Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroad304_02342
Subject:
NM_001286045.1
Aligned Length:
801
Identities:
798
Gaps:
3

Alignment

Query   1  ATGGGGGCGGCGGCGGCGGAAGCGGATCGCACTCTCTTTGTGGGCAACCTTGAAACGAAAGTGACCGAGGAGCT  74
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   1  ATGGGGGCGGCGGCGGCGGAAGCGGATCGCACTCTCTTTGTGGGCAACCTTGAAACGAAAGTGACCGAGGAGCT  74

Query  75  CCTTTTCGAGCTTTTCCACCAGGCTGGGCCAGTAATAAAGGTGAAAATTCCAAAAGATAAGGATGGTAAACCAA  148
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  75  CCTTTTCGAGCTTTTCCACCAGGCTGGGCCAGTAATAAAGGTGAAAATTCCAAAAGATAAGGATGGTAAACCAA  148

Query 149  AGCAGTTTGCGTTTGTGAATTTCAAACATGAAGTGTCTGTTCCTTATGCAATGAATCTACTTAATGGAATCAAA  222
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149  AGCAGTTTGCGTTTGTGAATTTCAAACATGAAGTGTCTGTTCCTTATGCAATGAATCTACTTAATGGAATCAAA  222

Query 223  CTTTATGGAAGGCCTATCAAAATTCAATTTAGATCAGGAAGTAGTCATGCCCCACAAGATGTCAGTTTGTCATA  296
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223  CTTTATGGAAGGCCTATCAAAATTCAATTTAGATCAGGAAGTAGTCATGCCCCACAAGATGTCAGTTTGTCATA  296

Query 297  TCCCCAACATCATGTTGGAAATTCAAGCCCTACCTCCACATCTCCT---AGCAGGTACGAAAGGACTATGGATA  367
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297  TCCCCAACATCATGTTGGAAATTCAAGCCCTACCTCCACATCTCCTAGCAGCAGGTACGAAAGGACTATGGATA  370

Query 368  ACATGACTTCATCAGCACAGATAATTCAGAGATCTTTCTCTTCTCCAGAAAATTTTCAGAGACAAGCAGTGATG  441
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371  ACATGACTTCATCAGCACAGATAATTCAGAGATCTTTCTCTTCTCCAGAAAATTTTCAGAGACAAGCAGTGATG  444

Query 442  AACAGTGCTTTGAGACAAATGTCATATGGTGGAAAATTTGGTTCTTCACCTCTGGATCAATCAGGATTTTCACC  515
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445  AACAGTGCTTTGAGACAAATGTCATATGGTGGAAAATTTGGTTCTTCACCTCTGGATCAATCAGGATTTTCACC  518

Query 516  ATCAGTTCAATCACACAGTCATAGTTTCAATCAGTCTTCAAGCTCCCAGTGGCGCCAAGGTACACCATCATCAC  589
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519  ATCAGTTCAATCACACAGTCATAGTTTCAATCAGTCTTCAAGCTCCCAGTGGCGCCAAGGTACACCATCATCAC  592

Query 590  AGCGTAAAGTCAGAATGAATTCTTATCCCTACCTAGCAGATAGACATTATAGCCGGGAACAGCGTTACACTGAT  663
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593  AGCGTAAAGTCAGAATGAATTCTTATCCCTACCTAGCAGATAGACATTATAGCCGGGAACAGCGTTACACTGAT  666

Query 664  CATGGGTCTGACCATCATTACAGAGGAAAGAGAGATGATTTCTTCTATGAAGACAGGAATCATGATGACTGGAG  737
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667  CATGGGTCTGACCATCATTACAGAGGAAAGAGAGATGATTTCTTCTATGAAGACAGGAATCATGATGACTGGAG  740

Query 738  CCATGACTATGATAACAGAAGAGACAGTAGTAGAGATGGAAAATGGCGCTCATCTCGACAC  798
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741  CCATGACTATGATAACAGAAGAGACAGTAGTAGAGATGGAAAATGGCGCTCATCTCGACAC  801