Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_02332
• Subject: NM_001306070.1
• Aligned Length: 1145
• Identities: 1059
• Gaps: 70

Alignment

Query    1  ATGGCTTTGAACGTTGCCCCAGTCAGAGATACAAAATGGCTGACATTAGAAGTCTGCAGACAGTTTCAAAGAGG  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCTTTGAACGTTGCCCCAGTCAGAGATACAAAATGGCTGACATTAGAAGTCTGCAGACAGTTTCAAAGAGG  74

Query   75  AACATGCTCACGCTCTGATGAAGAATGCAAATTTGCTCATCCCCCCAAAAGTTGTCAGGTTGAAAATGGAAGAG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  AACATGCTCACGCTCTGATGAAGAATGCAAATTTGCTCATCCCCCCAAAAGTTGTCAGGTTGAAAATGGAAGAG  148

Query  149  TAATTGCCTGCTTTGATTCCCTAAAGGGCCGTTGTTCGAGAGAGAACTGCAAGTATCTTCACCCTCCGACACAC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TAATTGCCTGCTTTGATTCCCTAAAGGGCCGTTGTTCGAGAGAGAACTGCAAGTATCTTCACCCTCCGACACAC  222

Query  223  TTAAAAACTCAACTAGAAATTAATGGAAGGAACAATTTGATTCAGCAAAAAACTGCAGCAGCAATGCTTGCCCA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  TTAAAAACTCAACTAGAAATTAATGGAAGGAACAATTTGATTCAGCAAAAAACTGCAGCAGCAATGCTTGCCCA  296

Query  297  GCAGATGCAATTTATGTTTCCAGGAACACCACTTCATCCAGTGCCCACTTTCCCTGTAGGTCCCGCGATAGGGA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GCAGATGCAATTTATGTTTCCAGGAACACCACTTCATCCAGTGCCCACTTTCCCTGTAGGTCCCGCGATAGGGA  370

Query  371  CAAATACGGCTATTAGCTTTGCTCCTTACCTAGCACCTGTAACCCCTGGAGTTGGGTTGGTCCCAACGGAAATT  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CAAATACGGCTATTAGCTTTGCTCCTTACCTAGCACCTGTAACCCCTGGAGTTGGGTTGGTCCCAACGGAAATT  444

Query  445  CTGCCCACCACGCCTGTTATTGTTCCCGGAAGTCCACCGGTCACTGTCCCGGGCTCAACTGCAACTCAGAAACT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CTGCCCACCACGCCTGTTATTGTTCCCGGAAGTCCACCGGTCACTGTCCCGGGCTCAACTGCAACTCAGAAACT  518

Query  519  TCTCAGGACTGACAAACTGGAGGTATGCAGGGAGTTCCAGCGAGGAAACTGTGCCCGGGGAGAGACCGACTGCC  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TCTCAGGACTGACAAACTGGAGGTATGCAGGGAGTTCCAGCGAGGAAACTGTGCCCGGGGAGAGACCGACTGCC  592

Query  593  GCTTTGCACACCCCGCAGACAGCACCATGATCGACACAAGTGACAACACCGTAACCGTTTGTATGGATTACATA  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  GCTTTGCACACCCCGCAGACAGCACCATGATCGACACAAGTGACAACACCGTAACCGTTTGTATGGATTACATA  666

Query  667  AAGGGGCGTTGCATGAGGGAGAAATGCAAATATTTTCACCCTCCTGCACACTTGCAGGCCAAAATCAAAGCTGC  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  AAGGGGCGTTGCATGAGGGAGAAATGCAAATATTTTCACCCTCCTGCACACTTGCAGGCCAAAATCAAAGCTGC  740

Query  741  GCAGCACCAAGCCAACCAAGCTGCGGTGGCCGCCCAGGCAGCCGCGGCCGCGGCCACAGTCATGGCCTTTCCCC  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GCAGCACCAAGCCAACCAAGCTGCGGTGGCCGCCCAGGCAGCCGCGGCCGCGGCCACAGTCATGGCCTTTCCCC  814

Query  815  CTGGTGCTCTTCATCCTTTACCAAAGAGACAAGCACTTGAAAAAAGCAATGGTACCAGCGCGGTCTTTAACCCC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  CTGGTGCTCTTCATCCTTTACCAAAGAGACAAGCACTTGAAAAAAGCAATGGTACCAGCGCGGTCTTTAACCCC  888

Query  889  AGCGTCTTGCACTACCAGCAGGCTCTCACCAGCGCACAGTTGCAGCAACACGCCGCGTTCATTCCAACAGGGTC  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  AGCGTCTTGCACTACCAGCAGGCTCTCACCAGCGCACAGTTGCAGCAACACGCCGCGTTCATTCCAACAGGGTC  962

Query  963  AGTTTTGTGCATGACACCCGCTACCAGTATTG-TACCCATGATGCA-----CAGC-GCTACG--------TCCG  1021
            |||||||||||||||||||||||||||||||| ||   ||..||.|     |||| |..|||        |  |
Sbjct  963  AGTTTTGTGCATGACACCCGCTACCAGTATTGATA---ATTCTGAAATAATCAGCAGAAACGGAATGGAAT--G  1031

Query 1022  CCACTGTCTCTGC----AGCAACAAC----------TCCTGCA---ACAA----GTGTCC-CCTTCGCAGCAAC  1073
            ||| .|..|||||    || ||.|||          |.|||.|   ||.|    ||.||| |||      |||.
Sbjct 1032  CCA-AGAATCTGCATTGAG-AATAACTAAACATTGTTACTGTACATACTATCCTGTTTCCTCCT------CAAT  1097

Query 1074  A-----GCCACAGCCAATCAGATAATTCTGAAA--  1101
            |     ||||||   ||          |||.|.  
Sbjct 1098  AGAATTGCCACA---AA----------CTGCATGC  1119