Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_02263
- Subject:
- NM_001355457.2
- Aligned Length:
- 2433
- Identities:
- 2345
- Gaps:
- 21
Alignment
Query 1 ATGCCTAATCAAGGAGAAGACTGCTATTTTTTTTTCTATTCCACATGTACCAAAGGCGACAGCTGCCCATTCCG 74
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGCCTAATCAAGGAGAAGACTGCTATTTTTTTTTCTATTCTACATGTACCAAAGGTGACAGCTGCCCATTCCG 74
Query 75 TCACTGTGAAGCTGCAATAGGAAATGAAACTGTTTGCACATTATGGCAAGAAGGGCGCTGTTTTCGACAGGTGT 148
||||||||||||||||.||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 75 TCACTGTGAAGCTGCACTAGGCAATGAAACTGTTTGCACATTATGGCAAGAAGGGCGCTGTTTTCGACGGGTGT 148
Query 149 GCAGGTTTCGGCACATGGAGATTGATAAAAAACGCAGTGAAATTCCTTGTTATTGGGAAAATCAGCCAACAGGA 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 GCAGGTTTCGGCACATGGAGATTGATAAAAAACGCAGTGAAATTCCTTGTTATTGGGAAAATCAGCCAACAGGA 222
Query 223 TGTCAAAAATTAAACTGCGCTTTCCATCACAATAGAGGACGATATGTTGATGGCCTTTTCCTACCTCCGAGCAA 296
|||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 TGTCAAAAATTAAACTGCGTTTTCCATCACAATAGAGGACGATATGTTGATGGCCTTTTCCTACCTCCGAGCAA 296
Query 297 AACTGTGTTGCCCACTGTGCCTGAGTCACCAGAAGAGGAAGTGAAGGCTAGCCAACTTTCAGTTCAGCAGAACA 370
||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 AAGTGTGTTGCCCACTGTGCCTGAGTCACCAGAAGAGGAAGTGAAGGCTAGCCAACTTTCAGTTCAGCAGAACA 370
Query 371 AATTGTCTGTCCAGTCCAATCCTTCCCCTCAGCTGCGGAGCGTTATGAAAGTAGAAAGTTCCGAAAATGTTCCT 444
||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 AATTGTCTGTCCAGTCCAATACTTCCCCTCAGCTGCGGAGCGTTATGAAAGTAGAAAGTTCCGAAAATGTTCCT 444
Query 445 AGCCCCACGCATCCACCAGTTGTAATTAATGCTGCAGATGATGATGAAGATGATGATGATCAGTTTTCTGAGGA 518
|||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 AGCCCCAAGCATCCACCAGTTGTAATTAATGCTGCAGATGATGATGAAGATGATGATGATCAGTTTTCTGAGGA 518
Query 519 AGGTGATGAAACCAAAACACCTACCCTGCAACCAACTCCTGAAGTTCACAATGGATTACGAGTGACTTCTGTCC 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 AGGTGATGAAACCAAAACACCTACCCTGCAACCAACTCCTGAAGTTCACAATGGATTACGAGTGACTTCTGTCC 592
Query 593 GGAAACCTGCAGTCAATATAAAGCAAGGTGAATGTTTGAATTTTGGAATAAAAACTCTTGAGGAAATTAAGTCA 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 GGAAACCTGCAGTCAATATAAAGCAAGGTGAATGTTTGCATTTTGGAATAAAAACTCTTGAGGAAATTAAGTCA 666
Query 667 AAGAAAATGAAGGAAAAATCTAAGAAGCAAGGTGAGGGTTCTTCAGGAGTTTCCAGTCTTTTACTCCACCCTGA 740
|||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 AAGAAAATGAAGGAAAAATCTGAGGAGCAAGGTGAGGGTTCTTCAGGAGTTTCCAGTCTTTTACTCCACCCTGA 740
Query 741 GCCCGTTCCAGGTCCTGAAAAAGAAAATGTCAGGACTGTGGTGAGGACAGTAACTCTCTCCACCAAACAAGGAG 814
|||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 GCCTGTTCCAGGTCCTGAAAAAGAAAATGTCAGGACTGTGGTGAGGACAGTAACTCTCTCCACCAAACAAGGAG 814
Query 815 AAGAACCCTTGGTTAGATTGAGTCTTACTGAGAGACTGGGGAAACGAAAATTTTCAGCAGGCGGTGACAGTGAT 888
||||||||||||||||||||.|.||||||||||.|||||||||||||||||||||..|||||||||||||||||
Sbjct 815 AAGAACCCTTGGTTAGATTGGGCCTTACTGAGACACTGGGGAAACGAAAATTTTCGACAGGCGGTGACAGTGAT 888
Query 889 CCTCCATTAAAGCGTAGCCTGGCACAGAGGCTAGGGAAGAAAGTTGAAGCTCCAGAAACTAACATTGACAAAAC 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||.||||
Sbjct 889 CCTCCATTAAAGCGTAGCCTGGCACAGAGGCTAGGGAAGAAAGTTGAAGCTCCAGAAACTAACACTGACGAAAC 962
Query 963 ACCAAAGAAAGCTCAAGTTTCCAAGTCTCTTAAGGAGCGATTAGGCATGTCAGCTGATCCAGATAATGAGGATG 1036
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||.|
Sbjct 963 ACCAAAGAAAGCTCAAGTTTCCAAGTCTCTTAAGGAGCGATTAGGCATGTCAGCTGATCCAAATAATGAGGACG 1036
Query 1037 CAACAGATAAAGTTAATAAAGTTGGTGAGATCCATGTGAAGACATTAGAAGAAATTCTTCTTGAAAGAGCCAGT 1110
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct 1037 CAACAGATAAAGTTAATAAAGTTGGTGAGATCCATGTGAAGACATTAGAAGAAATGCTTCTTGAAAGAGCCAGT 1110
Query 1111 CAGAAACGTGGAGAATTGCAAACTAAACTCAAGACAGAAGGACCTTCAAAAACTGATGATTCTACTTCAGGAGC 1184
|||||||.|||.||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 CAGAAACATGGGGAATCGCAAACTAAACTCAAGACAGAAGGACCTTCAAAAACTGATGATTCTACTTCAGGAGC 1184
Query 1185 AAGAAGCTCCTCCACTATCCGTATCAAAACCTTCTCTGAGGTCCTGGCTGAAAAAAAACATCGGCAGCAGGAAG 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||||||||||||
Sbjct 1185 AAGAAGCTCCTCCACTATCCGTATCAAAACCTTCTCTGAGGTCCTGGCTGAAGAAGAACATAGGCAGCAGGAAG 1258
Query 1259 CAGAGAGACAAAAAAGCAAAAAGGATACAACTTGCATCAAGCTAAAGATTGATAGTGAAATTAAAAAAACAGTA 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 CAGAGAGACAAAAAAGCAAAAAGGATACAACTTGCATCAAGCTAAAGACTGATAGTGAAATTAAAAAAACAGTA 1332
Query 1333 GTTTTGCCACCCATTGTTGCCAGCAGAGGACAATCAGAGGAGCCTGCAGGTAAAACAAAGTCTATGCAGGAGGT 1406
|||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 1333 GTTTTGCCACCCATTGTTGCCAGCAAAGGACAATCAGAGGAGCCTGCAGGTAAAACAAAGTCCATGCAGGAGGT 1406
Query 1407 GCACATCAAGACGCTGGAAGAAATTAAACTGGAGAAGGCACTGAGGGTGCAGCAGAGCTCTGAGAGCAGCACCA 1480
||||||.||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 GCACATGAAGACGGTGGAAGAAATTAAACTGGAGAAGGCACTGAGGGTGCAGCAGAGCTCTGAGAGCAGCACCA 1480
Query 1481 GCTCCCCGTCTCAACACGAGGCCACTCCAGGGGCAAGGCGGCTGCTGCGAATCACCAAAAGAACAGGGATGAAA 1554
||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||..|||||||||||||||||||||||||.|||.||||
Sbjct 1481 GCTCCCCGTCTCAACATGAGGCCACTCCAGGGGCAAGGTTGCTGCTGCGAATCACCAAAAGAACATGGAGGAAA 1554
Query 1555 GAAGAGAAGAACCTTCAGGAAGGAAATGAAGTTGATTCTCAGAGCAGTATTAGAACAGAAGCTAAAGAGGCTTC 1628
|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||.||.||||.||.||||||..|||||||.|||||||||
Sbjct 1555 GAAGAGAAGAAACTTCAGGAAGGAAATGAAGTTGATTTTCTGAGCCGTGTTAGAATGGAAGCTACAGAGGCTTC 1628
Query 1629 AGGTGAGACCACAGGAGTTGACATCACTAAAATTCAAGTCAAGAGATGTGAGACCATGAGAGAGAAGCACATGC 1702
||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.|||||
Sbjct 1629 AGTTGAGACCACAGGAGTTGACATCACTAAAATTCAAGTCAAGAGATGTGAGATCATGAGAGAGACGCGCATGC 1702
Query 1703 AGAAACAGCAGGAGAGGGAAAAATCAGTCTTGACACCTCTTCGGGGAGATGTAGCCTCTTGCAATACCCAAGTG 1776
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 AGAAACAGCAGGAGAGGGAAAAATCAGTCTTGACACCTCTTCAGGGAGATGTAGCCTCTTGCAATACCCAAGTG 1776
Query 1777 GCAGAGAAACCAGTGCTCACTGCTGTGCCAGGAATCACACGGCACCTGACCAAGCGGCTTCCCACAAAGTCATC 1850
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct 1777 GCAGAGAAACCAGTGCTCACTGCTGTGCCAGGAATCACATGGCACCTGACCAAGCAGCTTCCCACAAAGTCATC 1850
Query 1851 CCAGAAGGTGGAGGTAGAAACCTCAGGGATTGGAGACTCATTATTGAATGTGAAATGTGCAGCACAGACCTTGG 1924
||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||..|||||||||||||||
Sbjct 1851 CCAGAAGGTGGAGGTAGAAACCTCAGGGATTGCAGACTCATTATTGAATGTGAAATGGTCAGCACAGACCTTGG 1924
Query 1925 AAAAAAGGGGTAAAGCTAAACCCAAAGTGAACGTGAAGCCATCTGTGGTTAAAGTTGTGTCATCCCCCAAATTG 1998
|||||||||||.||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925 AAAAAAGGGGTGAAGCTAAACCCACAGTGAACGTGAAGCAATCTGTGGTTAAAGTTGTGTCATCCCCCAAATTG 1998
Query 1999 GCCCCAAAACGTAAGGCAGTGGAGATGCACGCTGCTGTCATTGCCGCTGTGAAGCCACTCAGCTCCAGCAGTGT 2072
||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 1999 GCCCCAAAACGTAAGGCAGTGGAGATGCACCCTGCTGTCACTGCCGCTGTGAAGCCACTCAGCTCCAGCAGCGT 2072
Query 2073 CCTACAGGAACCCCCAGCCAAAAAGGCAGCTGTG---GCTGTTGTCCCGCTTGTCTCTGAGGACAAATCAGTCA 2143
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 2073 CCTACAGGAACCCCCAGCCAAAAAGGCAGCTGTGGATGCTGTTGTCCTGCTTGACTCTGAGGACAAATCAGTCA 2146
Query 2144 CTGTGCCTGAAGCAGAAAATCCTAGAGACAGTCTTGTGCTGCCTCCAACCCAGTCCTCTTCAGATTCCTCACCC 2217
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147 CTGTGCCTGAAGCAGAAAATCCTAGAGACAGTCTTGTGCTGCCTCCAACCCAGTCCTCTTCAGATTCCTCACCC 2220
Query 2218 CCGGAGGTGTCTGGCCCTTCCTCATCCCAAATGAGCATGAAAACTCGCCGACTCAGCTCTGCCTCAACAGGAAA 2291
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221 CCGGAGGTGTCTGGCCCTTCCTCATCCCAAATGAGCATGAAAACTCGCCGACTCAGCTCTGCCTCAACAGGAAA 2294
Query 2292 GCCCCCACTCTCTGTGGAGGATGATTTTGAGAAACTAATATGGGAGATTTCAGGAGGCAAATTGGAAGCTGAGA 2365
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295 GCCCCCACTCTCTGTGGAGGATGATTTTGAGAAACTAACATGGGAGATTTCAGGAGGCAAATTGGAAGCTGAGA 2368
Query 2366 TTGACCTGGATCCTGGGAAAGATGAAGATGACCTTCTGCTTGAGCTATCAGAAATGATTGATAGC 2430
||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 2369 TTGACCTGGATCCTGGGAAAGATGAAGATGACCTTCCGCTTGAGCTA------------------ 2415