Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_02454
• Subject: NM_001350485.1
• Aligned Length: 1425
• Identities: 1422
• Gaps: 3

Alignment

Query    1  ATGGCTGACATGCAAAATCTGGTAGAAAGATTGGAGAGGGCAGTGGGCCGCCTGGAGGCAGTATCTCATACCTC  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCTGACATGCAAAATCTGGTAGAAAGATTGGAGAGGGCAGTGGGCCGCCTGGAGGCAGTATCTCATACCTC  74

Query   75  TGACATGCACCGTGGGTATGCAGACAGTCCTTCAAAAGCAGGAGCAGCTCCATATGTGCAGGCATTTGACTCGC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TGACATGCACCGTGGGTATGCAGACAGTCCTTCAAA---AGGAGCAGCTCCATATGTGCAGGCATTTGACTCGC  145

Query  149  TGCTTGCTGGTCCTGTGGCAGAGTACTTGAAGATCAGTAAAGAGATTGGGGGAGACGTGCAGAAACATGCGGAG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  146  TGCTTGCTGGTCCTGTGGCAGAGTACTTGAAGATCAGTAAAGAGATTGGGGGAGACGTGCAGAAACATGCGGAG  219

Query  223  ATGGTCCACACAGGTTTGAAGTTGGAGCGAGCTCTGTTGGTTACAGCTTCTCAGTGTCAACAGCCAGCAGAAAA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  220  ATGGTCCACACAGGTTTGAAGTTGGAGCGAGCTCTGTTGGTTACAGCTTCTCAGTGTCAACAGCCAGCAGAAAA  293

Query  297  TAAGCTTTCCGATTTGTTGGCACCCATCTCAGAGCAGATCAAAGAAGTGATAACCTTTCGGGAGAAGAACCGAG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  294  TAAGCTTTCCGATTTGTTGGCACCCATCTCAGAGCAGATCAAAGAAGTGATAACCTTTCGGGAGAAGAACCGAG  367

Query  371  GCAGCAAGTTGTTTAATCACCTGTCAGCTGTCAGCGAAAGTATCCAGGCCCTGGGCTGGGTGGCTATGGCTCCC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  368  GCAGCAAGTTGTTTAATCACCTGTCAGCTGTCAGCGAAAGTATCCAGGCCCTGGGCTGGGTGGCTATGGCTCCC  441

Query  445  AAGCCTGGCCCTTATGTGAAAGAAATGAATGATGCCGCCATGTTTTATACAAACCGAGTCCTCAAAGAGTACAA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  442  AAGCCTGGCCCTTATGTGAAAGAAATGAATGATGCCGCCATGTTTTATACAAACCGAGTCCTCAAAGAGTACAA  515

Query  519  AGATGTGGATAAGAAGCATGTAGACTGGGTCAAAGCTTATTTAAGTATATGGACAGAGCTGCAGGCTTACATTA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  516  AGATGTGGATAAGAAGCATGTAGACTGGGTCAAAGCTTATTTAAGTATATGGACAGAGCTGCAGGCTTACATTA  589

Query  593  AGGAGTTCCATACCACCGGACTGGCCTGGAGCAAAACGGGGCCTGTGGCAAAAGAACTGAGCGGACTGCCATCT  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  590  AGGAGTTCCATACCACCGGACTGGCCTGGAGCAAAACGGGGCCTGTGGCAAAAGAACTGAGCGGACTGCCATCT  663

Query  667  GGACCCTCTGCCGGATCAGGTCCTCCTCCCCCTCCACCAGGCCCCCCTCCTCCCCCAGTCTCTACCAGTTCAGG  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  664  GGACCCTCTGCCGGATCAGGTCCTCCTCCCCCTCCACCAGGCCCCCCTCCTCCCCCAGTCTCTACCAGTTCAGG  737

Query  741  CTCAGATGAGTCTGCTTCCCGCTCAGCACTGTTCGCGCAGATTAATCAGGGGGAGAGCATTACACATGCCCTGA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  738  CTCAGATGAGTCTGCTTCCCGCTCAGCACTGTTCGCGCAGATTAATCAGGGGGAGAGCATTACACATGCCCTGA  811

Query  815  AACATGTATCTGATGACATGAAGACTCACAAGAACCCTGCCCTGAAGGCTCAGAGTGGTCCAGTACGCAGTGGC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  812  AACATGTATCTGATGACATGAAGACTCACAAGAACCCTGCCCTGAAGGCTCAGAGTGGTCCAGTACGCAGTGGC  885

Query  889  CCCAAACCATTCTCTGCACCTAAACCCCAAACCAGCCCATCCCCCAAACGAGCCACAAAGAAGGAGCCAGCTGT  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  886  CCCAAACCATTCTCTGCACCTAAACCCCAAACCAGCCCATCCCCCAAACGAGCCACAAAGAAGGAGCCAGCTGT  959

Query  963  ACTTGAACTGGAGGGCAAGAAGTGGAGAGTGGAAAATCAGGAAAATGTTTCCAACCTGGTGATTGAGGACACAG  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  960  ACTTGAACTGGAGGGCAAGAAGTGGAGAGTGGAAAATCAGGAAAATGTTTCCAACCTGGTGATTGAGGACACAG  1033

Query 1037  AGCTGAAACAGGTGGCTTACATATACAAGTGTGTCAACACGACATTGCAAATCAAGGGCAAAATTAACTCCATT  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1034  AGCTGAAACAGGTGGCTTACATATACAAGTGTGTCAACACGACATTGCAAATCAAGGGCAAAATTAACTCCATT  1107

Query 1111  ACAGTAGATAACTGTAAGAAACTTGGCCTGGTATTCGATGACGTGGTGGGCATTGTGGAGATAATCAACAGTAA  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1108  ACAGTAGATAACTGTAAGAAACTTGGCCTGGTATTCGATGACGTGGTGGGCATTGTGGAGATAATCAACAGTAA  1181

Query 1185  GGATGTCAAAGTTCAGGTAATGGGTAAAGTGCCAACCATATCCATCAACAAAACAGATGGCTGCCATGCTTACC  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1182  GGATGTCAAAGTTCAGGTAATGGGTAAAGTGCCAACCATATCCATCAACAAAACAGATGGCTGCCATGCTTACC  1255

Query 1259  TGAGCAAGAATTCCCTGGATTGTGAAATAGTCAGTGCCAAATCTTCCGAGATGAATGTCCTCATTCCTACAGAA  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1256  TGAGCAAGAATTCCCTGGATTGTGAAATAGTCAGTGCCAAATCTTCCGAGATGAATGTCCTCATTCCTACAGAA  1329

Query 1333  GGCGGTGACTTTAATGAATTCCCAGTTCCTGAGCAGTTCAAGACCCTATGGAACGGGCAGAAGTTGGTCACCAC  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1330  GGCGGTGACTTTAATGAATTCCCAGTTCCTGAGCAGTTCAAGACCCTATGGAACGGGCAGAAGTTGGTCACCAC  1403

Query 1407  AGTGACAGAAATTGCTGGA  1425
            |||||||||||||||||||
Sbjct 1404  AGTGACAGAAATTGCTGGA  1422