Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_02332
• Subject: XM_006518373.1
• Aligned Length: 1184
• Identities: 953
• Gaps: 130

Alignment

Query    1  ATGGCTTTGAACGTTGCCCCAGTCAGAGATACAAAATGGCTGACATTAGAAGTCTGCAGACAGTTTCAAAGAGG  74
            |||||.||||||||||||||.||.|||||.|||||.||||||||..|.||.|||||||||||||..||.|||||
Sbjct    1  ATGGCCTTGAACGTTGCCCCCGTGAGAGACACAAAGTGGCTGACGCTGGAGGTCTGCAGACAGTACCAGAGAGG  74

Query   75  AACATGCTCACGCTCTGATGAAGAATGCAAATTTGCTCATCCCCCCAAAAGTTGTCAGGTTGAAAATGGAAGAG  148
            |||.|||||||||||.||.|||||||||||.||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct   75  AACGTGCTCACGCTCCGACGAAGAATGCAAGTTTGCTCACCCCCCCAAAAGTTGCCAGGTTGAAAATGGAAGAG  148

Query  149  TAATTGCCTGCTTTGATTCCCTAAAGGGCCGTTGTTCGAGAGAGAACTGCAAGTATCTTCACCCTCCGACACAC  222
            ||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.||||||||||||||.||||||||.||||||||||||
Sbjct  149  TAATTGCCTGCTTTGATTCCCTCAAGGGCCGCTGTTCAAGAGAGAACTGCAAATATCTTCATCCTCCGACACAC  222

Query  223  TTAAAAACTCAACTAGAAATTAATGGAAGGAACAATTTGATTCAGCAAAAAACTGCAGCAGCAATGCTTGCCCA  296
            ||||||||.||.|||||.||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct  223  TTAAAAACCCAGCTAGAGATTAATGGGAGGAACAATTTGATCCAGCAAAAAACTGCAGCAGCGATGCTTGCCCA  296

Query  297  GCAGATGCAATTTATGTTTCCAGGAACACCACTTCATCCAGTGCCCACTTTCCCTGTAGGTCCCGCGATAGGGA  370
            |||||||||||||||||||||||||||.||.||.|||||.|||||||||||.||||||||||||.|.|||||||
Sbjct  297  GCAGATGCAATTTATGTTTCCAGGAACGCCGCTCCATCCTGTGCCCACTTTTCCTGTAGGTCCCACCATAGGGA  370

Query  371  CAAATACGGCTATTAGCTTTGCTCCTTACCTAGCACCTGTAACCCCTGGAGTTGGGTTGGTCCCAACGGAAATT  444
            |||||.|||||||||||||||||||||||.||||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||.||..||
Sbjct  371  CAAATGCGGCTATTAGCTTTGCTCCTTACTTAGCGCCTGTCACCCCTGGAGTTGGGTTAGTCCCAACAGAGGTT  444

Query  445  CTGCCCACCACGCCTGTTATTGTTCCCGGAAGTCCACCGGTCACTGTCCCGGGCTCAACTGCAACTCAGAAACT  518
            ||.|||||.||.||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CTACCCACTACACCGGTCATTGTTCCCGGAAGTCCACCGGTCACTGTCCCGGGCTCAACTGCAACTCAGAAACT  518

Query  519  TCTCAGGACTGACAAACTGGAGGTATGCAGGGAGTTCCAGCGAGGAAACTGTGCCCGGGGAGAGACCGACTGCC  592
            ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct  519  TCTCAGGACTGATAAACTGGAGGTATGCAGGGAGTTCCAGCGAGGAAACTGTGCCCGGGGAGAGACAGACTGCC  592

Query  593  GCTTTGCACACCCCGCAGACAGCACCATGATCGACACAAGTGACAACACCGTAACCGTTTGTATGGATTACATA  666
            |||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||..|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  GCTTTGCACACCCGGCAGACAGCACCATGATCGACACAAACGACAACACCGTAACCGTTTGTATGGATTACATA  666

Query  667  AAGGGGCGTTGCATGAGGGAGAAATGCAAATATTTTCACCCTCCTGCACACTTGCAGGCCAAAATCAAAGCTGC  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  AAGGGGCGTTGCATGAGGGAGAAATGCAAATATTTTCACCCTCCTGCACACTTGCAGGCCAAAATCAAAGCTGC  740

Query  741  GCAGCACCAAGCCAACCAAGCTGCGGTGGCCGCCCAGGCAGCCGCGGCCGCGGCCACAGTCA------------  802
            ||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||            
Sbjct  741  GCAGCACCAAGCCAACCAGGCCGCGGTGGCCGCCCAGGCAGCCGCGGCCGCGGCCACAGTCATGACTCAGTCGA  814

Query  803  ------------------------------------------TGGCCTTTCCCCCTGGTGCTCTTCATCCTTTA  834
                                                      |||||||.||.||.||||||||||||||.|||
Sbjct  815  CTGCCAAAGCACTGAAGCGACCTCTCGAAGCAACTGTAGACCTGGCCTTCCCTCCGGGTGCTCTTCATCCCTTA  888

Query  835  CCAAAGAGACAAGCACTTGAAAAAAGCAATGGTACCAGCGCGGTCTTTAACCCCAGCGTCTTGCACTACCAGCA  908
            |||||||||||||||||||||||||||||.||..|||||.|||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CCAAAGAGACAAGCACTTGAAAAAAGCAACGGGGCCAGCACGGTCTTCAACCCCAGCGTCTTGCACTACCAGCA  962

Query  909  GGCTCTCACCAGCGCACAGTTGCAGCAACACGCCGCGTTCATTCCAACAGGGTCAGTTTTGTGCATGACACCCG  982
            ||||||.|||||.||.|||.|||||||.|||.|.||||||||.||.||||    |...||.||.|..|..|   
Sbjct  963  GGCTCTGACCAGTGCGCAGCTGCAGCAGCACACGGCGTTCATCCCCACAG----ATAATTCTGAAATAATC---  1029

Query  983  CTACCAGTATTGTACCCATG--ATGCACAGCGCTACGTCCGCCACTGTCTCTGC----AGCAACAACTCCTGCA  1050
              |.|||.|.||.|   |||  ||||..|                 |..|||||    || ||.||||    .|
Sbjct 1030  --AACAGAAATGGA---ATGGAATGCCAA-----------------GAATCTGCATTGAG-AATAACT----AA  1076

Query 1051  ACA-----AGTGT--------CCCC---TTCGCAGCAACA-----GCCACAGCCAATCAGATAATTCTGAAA--  1101
            |||     |.|||        ||||   |.|.|..|||.|     ||||||   ||          |||.|.  
Sbjct 1077  ACATTGTTACTGTACATATTACCCCGTTTCCTCCTCAATAGAATTGCCACA---AA----------CTGCATGC  1137