Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_02305
- Subject:
- XM_011521044.2
- Aligned Length:
- 1665
- Identities:
- 1455
- Gaps:
- 210
Alignment
Query 1 ATGCCTTCTTGGATCGGGGCTGTGATTCTTCCCCTCTTGGGGCTGCTGCTCTCCCTCCCCGCCGGGGCGGATGT 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 GAAGGCTCGGAGCTGCGGAGAGGTCCGCCAGGCGTACGGTGCCAAGGGATTCAGCCTGGCGGACATCCCCTACC 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 AGGAGATCGCAGGGGAACACTTAAGAATCTGTCCTCAGGAATATACATGCTGCACCACAGAAATGGAAGACAAG 222
||||||||||||
Sbjct 1 --------------------------------------------------------------ATGGAAGACAAG 12
Query 223 TTAAGCCAACAAAGCAAACTCGAATTTGAAAACCTTGTGGAAGAGACAAGCCATTTTGTGCGCACCACTTTTGT 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 13 TTAAGCCAACAAAGCAAACTCGAATTTGAAAACCTTGTGGAAGAGACAAGCCATTTTGTGCGCACCACTTTTGT 86
Query 297 GTCCAGGCATAAGAAATTTGACGAATTTTTCCGAGAGCTCCTGGAGAATGCAGAAAAGTCACTAAATGATATGT 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 87 GTCCAGGCATAAGAAATTTGACGAATTTTTCCGAGAGCTCCTGGAGAATGCAGAAAAGTCACTAAATGATATGT 160
Query 371 TTGTACGGACCTATGGCATGCTGTACATGCAGAATTCAGAAGTCTTCCAGGACCTCTTCACAGAGCTGAAAAGG 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 161 TTGTACGGACCTATGGCATGCTGTACATGCAGAATTCAGAAGTCTTCCAGGACCTCTTCACAGAGCTGAAAAGG 234
Query 445 TACTACACTGGGGGTAATGTGAATCTGGAGGAAATGCTCAATGACTTTTGGGCTCGGCTCCTGGAACGGATGTT 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 235 TACTACACTGGGGGTAATGTGAATCTGGAGGAAATGCTCAATGACTTTTGGGCTCGGCTCCTGGAACGGATGTT 308
Query 519 TCAGCTGATAAACCCTCAGTATCACTTCAGTGAAGACTACCTGGAATGTGTGAGCAAATACACTGACCAGCTCA 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 309 TCAGCTGATAAACCCTCAGTATCACTTCAGTGAAGACTACCTGGAATGTGTGAGCAAATACACTGACCAGCTCA 382
Query 593 AGCCATTTGGAGACGTGCCCCGGAAACTGAAGATTCAGGTTACCCGCGCCTTCATTGCTGCCAGGACCTTTGTC 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 383 AGCCATTTGGAGACGTGCCCCGGAAACTGAAGATTCAGGTTACCCGCGCCTTCATTGCTGCCAGGACCTTTGTC 456
Query 667 CAGGGGCTGACTGTGGGCAGAGAAGTTGCAAACCGAGTTTCCAAGGTCAGCCCAACCCCAGGGTGTATCCGTGC 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 457 CAGGGGCTGACTGTGGGCAGAGAAGTTGCAAACCGAGTTTCCAAGGTCAGCCCAACCCCAGGGTGTATCCGTGC 530
Query 741 CCTCATGAAGATGCTGTACTGCCCATACTGTCGGGGGCTTCCCACTGTGAGGCCCTGCAACAACTACTGTCTCA 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 531 CCTCATGAAGATGCTGTACTGCCCATACTGTCGGGGGCTTCCCACTGTGAGGCCCTGCAACAACTACTGTCTCA 604
Query 815 ACGTCATGAAGGGCTGCTTGGCAAATCAGGCTGACCTCGACACAGAGTGGAATCTGTTTATAGATGCAATGCTC 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 605 ACGTCATGAAGGGCTGCTTGGCAAATCAGGCTGACCTCGACACAGAGTGGAATCTGTTTATAGATGCAATGCTC 678
Query 889 TTGGTGGCAGAGCGACTGGAGGGGCCATTCAACATTGAGTCGGTCATGGACCCGATAGATGTCAAGATTTCTGA 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 679 TTGGTGGCAGAGCGACTGGAGGGGCCATTCAACATTGAGTCGGTCATGGACCCGATAGATGTCAAGATTTCTGA 752
Query 963 AGCCATTATGAACATGCAAGAAAACAGCATGCAGGTGTCTGCAAAGGTCTTTCAGGGATGTGGTCAGCCCAAAC 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 753 AGCCATTATGAACATGCAAGAAAACAGCATGCAGGTGTCTGCAAAGGTCTTTCAGGGATGTGGTCAGCCCAAAC 826
Query 1037 CTGCTCCAGCCCTCAGATCTGCCCGCTCAGCTCCTGAAAATTTTAATACACGTTTCAGGCCCTACAATCCTGAG 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 827 CTGCTCCAGCCCTCAGATCTGCCCGCTCAGCTCCTGAAAATTTTAATACACGTTTCAGGCCCTACAATCCTGAG 900
Query 1111 GAAAGACCAACAACTGCTGCAGGCACAAGCTTGGACCGGCTGGTCACAGACATAAAAGAGAAATTGAAGCTCTC 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 901 GAAAGACCAACAACTGCTGCAGGCACAAGCTTGGACCGGCTGGTCACAGACATAAAAGAGAAATTGAAGCTCTC 974
Query 1185 TAAAAAGGTCTGGTCAGCATTACCCTACACTATCTGCAAGGACGAGAGCGTGACAGCGGGCACGTCCAACGAGG 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 975 TAAAAAGGTCTGGTCAGCATTACCCTACACTATCTGCAAGGACGAGAGCGTGACAGCGGGCACGTCCAACGAGG 1048
Query 1259 AGGAATGCTGGAACGGGCACAGCAAAGCCAGATACTTGCCTGAGATCATGAATGATGGGCTCACCAACCAGATC 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1049 AGGAATGCTGGAACGGGCACAGCAAAGCCAGATACTTGCCTGAGATCATGAATGATGGGCTCACCAACCAGATC 1122
Query 1333 AACAATCCCGAGGTGGATGTGGACATCACTCGGCCTGACACTTTCATCAGACAGCAGATTATGGCTCTCCGTGT 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1123 AACAATCCCGAGGTGGATGTGGACATCACTCGGCCTGACACTTTCATCAGACAGCAGATTATGGCTCTCCGTGT 1196
Query 1407 GATGACCAACAAACTAAAAAACGCCTACAATGGCAATGATGTCAATTTCCAGGACACAAGTGATGAATCCAGTG 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1197 GATGACCAACAAACTAAAAAACGCCTACAATGGCAATGATGTCAATTTCCAGGACACAAGTGATGAATCCAGTG 1270
Query 1481 GCTCAGGGAGTGGCAGTGGGTGCATGGATGACGTGTGTCCCACGGAGTTTGAGTTTGTCACCACAGAGGCCCCC 1554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1271 GCTCAGGGAGTGGCAGTGGGTGCATGGATGACGTGTGTCCCACGGAGTTTGAGTTTGTCACCACAGAGGCCCCC 1344
Query 1555 GCAGTGGATCCCGACCGGAGAGAGGTGGACTCTTCTGCAGCCCAGCGTGGCCACTCCCTGCTCTCCTGGTCTCT 1628
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1345 GCAGTGGATCCCGACCGGAGAGAGGTGGACTCTTCTGCAGCCCAGCGTGGCCACTCCCTGCTCTCCTGGTCTCT 1418
Query 1629 CACCTGCATTGTCCTGGCACTGCAGAGACTGTGCAGA 1665
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1419 CACCTGCATTGTCCTGGCACTGCAGAGACTGTGCAGA 1455