Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_02236
• Subject: XM_017320230.1
• Aligned Length: 1578
• Identities: 1295
• Gaps: 117

Alignment

Query    1  ATGGACGTAAGATTTTATCCACCTCCAGCCCAGCCCGCCGCTGCGCCCGACGCTCCCTGTCTGGGACCTTCTCC  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  CTGCCTGGACCCCTACTATTGCAACAAGTTTGACGGTGAGAACATGTATATGAGCATGACAGAGCCGAGCCAGG  148
                                                       |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  -------------------------------------------ATGTATATGAGCATGACAGAGCCGAGCCAGG  31

Query  149  ACTATGTGCCAGCCAGCCAGTCCTACCCTGGTCCAAGCCTGGAAAGTGAAGACTTCAACATTCCACCAATTACT  222
            |||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||.|||||.|||||.||.||.
Sbjct   32  ACTATGTGCCAGCCAGCCAGTCCTACCCTGGACCAAGTCTGGAAAGTGAAGATTTTAACATCCCACCCATCACG  105

Query  223  CCTCCTTCCCTCCCAGACCACTCGCTGGTGCACCTGAATGAAGTTGAGTCTGGTTACCATTCTCTGTGTCACCC  296
            |||||.||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.||.||.||.||||||||.||||||||||||||
Sbjct  106  CCTCCCTCCCTCCCTGACCACTCTCTGGTGCACCTGAATGAGGTAGAATCCGGTTACCACTCTCTGTGTCACCC  179

Query  297  CATGAACCATAATGGCCTGCTACCATTTCATCCACAAAACATGGACCTCCCTGAAATCACAGTCTCCAATATGC  370
            ||||||.||.|||||||||||.||.||.||||||||||.|||||||||.||.||.|||||.||.|||||.||||
Sbjct  180  CATGAATCACAATGGCCTGCTCCCGTTCCATCCACAAACCATGGACCTGCCAGAGATCACGGTGTCCAACATGC  253

Query  371  TGGGCCAGGATGGAACACTGCTTTCTAATTCCATTTCTGTGATGCCAGATATACGAAACCCAGAAGGAACTCAG  444
            |||||||.|||||..|||||||.||.||||||||.||||||||||.|||.||..|.|||.||||||||.|||||
Sbjct  254  TGGGCCAAGATGGCGCACTGCTCTCCAATTCCATCTCTGTGATGCAAGAGATTGGGAACGCAGAAGGAGCTCAG  327

Query  445  TACAGTTCCCATCCTCAGATGGCAGCCATGAGACCAAGGGGCCAGCCTGCAGACATCAGGCAGCAGCCAGGAAT  518
            |||||.||||||||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||.||||||||||.||||||.||.|.||
Sbjct  328  TACAGCTCCCATCCTCAGATGGCAGCCATGAGGCCGAGAGGCCAGCCTACAGACATCAGACAGCAGGCAAGCAT  401

Query  519  GATGCCACATGGCCAGCTGACTACCATTAACCAGTCACAGCTAAGTGCTCAACTTGGTTTGAATATGGGAGGAA  592
            |||||..|..|||||||||||.|||||.||||||||.|||||.||.||.||..|.||.|||||.||||||||||
Sbjct  402  GATGCAGCCCGGCCAGCTGACCACCATCAACCAGTCGCAGCTGAGCGCACAGTTGGGCTTGAACATGGGAGGAA  475

Query  593  GCAATGTTCCCCACAACTCACCATCTCCACCTGGAAGCAAGTCTGCAACTCCTTCACCATCCAGTTCAGTGCAT  666
            .||||||..||||||||||.||.||||||||.||.||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||||||
Sbjct  476  CCAATGTGGCCCACAACTCCCCTTCTCCACCCGGGAGCAAGTCTGCAACCCCTTCCCCATCCAGCTCAGTGCAT  549

Query  667  GAAGATGAAGGCGATGATACCTCTAAGATCAATGGTGGAGAGAAGCGGCCTGCCTCTGATATGGGGAAAAAACC  740
            ||.|||||..|.||.|||.||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  550  GAGGATGAGTGTGAGGATGCCTCCAAGATCAATGGAGGAGAGAAGCGGCCTGCCTCTGATATGGGGAAAAAACC  623

Query  741  AAAAACTCCCAAAAAGAAGAAGAAGAAGGATCCCAATGAGCCCCAGAAGCCTGTGTCTGCCTATGCGTTATTCT  814
            .|||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||
Sbjct  624  CAAAACTCCCAAGAAGAAGAAGAAGAAGGATCCTAATGAGCCCCAGAAGCCTGTGTCTGCCTATGCTTTGTTCT  697

Query  815  TTCGTGATACTCAGGCCGCCATCAAGGGCCAAAATCCAAACGCTACCTTTGGCGAAGTCTCTAAAATTGTGGCT  888
            ||||||||||.|||||.|||||.||||||||.||||||||.|||||.|||||.|||||.||.||.||||||||.
Sbjct  698  TTCGTGATACCCAGGCTGCCATTAAGGGCCAGAATCCAAATGCTACTTTTGGTGAAGTATCGAAGATTGTGGCA  771

Query  889  TCAATGTGGGACGGTTTAGGAGAAGAGCAAAAACAGGTCTATAAAAAGAAAACCGAGGCTGCGAAGAAGGAGTA  962
            |||||||||||.||..||||||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.||
Sbjct  772  TCAATGTGGGATGGCCTAGGAGAAGAACAGAAACAGGTCTATAAGAAGAAAACCGAGGCTGCAAAGAAGGAATA  845

Query  963  CCTGAAGCAACTCGCAGCATACAGAGCCAGCCTTGTATCCAAGAGCTACAGTGAACCTGTTGACGTGAAGACAT  1036
            |||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||.||||||||.||.|||||||
Sbjct  846  CCTGAAGCAGCTAGCAGCATACAGAGCCAGCCTTGTATCCAAGAGCTACACTGATCCTGTTGATGTTAAGACAT  919

Query 1037  CTCAACCTCCTCAGCTGATCAATTCGAAGCCGTCGGTGTTCCATGGGCCCAGCCAGGCCCACTCGGCCCTGTAC  1110
            ||||.||.||.||||||.||||.||.||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||.||.||||||
Sbjct  920  CTCAGCCACCCCAGCTGGTCAACTCAAAGCCGTCAGTATTCCATGGGCCCAGCCAGGCCCACTCAGCTCTGTAC  993

Query 1111  CTAAGTTCCCACTATCACCAACAACCGGGAATGAATCCTCACCTAACTGCCATGCATCCTAGTCTCCCCAGGAA  1184
            ||||||||.|||||||||||||||||.|||||||.||||||.||.||.|||||||||||.||.||||||||.||
Sbjct  994  CTAAGTTCTCACTATCACCAACAACCAGGAATGACTCCTCAGCTCACCGCCATGCATCCGAGCCTCCCCAGAAA  1067

Query 1185  CATAGCCCCCAAGCCGAATAACCAAATGCCAGTGACTGTCTCTATAGCAAACATGGCTGTGTCCCCTCCTCCTC  1258
            ||||||.||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||.||.|
Sbjct 1068  CATAGCACCTAAGCCCAATAACCAAATGCCAGTGACTGTCTCCATAGCCAACATGGCTGTGTCCCCACCACCGC  1141

Query 1259  CCCTCCAGATCAGCCCGCCTCTTCACCAGCATCTCAACATGCAGCAGCACCAGCCGCTCACCATGCAGCAGCCC  1332
            ||||.|||||||||||.||||||||.||||||||||.||||||||||||.|||.||||..||||||||||||||
Sbjct 1142  CCCTTCAGATCAGCCCACCTCTTCATCAGCATCTCAGCATGCAGCAGCATCAGTCGCTTGCCATGCAGCAGCCC  1215

Query 1333  CTTGGGAACCAGCTCCCCATGCAGGTCCAGTCTGCCTTACACTCACCCACCATGCAGCAAGGATTTACTCTTCA  1406
            |||||||..|||||||||||||||||||||.|||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1216  CTTGGGAGTCAGCTCCCCATGCAGGTCCAGACTGCCTTACACTCGCCCACCATGCAGCAAGGATTTACTCTTCA  1289

Query 1407  ACCCGACTATCAGACTATTATCAATCCTACATCTACAGCTGCACAAGTTGTCACCCAGGCAATGGAGTATGTGC  1480
            ||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||||
Sbjct 1290  ACCCGACTATCAGACTATTATCAACCCTACATCTACAGCTGCACAAGTTGTCACCCAAGCGATGGAGTACGTGC  1363

Query 1481  GTTCGGGGTGCAGAAATCCTCCCCCACAACCGGTGGACTGGAATAACGACTACTGCAGTAGTGGGGGCATGCAG  1554
            ||||.||||||||||||||.||||||||.||.||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1364  GTTCTGGGTGCAGAAATCCGCCCCCACAGCCCGTGGACTGGAGTACCGACTACTGCAGTAGTGGGGGCATGCAG  1437

Query 1555  AGGGACAAAGCACTGTACCTTACT  1578
            |||||||||||.|||||.||.||.
Sbjct 1438  AGGGACAAAGCGCTGTATCTCACC  1461