Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroad304_02292
Subject:
NM_001204108.1
Aligned Length:
594
Identities:
511
Gaps:
78

Alignment

Query   1  ATGGCAAAGCAACCTTCTGATGTAAGTTCTGAGTGTGACCGAGAAGGTAGACAATTGCAGCCTGCGGAGAGGCC  74
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   1  ATGGCAAAGCAACCTTCTGATGTAAGTTCTGAGTGTGACCGAGAAGGTAGACAATTGCAGCCTGCGGAGAGGCC  74

Query  75  TCCCCAGCTCAGACCTGGGGCCCCTACCTCCCTACAGACAGAGCCACAAGGTAATCCTGAAGGCAATCACGGAG  148
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  75  TCCCCAGCTCAGACCTGGGGCCCCTACCTCCCTACAGACAGAGCCACAAGGTAATCCTGAAGGCAATCACGGAG  148

Query 149  GTGAAGGGGACAGCTGCCCCCACGGCAGCCCTCAGGGCCCGCTGGCCCCACCTGCCAGCCCTGGCCCTTTTGCT  222
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149  GTGAAGGGGACAGCTGCCCCCACGGCAGCCCTCAGGGCCCGCTGGCCCCACCTGCCAGCCCTGGCCCTTTTGCT  222

Query 223  ACCAGATCCCCGCTTTTCATCTTTATGAGAAGATCCTCCCTGCTGTCTCGATCCTCCAGTGGGTATTTCTCTTT  296
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223  ACCAGATCCCCGCTTTTCATCTTTATGAGAAGATCCTCCCTGCTGTCTCGATCCTCCAGTGGGTATTTCTCTTT  296

Query 297  TGACACAGACAGGAGCCCAGCACCCATGAGTTGTGACAAATCAACACAAACCCCAAGTCCTCCTTGCCAGGCCT  370
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297  TGACACAGACAGGAGCCCAGCACCCATGAGTTGTGACAAATCAACACAAACCCCAAGTCCTCCTTGCCAGGCCT  370

Query 371  TCAACCACTATCTCAGTGCAATGGCTTCCATGAGGCAGGCTGAACCTGCAGATATGCGCCCAGAGATATGGATC  444
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371  TCAACCACTATCTCAGTGCAATGGCTTCCATGAGGCAGGCTGAACCTGCAGATATGCGCCCAGAGATATGGATC  444

Query 445  GCCCAAGAGTTGCGGCGTATTGGAGACGAGTTTAACGCTTACTATGCAAGGAGGGTATTTTTGAATAATTACCA  518
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|                  
Sbjct 445  GCCCAAGAGTTGCGGCGTATTGGAGACGAGTTTAACGCTTACTATGCAAGGAGGAT------------------  500

Query 519  AGCAGCCGAAGACCACCCACGAATGGTTATCTTACGACTGTTACGTTACATTGTCCGCCTGGTGTGGAGAATGC  592
               |||                      ||||.|..|||.|                                
Sbjct 501  ----GCC----------------------TCTTCCACCTGAT--------------------------------  516

Query 593  AT  594
             
Sbjct 517  --  516