Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_02236
• Subject: XM_006537945.2
• Aligned Length: 1578
• Identities: 1407
• Gaps: 0

Alignment

Query    1  ATGGACGTAAGATTTTATCCACCTCCAGCCCAGCCCGCCGCTGCGCCCGACGCTCCCTGTCTGGGACCTTCTCC  74
            ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||.||||||.|||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGACGTAAGATTTTATCCTCCTCCAGCCCAGCCCGCTGCTGCGCCCGCCGCTCCTTGTCTGGGACCTTCTCC  74

Query   75  CTGCCTGGACCCCTACTATTGCAACAAGTTTGACGGTGAGAACATGTATATGAGCATGACAGAGCCGAGCCAGG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CTGCCTGGACCCCTACTATTGCAACAAGTTTGACGGGGAGAACATGTATATGAGCATGACAGAGCCGAGCCAGG  148

Query  149  ACTATGTGCCAGCCAGCCAGTCCTACCCTGGTCCAAGCCTGGAAAGTGAAGACTTCAACATTCCACCAATTACT  222
            |||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||.|||||.|||||.||.||.
Sbjct  149  ACTATGTGCCAGCCAGCCAGTCCTACCCTGGACCAAGTCTGGAAAGTGAAGATTTTAACATCCCACCCATCACG  222

Query  223  CCTCCTTCCCTCCCAGACCACTCGCTGGTGCACCTGAATGAAGTTGAGTCTGGTTACCATTCTCTGTGTCACCC  296
            |||||.||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.||.||.||.||||||||.||||||||||||||
Sbjct  223  CCTCCCTCCCTCCCTGACCACTCTCTGGTGCACCTGAATGAGGTAGAATCCGGTTACCACTCTCTGTGTCACCC  296

Query  297  CATGAACCATAATGGCCTGCTACCATTTCATCCACAAAACATGGACCTCCCTGAAATCACAGTCTCCAATATGC  370
            ||||||.||.|||||||||||.||.||.||||||||||.|||||||||.||.||.|||||.||.|||||.||||
Sbjct  297  CATGAATCACAATGGCCTGCTCCCGTTCCATCCACAAACCATGGACCTGCCAGAGATCACGGTGTCCAACATGC  370

Query  371  TGGGCCAGGATGGAACACTGCTTTCTAATTCCATTTCTGTGATGCCAGATATACGAAACCCAGAAGGAACTCAG  444
            |||||||.|||||..|||||||.||.||||||||.||||||||||.|||.||..|.|||.||||||||.|||||
Sbjct  371  TGGGCCAAGATGGCGCACTGCTCTCCAATTCCATCTCTGTGATGCAAGAGATTGGGAACGCAGAAGGAGCTCAG  444

Query  445  TACAGTTCCCATCCTCAGATGGCAGCCATGAGACCAAGGGGCCAGCCTGCAGACATCAGGCAGCAGCCAGGAAT  518
            |||||.||||||||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||.||||||||||.||||||.||.|.||
Sbjct  445  TACAGCTCCCATCCTCAGATGGCAGCCATGAGGCCGAGAGGCCAGCCTACAGACATCAGACAGCAGGCAAGCAT  518

Query  519  GATGCCACATGGCCAGCTGACTACCATTAACCAGTCACAGCTAAGTGCTCAACTTGGTTTGAATATGGGAGGAA  592
            |||||..|..|||||||||||.|||||.||||||||.|||||.||.||.||..|.||.|||||.||||||||||
Sbjct  519  GATGCAGCCCGGCCAGCTGACCACCATCAACCAGTCGCAGCTGAGCGCACAGTTGGGCTTGAACATGGGAGGAA  592

Query  593  GCAATGTTCCCCACAACTCACCATCTCCACCTGGAAGCAAGTCTGCAACTCCTTCACCATCCAGTTCAGTGCAT  666
            .||||||..||||||||||.||.||||||||.||.||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||||||
Sbjct  593  CCAATGTGGCCCACAACTCCCCTTCTCCACCCGGGAGCAAGTCTGCAACCCCTTCCCCATCCAGCTCAGTGCAT  666

Query  667  GAAGATGAAGGCGATGATACCTCTAAGATCAATGGTGGAGAGAAGCGGCCTGCCTCTGATATGGGGAAAAAACC  740
            ||.|||||..|.||.|||.||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GAGGATGAGTGTGAGGATGCCTCCAAGATCAATGGAGGAGAGAAGCGGCCTGCCTCTGATATGGGGAAAAAACC  740

Query  741  AAAAACTCCCAAAAAGAAGAAGAAGAAGGATCCCAATGAGCCCCAGAAGCCTGTGTCTGCCTATGCGTTATTCT  814
            .|||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||
Sbjct  741  CAAAACTCCCAAGAAGAAGAAGAAGAAGGATCCTAATGAGCCCCAGAAGCCTGTGTCTGCCTATGCTTTGTTCT  814

Query  815  TTCGTGATACTCAGGCCGCCATCAAGGGCCAAAATCCAAACGCTACCTTTGGCGAAGTCTCTAAAATTGTGGCT  888
            ||||||||||.|||||.|||||.||||||||.||||||||.|||||.|||||.|||||.||.||.||||||||.
Sbjct  815  TTCGTGATACCCAGGCTGCCATTAAGGGCCAGAATCCAAATGCTACTTTTGGTGAAGTATCGAAGATTGTGGCA  888

Query  889  TCAATGTGGGACGGTTTAGGAGAAGAGCAAAAACAGGTCTATAAAAAGAAAACCGAGGCTGCGAAGAAGGAGTA  962
            |||||||||||.||..||||||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.||
Sbjct  889  TCAATGTGGGATGGCCTAGGAGAAGAACAGAAACAGGTCTATAAGAAGAAAACCGAGGCTGCAAAGAAGGAATA  962

Query  963  CCTGAAGCAACTCGCAGCATACAGAGCCAGCCTTGTATCCAAGAGCTACAGTGAACCTGTTGACGTGAAGACAT  1036
            |||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||.||||||||.||.|||||||
Sbjct  963  CCTGAAGCAGCTAGCAGCATACAGAGCCAGCCTTGTATCCAAGAGCTACACTGATCCTGTTGATGTTAAGACAT  1036

Query 1037  CTCAACCTCCTCAGCTGATCAATTCGAAGCCGTCGGTGTTCCATGGGCCCAGCCAGGCCCACTCGGCCCTGTAC  1110
            ||||.||.||.||||||.||||.||.||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||.||.||||||
Sbjct 1037  CTCAGCCACCCCAGCTGGTCAACTCAAAGCCGTCAGTATTCCATGGGCCCAGCCAGGCCCACTCAGCTCTGTAC  1110

Query 1111  CTAAGTTCCCACTATCACCAACAACCGGGAATGAATCCTCACCTAACTGCCATGCATCCTAGTCTCCCCAGGAA  1184
            ||||||||.|||||||||||||||||.|||||||.||||||.||.||.|||||||||||.||.||||||||.||
Sbjct 1111  CTAAGTTCTCACTATCACCAACAACCAGGAATGACTCCTCAGCTCACCGCCATGCATCCGAGCCTCCCCAGAAA  1184

Query 1185  CATAGCCCCCAAGCCGAATAACCAAATGCCAGTGACTGTCTCTATAGCAAACATGGCTGTGTCCCCTCCTCCTC  1258
            ||||||.||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||.||.|
Sbjct 1185  CATAGCACCTAAGCCCAATAACCAAATGCCAGTGACTGTCTCCATAGCCAACATGGCTGTGTCCCCACCACCGC  1258

Query 1259  CCCTCCAGATCAGCCCGCCTCTTCACCAGCATCTCAACATGCAGCAGCACCAGCCGCTCACCATGCAGCAGCCC  1332
            ||||.|||||||||||.||||||||.||||||||||.||||||||||||.|||.||||..||||||||||||||
Sbjct 1259  CCCTTCAGATCAGCCCACCTCTTCATCAGCATCTCAGCATGCAGCAGCATCAGTCGCTTGCCATGCAGCAGCCC  1332

Query 1333  CTTGGGAACCAGCTCCCCATGCAGGTCCAGTCTGCCTTACACTCACCCACCATGCAGCAAGGATTTACTCTTCA  1406
            |||||||..|||||||||||||||||||||.|||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  CTTGGGAGTCAGCTCCCCATGCAGGTCCAGACTGCCTTACACTCGCCCACCATGCAGCAAGGATTTACTCTTCA  1406

Query 1407  ACCCGACTATCAGACTATTATCAATCCTACATCTACAGCTGCACAAGTTGTCACCCAGGCAATGGAGTATGTGC  1480
            ||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||||
Sbjct 1407  ACCCGACTATCAGACTATTATCAACCCTACATCTACAGCTGCACAAGTTGTCACCCAAGCGATGGAGTACGTGC  1480

Query 1481  GTTCGGGGTGCAGAAATCCTCCCCCACAACCGGTGGACTGGAATAACGACTACTGCAGTAGTGGGGGCATGCAG  1554
            ||||.||||||||||||||.||||||||.||.||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  GTTCTGGGTGCAGAAATCCGCCCCCACAGCCCGTGGACTGGAGTACCGACTACTGCAGTAGTGGGGGCATGCAG  1554

Query 1555  AGGGACAAAGCACTGTACCTTACT  1578
            |||||||||||.|||||.||.||.
Sbjct 1555  AGGGACAAAGCGCTGTATCTCACC  1578