Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_02332
- Subject:
- XM_006518374.3
- Aligned Length:
- 1155
- Identities:
- 991
- Gaps:
- 90
Alignment
Query 1 ATGGCTTTGAACGTTGCCCCAGTCAGAGATACAAAATGGCTGACATTAGAAGTCTGCAGACAGTTTCAAAGAGG 74
|||||.||||||||||||||.||.|||||.|||||.||||||||..|.||.|||||||||||||..||.|||||
Sbjct 1 ATGGCCTTGAACGTTGCCCCCGTGAGAGACACAAAGTGGCTGACGCTGGAGGTCTGCAGACAGTACCAGAGAGG 74
Query 75 AACATGCTCACGCTCTGATGAAGAATGCAAATTTGCTCATCCCCCCAAAAGTTGTCAGGTTGAAAATGGAAGAG 148
|||.|||||||||||.||.|||||||||||.||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 75 AACGTGCTCACGCTCCGACGAAGAATGCAAGTTTGCTCACCCCCCCAAAAGTTGCCAGGTTGAAAATGGAAGAG 148
Query 149 TAATTGCCTGCTTTGATTCCCTAAAGGGCCGTTGTTCGAGAGAGAACTGCAAGTATCTTCACCCTCCGACACAC 222
||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.||||||||||||||.||||||||.||||||||||||
Sbjct 149 TAATTGCCTGCTTTGATTCCCTCAAGGGCCGCTGTTCAAGAGAGAACTGCAAATATCTTCATCCTCCGACACAC 222
Query 223 TTAAAAACTCAACTAGAAATTAATGGAAGGAACAATTTGATTCAGCAAAAAACTGCAGCAGCAATGCTTGCCCA 296
||||||||.||.|||||.||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 223 TTAAAAACCCAGCTAGAGATTAATGGGAGGAACAATTTGATCCAGCAAAAAACTGCAGCAGCGATGCTTGCCCA 296
Query 297 GCAGATGCAATTTATGTTTCCAGGAACACCACTTCATCCAGTGCCCACTTTCCCTGTAGGTCCCGCGATAGGGA 370
|||||||||||||||||||||||||||.||.||.|||||.|||||||||||.||||||||||||.|.|||||||
Sbjct 297 GCAGATGCAATTTATGTTTCCAGGAACGCCGCTCCATCCTGTGCCCACTTTTCCTGTAGGTCCCACCATAGGGA 370
Query 371 CAAATACGGCTATTAGCTTTGCTCCTTACCTAGCACCTGTAACCCCTGGAGTTGGGTTGGTCCCAACGGAAATT 444
|||||.|||||||||||||||||||||||.||||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||.||..||
Sbjct 371 CAAATGCGGCTATTAGCTTTGCTCCTTACTTAGCGCCTGTCACCCCTGGAGTTGGGTTAGTCCCAACAGAGGTT 444
Query 445 CTGCCCACCACGCCTGTTATTGTTCCCGGAAGTCCACCGGTCACTGTCCCGGGCTCAACTGCAACTCAGAAACT 518
||.|||||.||.||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 CTACCCACTACACCGGTCATTGTTCCCGGAAGTCCACCGGTCACTGTCCCGGGCTCAACTGCAACTCAGAAACT 518
Query 519 TCTCAGGACTGACAAACTGGAGGTATGCAGGGAGTTCCAGCGAGGAAACTGTGCCCGGGGAGAGACCGACTGCC 592
||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 519 TCTCAGGACTGATAAACTGGAGGTATGCAGGGAGTTCCAGCGAGGAAACTGTGCCCGGGGAGAGACAGACTGCC 592
Query 593 GCTTTGCACACCCCGCAGACAGCACCATGATCGACACAAGTGACAACACCGTAACCGTTTGTATGGATTACATA 666
|||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||..|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 GCTTTGCACACCCGGCAGACAGCACCATGATCGACACAAACGACAACACCGTAACCGTTTGTATGGATTACATA 666
Query 667 AAGGGGCGTTGCATGAGGGAGAAATGCAAATATTTTCACCCTCCTGCACACTTGCAGGCCAAAATCAAAGCTGC 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 AAGGGGCGTTGCATGAGGGAGAAATGCAAATATTTTCACCCTCCTGCACACTTGCAGGCCAAAATCAAAGCTGC 740
Query 741 GCAGCACCAAGCCAACCAAGCTGCGGTGGCCGCCCAGGCAGCCGCGGCCGCGGCCACAGTCA------------ 802
||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 GCAGCACCAAGCCAACCAGGCCGCGGTGGCCGCCCAGGCAGCCGCGGCCGCGGCCACAGTCATGACTCAGTCGA 814
Query 803 ------------------------------------------TGGCCTTTCCCCCTGGTGCTCTTCATCCTTTA 834
|||||||.||.||.||||||||||||||.|||
Sbjct 815 CTGCCAAAGCACTGAAGCGACCTCTCGAAGCAACTGTAGACCTGGCCTTCCCTCCGGGTGCTCTTCATCCCTTA 888
Query 835 CCAAAGAGACAAGCACTTGAAAAAAGCAATGGTACCAGCGCGGTCTTTAACCCCAGCGTCTTGCACTACCAGCA 908
|||||||||||||||||||||||||||||.||..|||||.|||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 CCAAAGAGACAAGCACTTGAAAAAAGCAACGGGGCCAGCACGGTCTTCAACCCCAGCGTCTTGCACTACCAGCA 962
Query 909 GGCTCTCACCAGCGCACAGTTGCAGCAACACGCCGCGTTCATTCCAACAGGGTCAGTTTTGTGCATGACACCCG 982
||||||.|||||.||.|||.|||||||.|||.|.||||||||.||.|||
Sbjct 963 GGCTCTGACCAGTGCGCAGCTGCAGCAGCACACGGCGTTCATCCCCACA------------------------- 1011
Query 983 CTACCAGTATTGTACCCATGATGCACAGCGCTACGTCCGCCACTGTCTCTGCAGCAACAACTCCTGCAACAAGT 1056
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1012 -----------GTACCCATGATGCACAGCGCTACGTCCGCCACTGTCTCTGCAGCAACAACTCCTGCAACAAGT 1074
Query 1057 GTCCCCTTCGCAGCAACAGCCACAGCCAATCAGATAATTCTGAAA 1101
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1075 GTCCCCTTCGCAGCAACAGCCACAGCCAATCAGATAATTCTGAAA 1119