Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_02454
- Subject:
- XM_006502697.3
- Aligned Length:
- 1425
- Identities:
- 1289
- Gaps:
- 3
Alignment
Query 1 ATGGCTGACATGCAAAATCTGGTAGAAAGATTGGAGAGGGCAGTGGGCCGCCTGGAGGCAGTATCTCATACCTC 74
||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||
Sbjct 1 ATGGCTGACATGCAAAATCTTGTAGAAAGATTGGAGAGGGCAGTGGGCCGCCTGGAGGCAGTGTCACATACTTC 74
Query 75 TGACATGCACCGTGGGTATGCAGACAGTCCTTCAAAAGCAGGAGCAGCTCCATATGTGCAGGCATTTGACTCGC 148
.|||||||||.||||.||||.||||||.|||||||| ||||||||.||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 75 AGACATGCACTGTGGATATGGAGACAGCCCTTCAAA---AGGAGCAGTTCCATATGTGCAAGCATTTGACTCGC 145
Query 149 TGCTTGCTGGTCCTGTGGCAGAGTACTTGAAGATCAGTAAAGAGATTGGGGGAGACGTGCAGAAACATGCGGAG 222
|||||||...|||.||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||.|||||||||||.||||||
Sbjct 146 TGCTTGCCAATCCCGTGGCAGAGTACTTGAAGATGAGTAAGGAGATCGGGGGAGATGTGCAGAAACACGCGGAG 219
Query 223 ATGGTCCACACAGGTTTGAAGTTGGAGCGAGCTCTGTTGGTTACAGCTTCTCAGTGTCAACAGCCAGCAGAAAA 296
||||||||||||||..|||||||||||||||||||..|||.|||||||||||||||.||.||||||||.|..||
Sbjct 220 ATGGTCCACACAGGCCTGAAGTTGGAGCGAGCTCTCCTGGCTACAGCTTCTCAGTGCCAGCAGCCAGCTGGTAA 293
Query 297 TAAGCTTTCCGATTTGTTGGCACCCATCTCAGAGCAGATCAAAGAAGTGATAACCTTTCGGGAGAAGAACCGAG 370
|||.|||||.||||||||||||||.|||||.|||||||||.|||||||.||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 294 TAAACTTTCTGATTTGTTGGCACCTATCTCGGAGCAGATCCAAGAAGTTATAACCTTCCGGGAGAAGAACCGAG 367
Query 371 GCAGCAAGTTGTTTAATCACCTGTCAGCTGTCAGCGAAAGTATCCAGGCCCTGGGCTGGGTGGCTATGGCTCCC 444
||||||||||.||||||||.||.||.||||||||.|||||.|||||||||.||||||||||||||.|||||.|.
Sbjct 368 GCAGCAAGTTTTTTAATCATCTATCTGCTGTCAGTGAAAGCATCCAGGCCTTGGGCTGGGTGGCTCTGGCTGCG 441
Query 445 AAGCCTGGCCCTTATGTGAAAGAAATGAATGATGCCGCCATGTTTTATACAAACCGAGTCCTCAAAGAGTACAA 518
||.||||||||.|.|||||||||.||||||||.||.|||||||||||.|||||.||.||||||||.|||||||.
Sbjct 442 AAACCTGGCCCCTTTGTGAAAGAGATGAATGACGCGGCCATGTTTTACACAAATCGTGTCCTCAAGGAGTACAG 515
Query 519 AGATGTGGATAAGAAGCATGTAGACTGGGTCAAAGCTTATTTAAGTATATGGACAGAGCTGCAGGCTTACATTA 592
|||||||||||||||||||||.||||||||||.||||||.||.|||||||||||.|||||||||||||||||.|
Sbjct 516 AGATGTGGATAAGAAGCATGTGGACTGGGTCAGAGCTTACTTGAGTATATGGACGGAGCTGCAGGCTTACATCA 589
Query 593 AGGAGTTCCATACCACCGGACTGGCCTGGAGCAAAACGGGGCCTGTGGCAAAAGAACTGAGCGGACTGCCATCT 666
|||||||.|||||.||.||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||.||||||||
Sbjct 590 AGGAGTTTCATACTACTGGCCTGGCCTGGAGCAAGACGGGGCCTGTGGCAAAAGAACTGAGTGGATTGCCATCT 663
Query 667 GGACCCTCTGCCGGATCAGGTCCTCCTCCCCCTCCACCAGGCCCCCCTCCTCCCCCAGTCTCTACCAGTTCAGG 740
||||||||||..||||||||.||.|||||.||.|||||.|||||.||||||||||||.|||||||||||||.||
Sbjct 664 GGACCCTCTGTGGGATCAGGCCCACCTCCTCCCCCACCGGGCCCGCCTCCTCCCCCAATCTCTACCAGTTCTGG 737
Query 741 CTCAGATGAGTCTGCTTCCCGCTCAGCACTGTTCGCGCAGATTAATCAGGGGGAGAGCATTACACATGCCCTGA 814
.||.||.||.|||||.||.||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||
Sbjct 738 TTCTGACGACTCTGCATCACGCTCAGCACTGTTTGCACAGATTAATCAGGGGGAAAGCATCACACATGCCCTGA 811
Query 815 AACATGTATCTGATGACATGAAGACTCACAAGAACCCTGCCCTGAAGGCTCAGAGTGGTCCAGTACGCAGTGGC 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||||||
Sbjct 812 AACATGTATCTGATGACATGAAGACTCACAAGAACCCTGCCCTGAAAGCTCAGAGTGGTCCAGTTCGGAGTGGC 885
Query 889 CCCAAACCATTCTCTGCACCTAAACCCCAAACCAGCCCATCCCCCAAACGAGCCACAAAGAAGGAGCCAGCTGT 962
||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||.|||||||||||||||.||||||.|
Sbjct 886 CCCAAACCATTCTCTGCACCTAAACCCCAAACTAGCCCCTCCCCCAAACCAGCCACAAAGAAGGAACCAGCTCT 959
Query 963 ACTTGAACTGGAGGGCAAGAAGTGGAGAGTGGAAAATCAGGAAAATGTTTCCAACCTGGTGATTGAGGACACAG 1036
.||.||||||||.||||||||.||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.||.|||||.|
Sbjct 960 GCTGGAACTGGAAGGCAAGAAATGGAGAGTGGAAAACCAGGAGAATGTTTCCAACCTGGTGATCGATGACACTG 1033
Query 1037 AGCTGAAACAGGTGGCTTACATATACAAGTGTGTCAACACGACATTGCAAATCAAGGGCAAAATTAACTCCATT 1110
|||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1034 AGCTGAAGCAGGTGGCTTACATCTACAAGTGTGTCAACACAACATTGCAAATCAAGGGCAAAATTAACTCCATT 1107
Query 1111 ACAGTAGATAACTGTAAGAAACTTGGCCTGGTATTCGATGACGTGGTGGGCATTGTGGAGATAATCAACAGTAA 1184
||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||.
Sbjct 1108 ACAGTAGATAACTGTAAGAAGCTTGGCCTGGTGTTTGATGACGTGGTGGGCATTGTGGAGATAATCAATAGTAG 1181
Query 1185 GGATGTCAAAGTTCAGGTAATGGGTAAAGTGCCAACCATATCCATCAACAAAACAGATGGCTGCCATGCTTACC 1258
||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1182 GGATGTCAAAGTTCAGGTGATGGGAAAAGTGCCAACCATTTCCATTAACAAAACAGATGGCTGCCATGCTTACC 1255
Query 1259 TGAGCAAGAATTCCCTGGATTGTGAAATAGTCAGTGCCAAATCTTCCGAGATGAATGTCCTCATTCCTACAGAA 1332
||||||||||.||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 1256 TGAGCAAGAACTCCCTGGACTGTGAGATAGTCAGTGCCAAATCTTCTGAGATGAATGTCCTCATTCCTACCGAA 1329
Query 1333 GGCGGTGACTTTAATGAATTCCCAGTTCCTGAGCAGTTCAAGACCCTATGGAACGGGCAGAAGTTGGTCACCAC 1406
||||||||.|||||.||.||||||||.||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 1330 GGCGGTGATTTTAACGAGTTCCCAGTCCCCGAGCAGTTCAAGACCCTGTGGAACGGACAGAAGTTGGTCACCAC 1403
Query 1407 AGTGACAGAAATTGCTGGA 1425
||||||||||||.||||||
Sbjct 1404 AGTGACAGAAATCGCTGGA 1422