Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_02305
- Subject:
- NM_001079844.2
- Aligned Length:
- 1701
- Identities:
- 1479
- Gaps:
- 42
Alignment
Query 1 ATGCCTTCTTGGATCGGGGCTGTGATTCTTCCCCTCTTGGGGCTGCTGCTCTCCCTCCCCGCCGGGGCGGATGT 74
|||||||||||||||.||||||||||||||||.||||..|||||||||||..|||||||.||||.||||||.||
Sbjct 1 ATGCCTTCTTGGATCCGGGCTGTGATTCTTCCTCTCTCCGGGCTGCTGCTGACCCTCCCGGCCGCGGCGGACGT 74
Query 75 GAAGGCTCGGAGCTGCGGAGAGGTCCGCCAGGCGTACGGTGCCAAGGGATTCAGCCTGGCGGACATCCCCTACC 148
||||||||||||||||.|.||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 GAAGGCTCGGAGCTGCAGCGAGGTCCGTCAGGCTTACGGTGCCAAGGGATTCAGCCTGGCGGACATCCCCTACC 148
Query 149 AGGAGATCGCAGGGGAACACTTAAGAATCTGTCCTCAGGAATATACATGCTGCACCACAGAAATGGAAGACAAG 222
||||||||||||||||.||||||.|.|||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 AGGAGATCGCAGGGGAGCACTTACGCATCTGCCCTCAGGAATATACCTGCTGCACCACAGAAATGGAAGACAAG 222
Query 223 TTAAGCCAACAAAGCAAACTCGAATTTGAAAACCTTGTGGAAGAGACAAGCCATTTTGTGCGCACCACTTTTGT 296
.|.||.|||||.||.|||||.||.||||||||||||||.||||||||||||||.||||||.|.|||||.|||||
Sbjct 223 CTGAGTCAACAGAGTAAACTGGAGTTTGAAAACCTTGTAGAAGAGACAAGCCACTTTGTGAGGACCACGTTTGT 296
Query 297 GTCCAGGCATAAGAAATTTGACGAATTTTTCCGAGAGCTCCTGGAGAATGCAGAAAAGTCACTAAATGATATGT 370
|||.|||||.|||||||||||.||.||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||.||||||||.||||
Sbjct 297 GTCGAGGCACAAGAAATTTGATGAGTTTTTCCGAGAGCTGCTGGAAAACGCAGAAAAGTCCCTAAATGACATGT 370
Query 371 TTGTACGGACCTATGGCATGCTGTACATGCAGAATTCAGAAGTCTTCCAGGACCTCTTCACAGAGCTGAAAAGG 444
||||.||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||.||..||
Sbjct 371 TTGTCCGGACCTACGGGATGCTGTACATGCAGAATTCAGAGGTATTCCAGGACCTCTTCACTGAGCTAAAGCGG 444
Query 445 TACTACACTGGGGGTAATGTGAATCTGGAGGAAATGCTCAATGACTTTTGGGCTCGGCTCCTGGAACGGATGTT 518
||||||||.||||||||.||.||.|||||.||.||||||||||||||.|||||||||||||||||..|||||||
Sbjct 445 TACTACACAGGGGGTAACGTCAACCTGGAAGAGATGCTCAATGACTTCTGGGCTCGGCTCCTGGAGAGGATGTT 518
Query 519 TCAGCTGATAAACCCTCAGTATCACTTCAGTGAAGACTACCTGGAATGTGTGAGCAAATACACTGACCAGCTCA 592
.||||||||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||.|||||.|||||.||||||||.|
Sbjct 519 CCAGCTGATTAACCCTCAGTATCACTTCAGCGAGGACTACCTGGAGTGTGTAAGCAAGTACACAGACCAGCTGA 592
Query 593 AGCCATTTGGAGACGTGCCCCGGAAACTGAAGATTCAGGTTACCCGCGCCTTCATTGCTGCCAGGACCTTTGTC 666
|||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||.||..|.|||||||||
Sbjct 593 AGCCATTTGGAGACGTGCCACGGAAACTGAAGATTCAGGTCACCCGCGCCTTCATCGCGGCTCGCACCTTTGTC 666
Query 667 CAGGGGCTGACTGTGGGCAGAGAAGTTGCAAACCGAGTTTCCAAGGTCAGCCCAACCCCAGGGTGTATCCGTGC 740
|||||.|||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||.||.||.|||||.||
Sbjct 667 CAGGGCCTGACAGTGGGCAGAGAGGTTGCCAACCGAGTTTCCAAGGTGAGCCCCACCCCTGGCTGCATCCGGGC 740
Query 741 CCTCATGAAGATGCTGTACTGCCCATACTGTCGGGGGCTT-CCCACTGTGAGGCCCTGCAACAACTACTGTCTC 813
.||||||||||||||||||||||||||||| |.|.||||| |||||||||||.||.||||||||||||||.|||
Sbjct 741 TCTCATGAAGATGCTGTACTGCCCATACTG-CCGAGGCTTGCCCACTGTGAGACCTTGCAACAACTACTGCCTC 813
Query 814 AACGTCATGAAGGGCTGCTTGGCAAATCAGGCTGACCTCGACACAGAGTGGAATCTGTTTATAGATGCAATGCT 887
||||||||||||||||||.||||.||||||||.||..|.|||||.|||||||||||.||.||||||||||||||
Sbjct 814 AACGTCATGAAGGGCTGCCTGGCCAATCAGGCAGATTTGGACACTGAGTGGAATCTCTTCATAGATGCAATGCT 887
Query 888 CTTGGTGGCAGAGCGACTGGAGGGGCCATTCAACATTGAGTCGGTCATGGACCCGATAGATGTCAAGATTTCTG 961
|||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||.||||
Sbjct 888 CTTGGTGGCTGAGCGACTGGAAGGGCCATTCAACATTGAGTCAGTCATGGACCCAATAGACGTCAAGATCTCTG 961
Query 962 AAGCCATTATGAACATGCAAGAAAACAGCATGCAGGTGTCTGCAAAGGTCTTTCAGGGATGTGGTCAGCCCAAA 1035
|||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||||||
Sbjct 962 AAGCCATTATGAACATGCAGGAAAACAGCATGCAGGTGTCAGCAAAGGTCTTTCAGGGCTGTGGCCAGCCCAAA 1035
Query 1036 CCTGCTCCAGCCCTCAGATCTGCCCGCTCAGCTCCTGAAAATTTTAATACACGTTTCAGGCCCTACAATCCTGA 1109
||||||||.||.|||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||.|||||..||||||||||.|||||
Sbjct 1036 CCTGCTCCCGCTCTCAGATCTGCTCGCTCAGCTCCAGAAAATTTTAACACCCGTTTTCGGCCCTACAACCCTGA 1109
Query 1110 GGAAAGACCAACAACTGCTGCAGGCACAAGCTTGGACCGGCTG------------------------------G 1153
|||||||||.||||||||.||.|||||.||||||||||||||| |
Sbjct 1110 GGAAAGACCCACAACTGCAGCGGGCACGAGCTTGGACCGGCTGAGGACTGTGTGGAGGACCATGCAGCACAGTG 1183
Query 1154 TCACAGACATAAAAGAGAAATTGAAGCTCTCTAAAAAGGTCTGGTCAGCATTACCCTACACTATCTGCAAGGAC 1227
|||||||||||||||||||..|||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||
Sbjct 1184 TCACAGACATAAAAGAGAAGCTGAAGCTCTCTAAAAAGGTCTGGTCAGCATTGCCCTACACCATCTGCAAGGAC 1257
Query 1228 GAGAGCGTGACAGCGGGCACGTCCAACGAGGAGGAATGCTGGAACGGGCACAGCAAAGCCAGATACTTGCCTGA 1301
||..|.||||||||.||.||.||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 1258 GAACGTGTGACAGCAGGAACCTCCAACGAGGAGGAGTGCTGGAACGGACACAGCAAAGCCAGATACCTGCCTGA 1331
Query 1302 GATCATGAATGATGGGCTCACCAACCAGATCAACAATCCCGAGGTGGATGTGGACATCACTCGGCCTGACACTT 1375
|||||||||.||||||||.||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||.|||||||
Sbjct 1332 GATCATGAACGATGGGCTGACCAACCAAATCAACAATCCTGAGGTGGAGGTGGACATCACGCGGCCAGACACTT 1405
Query 1376 TCATCAGACAGCAGATTATGGCTCTCCGTGTGATGACCAACAAACTAAAAAACGCCTACAATGGCAATGATGTC 1449
||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.||.||.||||||||||||||.|||
Sbjct 1406 TCATCAGACAGCAGATCATGGCTCTCCGTGTGATGACCAACAAACTGAAGAATGCGTACAATGGCAATGACGTC 1479
Query 1450 AATTTCCAGGACACAAGTGATGAATCCAGTGGCTCAGGGAGTGGCAGTGGGTGCATGGATGACGTGTGTCCCAC 1523
||.|||||.||||||||.||||||||||||||||||||.||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||
Sbjct 1480 AACTTCCAAGACACAAGCGATGAATCCAGTGGCTCAGGCAGCGGCAGTGGTTGCATGGATGATGTGTGTCCCAC 1553
Query 1524 GGAGTTTGAGTTTGTCACCACAGAGGCCCCCGCAGTGGATCCCGACCGGAGAGAGGTGGACTCTTCTGC----- 1592
||||||.||||||||||||||.||||||||.||.|||||.||.|||||.|||||.|.|||.|||||.||
Sbjct 1554 GGAGTTCGAGTTTGTCACCACCGAGGCCCCGGCGGTGGACCCGGACCGCAGAGAAGAGGAATCTTCGGCCTCGA 1627
Query 1593 AGCCCAGCGTGGCCACTCCCTGCTCTCCTGGTCTCTCACCTGCATTGTCCTGGCACTGCAGAGACTGTGCAGA 1665
||..|| ||..||||.||.|.|||||||||||...||||||.|||.||||.|||||||||||.|.||||
Sbjct 1628 AGTTCA-----GCTCCTCCTTGATTTCCTGGTCTCTGGTCTGCATGGTCTTGGCCCTGCAGAGACTCTACAGA 1695