Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_02338
- Subject:
- NM_001289763.2
- Aligned Length:
- 1137
- Identities:
- 957
- Gaps:
- 180
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGCCAGAAGGAAGAAGCCACTGTGCATGCTCTATCACCAGCCTCACCCTCCTGGTCAGCCTTACAAGAGTGAC 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 ACTGGATATACTCCAGAAGTTGGACCCACCACAGCCTGCACACTGGAGACACCATCTTCTTGTATTATACAAGA 148
Query 1 --------------------------------ATGCTCTTTTGGGTGCTAGGCCTCCTAATCCTCTGTGGTTTT 42
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 AAGGAGTGTACCTATCACACACAGGGGGAAAAATGCTCTTTTGGGTGCTAGGCCTCCTAATCCTCTGTGGTTTT 222
Query 43 CTGTGGACTCGTAAAGGAAAACTAAAGATTGAAGACATCACTGATAAGTACATTTTTATCACTGGATGTGACTC 116
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 CTGTGGACTCGTAAAGGAAAACTAAAGATTGAAGACATCACTGATAAGTACATTTTTATCACTGGATGTGACTC 296
Query 117 GGGCTTTGGAAACTTGGCAGCCAGAACTTTTGATAAAAAGGGATTTCATGTAATCGCTGCCTGTCTGACTGAAT 190
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 GGGCTTTGGAAACTTGGCAGCCAGAACTTTTGATAAAAAGGGATTTCATGTAATCGCTGCCTGTCTGACTGAAT 370
Query 191 CAGGATCAACAGCTTTAAAGGCAGAAACCTCAGAGAGACTTCGTACTGTGCTTCTGGATGTGACCGACCCAGAG 264
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 CAGGATCAACAGCTTTAAAGGCAGAAACCTCAGAGAGACTTCGTACTGTGCTTCTGGATGTGACCGACCCAGAG 444
Query 265 AATGTCAAGAGGACTGCCCAGTGGGTGAAGAACCAAGTTGGGGAGAAAGGTCTCTGGGGTCTGATCAATAATGC 338
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 AATGTCAAGAGGACTGCCCAGTGGGTGAAGAACCAAGTTGGGGAGAAAGGTCTCTGGGGTCTGATCAATAATGC 518
Query 339 TGGTGTTCCCGGCGTGCTGGCTCCCACTGACTGGCTGACACTAGAGGACTACAGAGAACCTATTGAAGTGAACC 412
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 TGGTGTTCCCGGCGTGCTGGCTCCCACTGACTGGCTGACACTAGAGGACTACAGAGAACCTATTGAAGTGAACC 592
Query 413 TGTTTGGACTCATCAGTGTGACACTAAATATGCTTCCTTTGGTCAAGAAAGCTCAAGGGAGAGTTATTAATGTC 486
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 TGTTTGGACTCATCAGTGTGACACTAAATATGCTTCCTTTGGTCAAGAAAGCTCAAGGGAGAGTTATTAATGTC 666
Query 487 TCCAGTGTTGGAGGTCGCCTTGCAATCGTTGGAGGGGGCTATACTCCATCCAAATATGCAGTGGAAGGTTTCAA 560
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 TCCAGTGTTGGAGGTCGCCTTGCAATCGTTGGAGGGGGCTATACTCCATCCAAATATGCAGTGGAAGGTTTCAA 740
Query 561 TGACAGCTTAAGACGGGACATGAAAGCTTTTGGTGTGCACGTCTCATGCATTGAACCAGGATTGTTCAAAACAA 634
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 TGACAGCTTAAGACGGGACATGAAAGCTTTTGGTGTGCACGTCTCATGCATTGAACCAGGATTGTTCAAAACAA 814
Query 635 ACTTGGCAGATCCAGTAAAGGTAATTGAAAAAAAACTCGCCATTTGGGAGCAGCTGTCTCCAGACATCAAACAA 708
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 ACTTGGCAGATCCAGTAAAGGTAATTGAAAAAAAACTCGCCATTTGGGAGCAGCTGTCTCCAGACATCAAACAA 888
Query 709 CAATATGGAGAAGGTTACATTGAAAAAAGTCTAGACAAACTGAAAGGCAATAAATCCTATGTGAACATGGACCT 782
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 CAATATGGAGAAGGTTACATTGAAAAAAGTCTAGACAAACTGAAAGGCAATAAATCCTATGTGAACATGGACCT 962
Query 783 CTCTCCGGTGGTAGAGTGCATGGACCACGCTCTAACAAGTCTCTTCCCTAAGACTCATTATGCCGCTGGAAAAG 856
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 CTCTCCGGTGGTAGAGTGCATGGACCACGCTCTAACAAGTCTCTTCCCTAAGACTCATTATGCCGCTGGAAAAG 1036
Query 857 ATGCCAAAATTTTCTGGATACCTCTGTCTCACATGCCAGCAGCTTTGCAAGACTTTTTATTGTTGAAACAGAAA 930
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 ATGCCAAAATTTTCTGGATACCTCTGTCTCACATGCCAGCAGCTTTGCAAGACTTTTTATTGTTGAAACAGAAA 1110
Query 931 GCAGAGCTGGCTAATCCCAAGGCAGTG 957
|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 GCAGAGCTGGCTAATCCCAAGGCAGTG 1137