Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_02330
• Subject: NM_013716.2
• Aligned Length: 1401
• Identities: 1206
• Gaps: 9

Alignment

Query    1  ATGGTGATGGAGAAGCCTAGTCCCCTGCTGGTCGGGCGGGAATTTGTGAGACAGTATTACACACTGCTGAACCA  74
            |||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||.|||||||.|||||.|||||||||||
Sbjct    1  ATGGTTATGGAGAAGCCTAGTCCCCTGCTGGTCGGGCGGGAGTTTGTGCGACAGTACTACACTCTGCTGAACCA  74

Query   75  GGCCCCAGACATGCTGCATAGATTTTATGGAAAGAACTCTTCTTATGTCCATGGGGGATTGGATTCAAATGGAA  148
            ||||||.||||||.||||.|||||||||||||||||||||||.||||.|||.|||||.||||||||.||.||.|
Sbjct   75  GGCCCCGGACATGTTGCACAGATTTTATGGAAAGAACTCTTCCTATGCCCACGGGGGCTTGGATTCCAACGGGA  148

Query  149  AGCCAGCAGATGCAGTCTACGGACAGAAAGAAATCCACAGGAAAGTGATGTCACAAAACTTCACCAACTGCCAC  222
            ||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  AGCCAGCAGATGCAGTCTACGGGCAGAAGGAAATCCACAGGAAAGTGATGTCACAAAACTTCACCAACTGCCAC  222

Query  223  ACCAAGATTCGCCATGTTGATGCTCATGCCACGCTAAATGATGGTGTGGTAGTCCAGGTGATGGGGCTTCTCTC  296
            ||||||||.|||||.||.||||||||.||.||.||.|||||.||.|||||.|||||.|||||||||||.||.||
Sbjct  223  ACCAAGATCCGCCACGTGGATGCTCACGCAACTCTGAATGACGGGGTGGTGGTCCAAGTGATGGGGCTACTGTC  296

Query  297  TAACAACAACCAGGCTTTGAGGAGATTCATGCAAACGTTTGTCCTTGCTCCTGAGGGGTCTGTTGCAAATAAAT  370
            .|||||||||||||||.||.||||.||||||||.||.||||||||||||||||||||.||||||||.||.||||
Sbjct  297  CAACAACAACCAGGCTCTGCGGAGGTTCATGCAGACCTTTGTCCTTGCTCCTGAGGGCTCTGTTGCCAACAAAT  370

Query  371  TCTATGTTCACAATGATATCTTCAGATACCAAGATGAGGTCTTTGGTGGGTTTGTCACTGAGCCTCAGGAGGAG  444
            |||||||||||||.||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||.||||||||.|||||.
Sbjct  371  TCTATGTTCACAACGACATCTTCAGGTACCAAGATGAGGTCTTCGGTGGCTTTGTCACAGAGCCTCAAGAGGAA  444

Query  445  TCTGAAGAAGAAGTAGAGGAACCTGAAGAAAGACAGCAAACACCTGAGGTGGTACCTGATGATTCTGGAACTTT  518
            ||.||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct  445  TCCGAGGAAGAAGTAGAAGAACCTGAAGAAAGACAGCAGACACCAGAGGTGGTGCCTGATGATTCTGGAACTTT  518

Query  519  CTATGATCAGGCAGTTGTCAGTAATGACATGGAAGAACATTTAGAGGAGCCTGTTGCTGAACCAGAGCCTGATC  592
            ||||||||||.|   ||||||.||||||.||||.||.|||||||||||||||||.|..||||||||.||.||.|
Sbjct  519  CTATGATCAGAC---TGTCAGCAATGACTTGGAGGAGCATTTAGAGGAGCCTGTAGTGGAACCAGAACCGGAGC  589

Query  593  CTGAACCAGAACCAGAACAAGAACCTGTATCTGAAATCCAAGAGGAAAAGCCTGAGCCAGTATTAGAAGAAACT  666
            |.||.||.||.||.||.|..||||||||.||.||.||.||||||||.|||||||||.|.|.|||.||||||.||
Sbjct  590  CAGAGCCGGAGCCGGAGCCGGAACCTGTGTCCGACATTCAAGAGGACAAGCCTGAGGCTGCATTGGAAGAAGCT  663

Query  667  GCCCCTGAGGATGCTCAGAAGAGTTCTTCTCCAGCACCTGCAGACATAGCTCAGACAGTACAGGAAGACTTGAG  740
            ||.||.||.||||..||||||||..||||.||.||.||.||.||..|.||.|   |.|.||||||.||||||||
Sbjct  664  GCTCCCGACGATGTGCAGAAGAGCACTTCCCCGGCCCCGGCTGATGTGGCCC---CGGCACAGGAGGACTTGAG  734

Query  741  GACATTTTCTTGGGCATCTGTGACCAGTAAGAATCTTCCACCCAGTGGAGCTGTTCCAGTTACTGGGATACCAC  814
            |||.||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||.||.||||.|||||
Sbjct  735  GACGTTTTCTTGGGCATCTGTGACGAGTAAGAACCTTCCTCCCAGTGGGGCTGTTCCAGTGACGGGGACACCAC  808

Query  815  CTCATGTTGTTAAAGTACCAGCTTCACAGCCCCGTCCAGAGTCTAAGCCTGAATCTCAGATTCCACCACAAAGA  888
            |||||||.||.|||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||.|||||||||||.
Sbjct  809  CTCATGTGGTCAAAGTGCCAGCGTCACAGCCCCGTCCAGAATCTAAACCTGACTCTCAGATCCCACCACAAAGG  882

Query  889  CCTCAGCGGGATCAAAGAGTGCGAGAACAACGAATAAATATTCCTCCCCAAAGGGGACCCAGACCAATCCGTGA  962
            ||||||.|.|||||.|||||.|||||.||.|||||.|||||.|||||.||.||.||||||.|||||||||||||
Sbjct  883  CCTCAGAGAGATCAGAGAGTTCGAGAGCAGCGAATCAATATCCCTCCTCAGAGAGGACCCCGACCAATCCGTGA  956

Query  963  GGCTGGTGAGCAAGGTGACATTGAACCCCGAAGAATGGTGAGACACCCTGACAGTCACCAACTCTTCATTGGCA  1036
            |||||||||.|.|||.||..|.|||||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.|
Sbjct  957  GGCTGGTGAACCAGGAGATGTGGAACCTCGAAGGATGGTGAGGCACCCTGACAGTCACCAGCTCTTCATTGGGA  1030

Query 1037  ACCTGCCTCATGAAGTGGACAAATCAGAGCTTAAAGATTTCTTTCAAAGTTATGGAAACGTGGTGGAGTTGCGC  1110
            |||||||.|||||.||.|||||.||.||.||.||.|||||.||.||||.||.|||.||.|||||||||.|||||
Sbjct 1031  ACCTGCCACATGAGGTTGACAAGTCGGAACTGAAGGATTTTTTCCAAAATTTTGGCAATGTGGTGGAGCTGCGC  1104

Query 1111  ATTAACAGTGGTGGGAAATTACCCAATTTTGGTTTTGTTGTGTTTGATGATTCTGAGCCTGTTCAGAAAGTCCT  1184
            ||.||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||
Sbjct 1105  ATCAACAGTGGTGGGAAGTTACCCAATTTCGGTTTTGTTGTGTTTGATGATTCTGAACCTGTTCAGAAGGTCCT  1178

Query 1185  TAGCAACAGGCCCATCATGTTCAGAGGTGAGGTCCGTCTGAATGTCGAAGAGAAGAAGACTCGAGCTGCCAGGG  1258
            |||.||.|||||||||||||||.||||.|.||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 1179  TAGTAATAGGCCCATCATGTTCCGAGGCGCGGTCCGCCTGAATGTGGAAGAGAAGAAGACTCGAGCTGCCAGAG  1252

Query 1259  AAGGCGACCGACGAGATAATCGCCTTCGGGGACCTGGAGGCCCTCGAGGTGGGCTGGGTGGTGGAATGAGAGGC  1332
            ||||||||||..|.|||||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||||.|.|||||||.|||||||||
Sbjct 1253  AAGGCGACCGCAGGGATAACCGCCTTCGGGGACCTGGAGGCCCCCGTGGTGGGCCGAGTGGTGGGATGAGAGGC  1326

Query 1333  CCTCCCCGTGGAGGCATGGTGCAGAAACCAGGATTTGGAGTGGGAAGGGGGCTT---GCGCCACGGCAG  1398
            ||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||||||.||   .|.|||.|||||
Sbjct 1327  CCTCCCCGCGGAGGCATGGTGCAGAAACCAGGCTTTGGCGTGGGCAGGGGGATTACAACTCCAAGGCAG  1395