Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_02304
- Subject:
- XM_006511336.1
- Aligned Length:
- 1088
- Identities:
- 769
- Gaps:
- 238
Alignment
Query 1 ATGGAAGAGTTGAGTCAGGCCCTGGCTAGTAGCTTTTCTGTGTCTCAAGATCTGAACAGCACAGCTGCCCCACA 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 CCCCCGCCTATCCCAGTACAAGTCCAAGTACAGTTCCTTGGAGCAGAGTGAGCGCCGCCGGAGGTTACTGGAAC 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 TGCAGAAATCCAAGCGGCTGGATTATGTGAACCATGCCAGAAGACTGGCTGAAGATGACTGGACAGGGATGGAG 222
||||||
Sbjct 1 --------------------------------------------------------------------ATGGAG 6
Query 223 AGTGAGGAA---GAAAATAAGAAAGATGATGAAGAAATGGACATTGACACTGTCAAGAAGTTACCAAAACACTA 293
||||.|||| |||||.|||||||||||.||.|||||||||||.|||.||..|||||||||||||||||.|||
Sbjct 7 AGTGGGGAAGAGGAAAACAAGAAAGATGAAGAGGAAATGGACATAGACCCTAGCAAGAAGTTACCAAAACGCTA 80
Query 294 TGCTAATCAATTGATGCTTTCTGAGTGGTTAATTGACGTTCCTTCAGATTTGGGGCAGGAATGGATTGTGGTCG 367
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.|
Sbjct 81 TGCTAATCAATTGATGCTTTCTGAGTGGTTAATTGACGTCCCTTCAGATTTGGGGCAAGAATGGATTGTGGTTG 154
Query 368 TGTGCCCTGTTGGAAAAAGAGCCCTTATCGTGGCCTCCAGGGGTTCTACCAGTGCCTACACCAAGAGTGGCTAC 441
||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.||||||||||||
Sbjct 155 TGTGTCCTGTTGGGAAAAGAGCCCTTATCGTGGCCTCCAGGGGTTCAACAAGTGCCTACACTAAGAGTGGCTAC 228
Query 442 TGTGTCAACAGGTTTTCTTCACTTCTGCCAGGAGGCAACAGGCGAAACT---CAACAGCAAAAGACTACACCAT 512
||||||||.|||||||||||.||||||||.||||||||||||.|||||| |||||||.||||||||||||||
Sbjct 229 TGTGTCAATAGGTTTTCTTCCCTTCTGCCCGGAGGCAACAGGAGAAACTCAACAACAGCCAAAGACTACACCAT 302
Query 513 TCTAGATTGCATTTACAATGAGGTAAACCAGACCTACTACGTTCTGGATGTGATGTGCTGGCGGGGACACCCTT 586
|||.|||||||||||||.||||||.||.|||||.|||||.|||.|||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 303 TCTGGATTGCATTTACAGTGAGGTGAATCAGACATACTATGTTTTGGATGTGATGTGCTGGCGGGGACATCCTT 376
Query 587 TTTATGATTGCCAGACTGATTTCCGATTCTACTGGATGCATTCAAAGTTACCAGAAGAAGAAGGACTGGGAGAG 660
|||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||
Sbjct 377 TTTATGACTGTCAGACTGATTTCCGATTCTACTGGATGCATTCAAAGTTACCAGAAGAAGAAGGGCTTGGAGAG 450
Query 661 AAAACCAAGCTTAATCCTTTTAAATTTGTGGGGCTAAAGAACTTCCCTTGCACTCCCGAAAGCCTGTGTGATGT 734
|||||||||.|||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||.||.||.||.|||||||||||.||
Sbjct 451 AAAACCAAGATTAATCCTTTTAAGTTTGTGGGGCTAAAGAATTTCCCGTGTACCCCTGAGAGCCTGTGTGAGGT 524
Query 735 GCTATCTATGGATTTCCCTTTTGAGGTAGATGGACTTCTCTTCTACCACAAACAGACCCACTACAGCCCCGGAA 808
|||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||.||.|
Sbjct 525 GCTGTCTATGGATTTTCCTTTTGAGGTAGATGGGCTGCTCTTCTACCATAAACAGACCCACTATAGCCCTGGGA 598
Query 809 GCACTCCCTTGGTGGGCTGGCTGCGCCCCTACATGGTGTCAGATGTCCTTGGTGTAGCTGTGCCGGCTGGCCCG 882
|.|||||..|||||||.|||||||||||||||||||||||||||.|.||.|||||||||||.||.||||||||.
Sbjct 599 GTACTCCTCTGGTGGGTTGGCTGCGCCCCTACATGGTGTCAGATATTCTGGGTGTAGCTGTTCCAGCTGGCCCA 672
Query 883 CTGACCACCAAGCCAGACTATGCTGGGCACCAGCTCCAGCAGATTATGGAGCACAAGAAGAGCCAGAAGGAAGG 956
|||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.||||||||.||||||||||.||||| ||||||.
Sbjct 673 CTGACCACCAAGCCAGAATACGCTGGGCACCAGCTCCAACAGATTATTGAGCACAAGAGGAGCC---AGGAAGA 743
Query 957 CATGAAGGAGAAACTCACACACAAGGCCTCTGAGAATGGGCACTATGAATTGGAGCACCTGTCTACTCCCAAGT 1030
||..|||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||..||||||||||||||||||||||||
Sbjct 744 CACAAAGGAGAAACTCACACACAAGGCTTCTGAGAATGGCCACTATGAGCTGGAGCACCTGTCTACTCCCAAGT 817
Query 1031 T--GAAGGGTTCTTCCCATAGCCCAGACCACCCTGGATGCCTCATGGAGAAT 1080
| ||| .|.||.||||.|||.|.|| || ||||||||||.||.
Sbjct 818 TAAGAA--ATCCTCCCCACAGCTCTGA--------GA-GCCTCATGGACAAC 858