Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_02330
• Subject: XM_006533444.2
• Aligned Length: 1401
• Identities: 1028
• Gaps: 204

Alignment

Query    1  ATGGTGATGGAGAAGCCTAGTCCCCTGCTGGTCGGGCGGGAATTTGTGAGACAGTATTACACACTGCTGAACCA  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  GGCCCCAGACATGCTGCATAGATTTTATGGAAAGAACTCTTCTTATGTCCATGGGGGATTGGATTCAAATGGAA  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  AGCCAGCAGATGCAGTCTACGGACAGAAAGAAATCCACAGGAAAGTGATGTCACAAAACTTCACCAACTGCCAC  222
                                                           |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  -----------------------------------------------ATGTCACAAAACTTCACCAACTGCCAC  27

Query  223  ACCAAGATTCGCCATGTTGATGCTCATGCCACGCTAAATGATGGTGTGGTAGTCCAGGTGATGGGGCTTCTCTC  296
            ||||||||.|||||.||.||||||||.||.||.||.|||||.||.|||||.|||||.|||||||||||.||.||
Sbjct   28  ACCAAGATCCGCCACGTGGATGCTCACGCAACTCTGAATGACGGGGTGGTGGTCCAAGTGATGGGGCTACTGTC  101

Query  297  TAACAACAACCAGGCTTTGAGGAGATTCATGCAAACGTTTGTCCTTGCTCCTGAGGGGTCTGTTGCAAATAAAT  370
            .|||||||||||||||.||.||||.||||||||.||.||||||||||||||||||||.||||||||.||.||||
Sbjct  102  CAACAACAACCAGGCTCTGCGGAGGTTCATGCAGACCTTTGTCCTTGCTCCTGAGGGCTCTGTTGCCAACAAAT  175

Query  371  TCTATGTTCACAATGATATCTTCAGATACCAAGATGAGGTCTTTGGTGGGTTTGTCACTGAGCCTCAGGAGGAG  444
            |||||||||||||.||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||.||||||||.|||||.
Sbjct  176  TCTATGTTCACAACGACATCTTCAGGTACCAAGATGAGGTCTTCGGTGGCTTTGTCACAGAGCCTCAAGAGGAA  249

Query  445  TCTGAAGAAGAAGTAGAGGAACCTGAAGAAAGACAGCAAACACCTGAGGTGGTACCTGATGATTCTGGAACTTT  518
            ||.||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct  250  TCCGAGGAAGAAGTAGAAGAACCTGAAGAAAGACAGCAGACACCAGAGGTGGTGCCTGATGATTCTGGAACTTT  323

Query  519  CTATGATCAGGCAGTTGTCAGTAATGACATGGAAGAACATTTAGAGGAGCCTGTTGCTGAACCAGAGCCTGATC  592
            ||||||||||.|   ||||||.||||||.||||.||.|||||||||||||||||.|..||||||||.||.||.|
Sbjct  324  CTATGATCAGAC---TGTCAGCAATGACTTGGAGGAGCATTTAGAGGAGCCTGTAGTGGAACCAGAACCGGAGC  394

Query  593  CTGAACCAGAACCAGAACAAGAACCTGTATCTGAAATCCAAGAGGAAAAGCCTGAGCCAGTATTAGAAGAAACT  666
            |.||.||.||.||.||.|..||||||||.||.||.||.||||||||.|||||||||.|.|.|||.||||||.||
Sbjct  395  CAGAGCCGGAGCCGGAGCCGGAACCTGTGTCCGACATTCAAGAGGACAAGCCTGAGGCTGCATTGGAAGAAGCT  468

Query  667  GCCCCTGAGGATGCTCAGAAGAGTTCTTCTCCAGCACCTGCAGACATAGCTCAGACAGTACAGGAAGACTTGAG  740
            ||.||.||.||||..||||||||..||||.||.||.||.||.||..|.||.|   |.|.||||||.||||||||
Sbjct  469  GCTCCCGACGATGTGCAGAAGAGCACTTCCCCGGCCCCGGCTGATGTGGCCC---CGGCACAGGAGGACTTGAG  539

Query  741  GACATTTTCTTGGGCATCTGTGACCAGTAAGAATCTTCCACCCAGTGGAGCTGTTCCAGTTACTGGGATACCAC  814
            |||.||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||.||.||||.|||||
Sbjct  540  GACGTTTTCTTGGGCATCTGTGACGAGTAAGAACCTTCCTCCCAGTGGGGCTGTTCCAGTGACGGGGACACCAC  613

Query  815  CTCATGTTGTTAAAGTACCAGCTTCACAGCCCCGTCCAGAGTCTAAGCCTGAATCTCAGATTCCACCACAAAGA  888
            |||||||.||.|||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||.|||||||||||.
Sbjct  614  CTCATGTGGTCAAAGTGCCAGCGTCACAGCCCCGTCCAGAATCTAAACCTGACTCTCAGATCCCACCACAAAGG  687

Query  889  CCTCAGCGGGATCAAAGAGTGCGAGAACAACGAATAAATATTCCTCCCCAAAGGGGACCCAGACCAATCCGTGA  962
            ||||||.|.|||||.|||||.|||||.||.|||||.|||||.|||||.||.||.||||||.|||||||||||||
Sbjct  688  CCTCAGAGAGATCAGAGAGTTCGAGAGCAGCGAATCAATATCCCTCCTCAGAGAGGACCCCGACCAATCCGTGA  761

Query  963  GGCTGGTGAGCAAGGTGACATTGAACCCCGAAGAATGGTGAGACACCCTGACAGTCACCAACTCTTCATTGGCA  1036
            |||||||||.|.|||.||..|.|||||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.|
Sbjct  762  GGCTGGTGAACCAGGAGATGTGGAACCTCGAAGGATGGTGAGGCACCCTGACAGTCACCAGCTCTTCATTGGGA  835

Query 1037  ACCTGCCTCATGAAGTGGACAAATCAGAGCTTAAAGATTTCTTTCAAAGTTATGGAAACGTGGTGGAGTTGCGC  1110
            |||||||.|||||.||.|||||.||.||.||.||.|||||.||.||||.||.|||.||.|||||||||.|||||
Sbjct  836  ACCTGCCACATGAGGTTGACAAGTCGGAACTGAAGGATTTTTTCCAAAATTTTGGCAATGTGGTGGAGCTGCGC  909

Query 1111  ATTAACAGTGGTGGGAAATTACCCAATTTTGGTTTTGTTGTGTTTGATGATTCTGAGCCTGTTCAGAAAGTCCT  1184
            ||.||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||
Sbjct  910  ATCAACAGTGGTGGGAAGTTACCCAATTTCGGTTTTGTTGTGTTTGATGATTCTGAACCTGTTCAGAAGGTCCT  983

Query 1185  TAGCAACAGGCCCATCATGTTCAGAGGTGAGGTCCGTCTGAATGTCGAAGAGAAGAAGACTCGAGCTGCCAGGG  1258
            |||.||.|||||||||||||||.||||.|.||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct  984  TAGTAATAGGCCCATCATGTTCCGAGGCGCGGTCCGCCTGAATGTGGAAGAGAAGAAGACTCGAGCTGCCAGAG  1057

Query 1259  AAGGCGACCGACGAGATAATCGCCTTCGGGGACCTGGAGGCCCTCGAGGTGGGCTGGGTGGTGGAATGAGAGGC  1332
            ||||||||||..|.|||||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||||.|.|||||||.|||||||||
Sbjct 1058  AAGGCGACCGCAGGGATAACCGCCTTCGGGGACCTGGAGGCCCCCGTGGTGGGCCGAGTGGTGGGATGAGAGGC  1131

Query 1333  CCTCCCCGTGGAGGCATGGTGCAGAAACCAGGATTTGGAGTGGGAAGGGGGCTT---GCGCCACGGCAG  1398
            ||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||||||.||   .|.|||.|||||
Sbjct 1132  CCTCCCCGCGGAGGCATGGTGCAGAAACCAGGCTTTGGCGTGGGCAGGGGGATTACAACTCCAAGGCAG  1200