Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_02305
- Subject:
- XM_017020301.1
- Aligned Length:
- 1665
- Identities:
- 1299
- Gaps:
- 366
Alignment
Query 1 ATGCCTTCTTGGATCGGGGCTGTGATTCTTCCCCTCTTGGGGCTGCTGCTCTCCCTCCCCGCCGGGGCGGATGT 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 GAAGGCTCGGAGCTGCGGAGAGGTCCGCCAGGCGTACGGTGCCAAGGGATTCAGCCTGGCGGACATCCCCTACC 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 AGGAGATCGCAGGGGAACACTTAAGAATCTGTCCTCAGGAATATACATGCTGCACCACAGAAATGGAAGACAAG 222
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 223 TTAAGCCAACAAAGCAAACTCGAATTTGAAAACCTTGTGGAAGAGACAAGCCATTTTGTGCGCACCACTTTTGT 296
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 297 GTCCAGGCATAAGAAATTTGACGAATTTTTCCGAGAGCTCCTGGAGAATGCAGAAAAGTCACTAAATGATATGT 370
||||
Sbjct 1 ----------------------------------------------------------------------ATGT 4
Query 371 TTGTACGGACCTATGGCATGCTGTACATGCAGAATTCAGAAGTCTTCCAGGACCTCTTCACAGAGCTGAAAAGG 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5 TTGTACGGACCTATGGCATGCTGTACATGCAGAATTCAGAAGTCTTCCAGGACCTCTTCACAGAGCTGAAAAGG 78
Query 445 TACTACACTGGGGGTAATGTGAATCTGGAGGAAATGCTCAATGACTTTTGGGCTCGGCTCCTGGAACGGATGTT 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 79 TACTACACTGGGGGTAATGTGAATCTGGAGGAAATGCTCAATGACTTTTGGGCTCGGCTCCTGGAACGGATGTT 152
Query 519 TCAGCTGATAAACCCTCAGTATCACTTCAGTGAAGACTACCTGGAATGTGTGAGCAAATACACTGACCAGCTCA 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 153 TCAGCTGATAAACCCTCAGTATCACTTCAGTGAAGACTACCTGGAATGTGTGAGCAAATACACTGACCAGCTCA 226
Query 593 AGCCATTTGGAGACGTGCCCCGGAAACTGAAGATTCAGGTTACCCGCGCCTTCATTGCTGCCAGGACCTTTGTC 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 227 AGCCATTTGGAGACGTGCCCCGGAAACTGAAGATTCAGGTTACCCGCGCCTTCATTGCTGCCAGGACCTTTGTC 300
Query 667 CAGGGGCTGACTGTGGGCAGAGAAGTTGCAAACCGAGTTTCCAAGGTCAGCCCAACCCCAGGGTGTATCCGTGC 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 301 CAGGGGCTGACTGTGGGCAGAGAAGTTGCAAACCGAGTTTCCAAGGTCAGCCCAACCCCAGGGTGTATCCGTGC 374
Query 741 CCTCATGAAGATGCTGTACTGCCCATACTGTCGGGGGCTTCCCACTGTGAGGCCCTGCAACAACTACTGTCTCA 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 375 CCTCATGAAGATGCTGTACTGCCCATACTGTCGGGGGCTTCCCACTGTGAGGCCCTGCAACAACTACTGTCTCA 448
Query 815 ACGTCATGAAGGGCTGCTTGGCAAATCAGGCTGACCTCGACACAGAGTGGAATCTGTTTATAGATGCAATGCTC 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 449 ACGTCATGAAGGGCTGCTTGGCAAATCAGGCTGACCTCGACACAGAGTGGAATCTGTTTATAGATGCAATGCTC 522
Query 889 TTGGTGGCAGAGCGACTGGAGGGGCCATTCAACATTGAGTCGGTCATGGACCCGATAGATGTCAAGATTTCTGA 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 523 TTGGTGGCAGAGCGACTGGAGGGGCCATTCAACATTGAGTCGGTCATGGACCCGATAGATGTCAAGATTTCTGA 596
Query 963 AGCCATTATGAACATGCAAGAAAACAGCATGCAGGTGTCTGCAAAGGTCTTTCAGGGATGTGGTCAGCCCAAAC 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 597 AGCCATTATGAACATGCAAGAAAACAGCATGCAGGTGTCTGCAAAGGTCTTTCAGGGATGTGGTCAGCCCAAAC 670
Query 1037 CTGCTCCAGCCCTCAGATCTGCCCGCTCAGCTCCTGAAAATTTTAATACACGTTTCAGGCCCTACAATCCTGAG 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 671 CTGCTCCAGCCCTCAGATCTGCCCGCTCAGCTCCTGAAAATTTTAATACACGTTTCAGGCCCTACAATCCTGAG 744
Query 1111 GAAAGACCAACAACTGCTGCAGGCACAAGCTTGGACCGGCTGGTCACAGACATAAAAGAGAAATTGAAGCTCTC 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 745 GAAAGACCAACAACTGCTGCAGGCACAAGCTTGGACCGGCTGGTCACAGACATAAAAGAGAAATTGAAGCTCTC 818
Query 1185 TAAAAAGGTCTGGTCAGCATTACCCTACACTATCTGCAAGGACGAGAGCGTGACAGCGGGCACGTCCAACGAGG 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 819 TAAAAAGGTCTGGTCAGCATTACCCTACACTATCTGCAAGGACGAGAGCGTGACAGCGGGCACGTCCAACGAGG 892
Query 1259 AGGAATGCTGGAACGGGCACAGCAAAGCCAGATACTTGCCTGAGATCATGAATGATGGGCTCACCAACCAGATC 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 893 AGGAATGCTGGAACGGGCACAGCAAAGCCAGATACTTGCCTGAGATCATGAATGATGGGCTCACCAACCAGATC 966
Query 1333 AACAATCCCGAGGTGGATGTGGACATCACTCGGCCTGACACTTTCATCAGACAGCAGATTATGGCTCTCCGTGT 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 967 AACAATCCCGAGGTGGATGTGGACATCACTCGGCCTGACACTTTCATCAGACAGCAGATTATGGCTCTCCGTGT 1040
Query 1407 GATGACCAACAAACTAAAAAACGCCTACAATGGCAATGATGTCAATTTCCAGGACACAAGTGATGAATCCAGTG 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1041 GATGACCAACAAACTAAAAAACGCCTACAATGGCAATGATGTCAATTTCCAGGACACAAGTGATGAATCCAGTG 1114
Query 1481 GCTCAGGGAGTGGCAGTGGGTGCATGGATGACGTGTGTCCCACGGAGTTTGAGTTTGTCACCACAGAGGCCCCC 1554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1115 GCTCAGGGAGTGGCAGTGGGTGCATGGATGACGTGTGTCCCACGGAGTTTGAGTTTGTCACCACAGAGGCCCCC 1188
Query 1555 GCAGTGGATCCCGACCGGAGAGAGGTGGACTCTTCTGCAGCCCAGCGTGGCCACTCCCTGCTCTCCTGGTCTCT 1628
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1189 GCAGTGGATCCCGACCGGAGAGAGGTGGACTCTTCTGCAGCCCAGCGTGGCCACTCCCTGCTCTCCTGGTCTCT 1262
Query 1629 CACCTGCATTGTCCTGGCACTGCAGAGACTGTGCAGA 1665
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1263 CACCTGCATTGTCCTGGCACTGCAGAGACTGTGCAGA 1299
