Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_02236
• Subject: XM_017014085.1
• Aligned Length: 1578
• Identities: 1512
• Gaps: 66

Alignment

Query    1  ATGGACGTAAGATTTTATCCACCTCCAGCCCAGCCCGCCGCTGCGCCCGACGCTCCCTGTCTGGGACCTTCTCC  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGACGTAAGATTTTATCCACCTCCAGCCCAGCCCGCCGCTGCGCCCGACGCTCCCTGTCTGGGACCTTCTCC  74

Query   75  CTGCCTGGACCCCTACTATTGCAACAAGTTTGACGGTGAGAACATGTATATGAGCATGACAGAGCCGAGCCAGG  148
            ||||||||||||||||||||||||||                                                
Sbjct   75  CTGCCTGGACCCCTACTATTGCAACA------------------------------------------------  100

Query  149  ACTATGTGCCAGCCAGCCAGTCCTACCCTGGTCCAAGCCTGGAAAGTGAAGACTTCAACATTCCACCAATTACT  222
                              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  101  ------------------AGTCCTACCCTGGTCCAAGCCTGGAAAGTGAAGACTTCAACATTCCACCAATTACT  156

Query  223  CCTCCTTCCCTCCCAGACCACTCGCTGGTGCACCTGAATGAAGTTGAGTCTGGTTACCATTCTCTGTGTCACCC  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  157  CCTCCTTCCCTCCCAGACCACTCGCTGGTGCACCTGAATGAAGTTGAGTCTGGTTACCATTCTCTGTGTCACCC  230

Query  297  CATGAACCATAATGGCCTGCTACCATTTCATCCACAAAACATGGACCTCCCTGAAATCACAGTCTCCAATATGC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  231  CATGAACCATAATGGCCTGCTACCATTTCATCCACAAAACATGGACCTCCCTGAAATCACAGTCTCCAATATGC  304

Query  371  TGGGCCAGGATGGAACACTGCTTTCTAATTCCATTTCTGTGATGCCAGATATACGAAACCCAGAAGGAACTCAG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  305  TGGGCCAGGATGGAACACTGCTTTCTAATTCCATTTCTGTGATGCCAGATATACGAAACCCAGAAGGAACTCAG  378

Query  445  TACAGTTCCCATCCTCAGATGGCAGCCATGAGACCAAGGGGCCAGCCTGCAGACATCAGGCAGCAGCCAGGAAT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  379  TACAGTTCCCATCCTCAGATGGCAGCCATGAGACCAAGGGGCCAGCCTGCAGACATCAGGCAGCAGCCAGGAAT  452

Query  519  GATGCCACATGGCCAGCTGACTACCATTAACCAGTCACAGCTAAGTGCTCAACTTGGTTTGAATATGGGAGGAA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  453  GATGCCACATGGCCAGCTGACTACCATTAACCAGTCACAGCTAAGTGCTCAACTTGGTTTGAATATGGGAGGAA  526

Query  593  GCAATGTTCCCCACAACTCACCATCTCCACCTGGAAGCAAGTCTGCAACTCCTTCACCATCCAGTTCAGTGCAT  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  527  GCAATGTTCCCCACAACTCACCATCTCCACCTGGAAGCAAGTCTGCAACTCCTTCACCATCCAGTTCAGTGCAT  600

Query  667  GAAGATGAAGGCGATGATACCTCTAAGATCAATGGTGGAGAGAAGCGGCCTGCCTCTGATATGGGGAAAAAACC  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  601  GAAGATGAAGGCGATGATACCTCTAAGATCAATGGTGGAGAGAAGCGGCCTGCCTCTGATATGGGGAAAAAACC  674

Query  741  AAAAACTCCCAAAAAGAAGAAGAAGAAGGATCCCAATGAGCCCCAGAAGCCTGTGTCTGCCTATGCGTTATTCT  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  675  AAAAACTCCCAAAAAGAAGAAGAAGAAGGATCCCAATGAGCCCCAGAAGCCTGTGTCTGCCTATGCGTTATTCT  748

Query  815  TTCGTGATACTCAGGCCGCCATCAAGGGCCAAAATCCAAACGCTACCTTTGGCGAAGTCTCTAAAATTGTGGCT  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  749  TTCGTGATACTCAGGCCGCCATCAAGGGCCAAAATCCAAACGCTACCTTTGGCGAAGTCTCTAAAATTGTGGCT  822

Query  889  TCAATGTGGGACGGTTTAGGAGAAGAGCAAAAACAGGTCTATAAAAAGAAAACCGAGGCTGCGAAGAAGGAGTA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  823  TCAATGTGGGACGGTTTAGGAGAAGAGCAAAAACAGGTCTATAAAAAGAAAACCGAGGCTGCGAAGAAGGAGTA  896

Query  963  CCTGAAGCAACTCGCAGCATACAGAGCCAGCCTTGTATCCAAGAGCTACAGTGAACCTGTTGACGTGAAGACAT  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  897  CCTGAAGCAACTCGCAGCATACAGAGCCAGCCTTGTATCCAAGAGCTACAGTGAACCTGTTGACGTGAAGACAT  970

Query 1037  CTCAACCTCCTCAGCTGATCAATTCGAAGCCGTCGGTGTTCCATGGGCCCAGCCAGGCCCACTCGGCCCTGTAC  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  971  CTCAACCTCCTCAGCTGATCAATTCGAAGCCGTCGGTGTTCCATGGGCCCAGCCAGGCCCACTCGGCCCTGTAC  1044

Query 1111  CTAAGTTCCCACTATCACCAACAACCGGGAATGAATCCTCACCTAACTGCCATGCATCCTAGTCTCCCCAGGAA  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1045  CTAAGTTCCCACTATCACCAACAACCGGGAATGAATCCTCACCTAACTGCCATGCATCCTAGTCTCCCCAGGAA  1118

Query 1185  CATAGCCCCCAAGCCGAATAACCAAATGCCAGTGACTGTCTCTATAGCAAACATGGCTGTGTCCCCTCCTCCTC  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1119  CATAGCCCCCAAGCCGAATAACCAAATGCCAGTGACTGTCTCTATAGCAAACATGGCTGTGTCCCCTCCTCCTC  1192

Query 1259  CCCTCCAGATCAGCCCGCCTCTTCACCAGCATCTCAACATGCAGCAGCACCAGCCGCTCACCATGCAGCAGCCC  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1193  CCCTCCAGATCAGCCCGCCTCTTCACCAGCATCTCAACATGCAGCAGCACCAGCCGCTCACCATGCAGCAGCCC  1266

Query 1333  CTTGGGAACCAGCTCCCCATGCAGGTCCAGTCTGCCTTACACTCACCCACCATGCAGCAAGGATTTACTCTTCA  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1267  CTTGGGAACCAGCTCCCCATGCAGGTCCAGTCTGCCTTACACTCACCCACCATGCAGCAAGGATTTACTCTTCA  1340

Query 1407  ACCCGACTATCAGACTATTATCAATCCTACATCTACAGCTGCACAAGTTGTCACCCAGGCAATGGAGTATGTGC  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1341  ACCCGACTATCAGACTATTATCAATCCTACATCTACAGCTGCACAAGTTGTCACCCAGGCAATGGAGTATGTGC  1414

Query 1481  GTTCGGGGTGCAGAAATCCTCCCCCACAACCGGTGGACTGGAATAACGACTACTGCAGTAGTGGGGGCATGCAG  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1415  GTTCGGGGTGCAGAAATCCTCCCCCACAACCGGTGGACTGGAATAACGACTACTGCAGTAGTGGGGGCATGCAG  1488

Query 1555  AGGGACAAAGCACTGTACCTTACT  1578
            ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1489  AGGGACAAAGCACTGTACCTTACT  1512