCCTGCTCCCCTCCATTGTCTACTACTCTACACTGCTGGAGTCTCACTGGA 1039
Query 1481 CCAAGTCGGGGGAAAACCAGATCATGATGACCAAAGTCTACATATTCTTGATCTTCATGGTGCTGATCCTGCCC 1554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1040 CCAAGTCGGGGGAAAACCAGATCATGATGACCAAAGTCTACATATTCTTGATCTTCATGGTGCTGATCCTGCCC 1113
Query 1555 TCCCTGGGTCTCACCAGTCTAGATTTTTTCTTCCGGTGGCTCTTTGACAAAACTTCCTCGGAGGCCTCCATCAG 1628
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1114 TCCCTGGGTCTCACCAGTCTAGATTTTTTCTTCCGGTGGCTCTTTGACAAAACTTCCTCGGAGGCCTCCATCAG 1187
Query 1629 GTTGGAGTGCGTCTTCCTGCCTGACCAGGGTGCCTTCTTTGTGAACTATGTCATCGCCTCGGCCTTCATCGGCA 1702
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1188 GTTGGAGTGCGTCTTCCTGCCTGACCAGGGTGCCTTCTTTGTGAACTATGTCATCGCCTCGGCCTTCATCGGCA 1261
Query 1703 ATGGCATGGAGCTGCTGCGGCTGCCAGGTCTCATCCTCTATACCTTCCGCATGATCATGGCCAAGACGGCTGCT 1776
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1262 ATGGCATGGAGCTGCTGCGGCTGCCAGGTCTCATCCTCTATACCTTCCGCATGATCATGGCCAAGACGGCTGCT 1335
Query 1777 GACCGCAGGAATGTCAAGCAGAACCAGGCCTTCCAGTACGAGTTTGGAGCCATGTATGCATGGATGCTGTGTGT 1850
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1336 GACCGCAGGAATGTCAAGCAGAACCAGGCCTTCCAGTACGAGTTTGGAGCCATGTATGCATGGATGCTGTGTGT 1409
Query 1851 CTTCACTGTCATCGTGGCCTACAGCATCACTTGTCCCATCATCGCGCCATTTGGCCTCATCTACATCCTGCTCA 1924
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1410 CTTCACTGTCATCGTGGCCTACAGCATCACTTGTCCCATCATCGCGCCATTTGGCCTCATCTACATCCTGCTCA 1483
Query 1925 AGCACATGGTGGACCGGCACAACCTCTACTTCGTCTACCTCCCAGCCAAGCTGGAGAAGGGGATCCACTTTGCC 1998
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1484 AGCACATGGTGGACCGGCACAACCTCTACTTCGTCTACCTCCCAGCCAAGCTGGAGAAGGGGATCCACTTTGCC 1557
Query 1999 GCTGTGAACCAGGCCTTGGCAGCCCCCATCCTGTGCCTCTTCTGGCTCTACTTCTTTTCCTTCCTGCGCCTGGG 2072
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1558 GCTGTGAACCAGGCCTTGGCAGCCCCCATCCTGTGCCTCTTCTGGCTCTACTTCTTTTCCTTCCTGCGCCTGGG 1631
Query 2073 TATGAAGGCCCCCGCCACTCTGTTCACCTTCCTGGTGCTGCTGCTCACCATCCTGGTCTGCCTGGCTCACACCT 2146
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1632 TATGAAGGCCCCCGCCACTCTGTTCACCTTCCTGGTGCTGCTGCTCACCATCCTGGTCTGCCTGGCTCACACCT 1705
Query 2147 GCTTTGGATGCTTCAAGCACCTCAGCCCTCTGAACTACAAAACAGAAGAGCCTGCAAGTGACAAAGGAAGTGAG 2220
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1706 GCTTTGGATGCTTCAAGCACCTCAGCCCTCTGAACTACAAAACAGAAGAGCCTGCAAGTGACAAAGGAAGTGAG 1779
Query 2221 GCAGAGGCCCACATGCCCCCACCGTTCACACCCTACGTGCCTCGGATTCTGAACGGCTTGGCCTCGGAGAGGAC 2294
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1780 GCAGAGGCCCACATGCCCCCACCGTTCACACCCTACGTGCCTCGGATTCTGAACGGCTTGGCCTCGGAGAGGAC 1853
Query 2295 AGCACTGTCTCCGCAGCAGCAGCAGCAGCAGACCTATGGTGCCATCCACAACATCAGCGGGACTATCCCTGGAC 2368
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1854 AGCACTGTCTCCGCAGCAGCAGCAGCAGCAGACCTATGGTGCCATCCACAACATCAGCGGGACTATCCCTGGAC 1927
Query 2369 AGTGCTTGGCGCAGAGCGCCACGGGCAGTGTGGCTGCTGCCCCCCAGGAGGCC 2421
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1928 AGTGCTTGGCGCAGAGCGCCACGGGCAGTGTGGCTGCTGCCCCCCAGGAGGCC 1980