Protein Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_02556
• Subject: NM_001166112.1
• Aligned Length: 1327
• Identities: 1300
• Gaps: 27

Alignment

Query    1  MEAPLQTGMVLGVMIGAGVAVVVTAVLILLVVRRLRVPKTPAPDGPRYRFRKRDKVLFYGRKIMRKVSQSTSSL  74
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Sbjct    1  MEAPLQTGMVLGVMIGAGVAVVVTAVLILLVVRRLRVPKTPAPDGPRYRFRKRDKVLFYGRKIMRKVSQSTSSL  74

Query   75  VDTSVSATSRPRMRKKLKMLNIAKKILRIQKETPTLQRKEPPPAVLEADLTEGDLANSHLPSEVLYMLKNVRVL  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  VDTSVSATSRPRMRKKLKMLNIAKKILRIQKETPTLQRKEPPPAVLEADLTEGDLANSHLPSEVLYMLKNVRVL  148

Query  149  GHFEKPLFLELCRHMVFQRLGQGDYVFRPGQPDASIYVVQDGLLELCLPGPDGKECVVKEVVPGDSVNSLLSIL  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GHFEKPLFLELCRHMVFQRLGQGDYVFRPGQPDASIYVVQDGLLELCLPGPDGKECVVKEVVPGDSVNSLLSIL  222

Query  223  DVITGHQHPQRTVSARAARDSTVLRLPVEAFSAVFTKYPESLVRVVQIIMVRLQRVTFLALHNYLGLTNELFSH  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  DVITGHQHPQRTVSARAARDSTVLRLPVEAFSAVFTKYPESLVRVVQIIMVRLQRVTFLALHNYLGLTNELFSH  296

Query  297  EIQPLRLFPSPGLPTRTSPVRGSKRMVSTSATDEPRETPGRPPDPTGAPLPGPTGDPVKPTSLETPSAPLLSRC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  EIQPLRLFPSPGLPTRTSPVRGSKRMVSTSATDEPRETPGRPPDPTGAPLPGPTGDPVKPTSLETPSAPLLSRC  370

Query  371  VSMPGDISGLQGGPRSDFDMAYERGRISVSLQEEASGGSLAAPARTPTQEPREQPAGACEYSYCEDESATGGCP  444
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Sbjct  371  VSMPGDISGLQGGPRSDFDMAYERGRISVSLQEEASGGSLAAPARTPTQEPREQPAGACEYSYCEDESATGGCP  444

Query  445  FGPYQGRQTSSIFEAAKQELAKLMRIEDPSLLNSRVLLHHAKAGTIIARQGDQDVSLHFVLWGCLHVYQRMIDK  518
            |||||||||||||||||||||||||||                          |||||||||||||||||||||
Sbjct  445  FGPYQGRQTSSIFEAAKQELAKLMRIE--------------------------DVSLHFVLWGCLHVYQRMIDK  492

Query  519  AEDVCLFVAQPGELVGQLAVLTGEPLIFTLRAQRDCTFLRISKSDFYEIMRAQPSVVLSAAHTVAARMSPFVRQ  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  493  AEDVCLFVAQPGELVGQLAVLTGEPLIFTLRAQRDCTFLRISKSDFYEIMRAQPSVVLSAAHTVAARMSPFVRQ  566

Query  593  MDFAIDWTAVEAGRALYRQGDRSDCTYIVLNGRLRSVIQRGSGKKELVGEYGRGDLIGVVEALTRQPRATTVHA  666
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Sbjct  567  MDFAIDWTAVEAGRALYRQGDRSDCTYIVLNGRLRSVIQRGSGKKELVGEYGRGDLIGVVEALTRQPRATTVHA  640

Query  667  VRDTELAKLPEGTLGHIKRRYPQVVTRLIHLLSQKILGNLQQLQGPFPAGSGLGVPPHSELTNPASNLATVAIL  740
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct  641  VRDTELAKLPEGTLGHIKRRYPQVVTRLIHLLSQKILGNLQQLQGPFP-GSGLGVPPHSELTNPASNLATVAIL  713

Query  741  PVCAEVPMVAFTLELQHALQAIGPTLLLNSDIIRARLGASALDSIQEFRLSGWLAQQEDAHRIVLYQTDASLTP  814
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Sbjct  714  PVCAEVPMVAFTLELQHALQAIGPTLLLNSDIIRARLGASALDSIQEFRLSGWLAQQEDAHRIVLYQTDASLTP  787

Query  815  WTVRCLRQADCILIVGLGDQEPTLGQLEQMLENTAVRALKQLVLLHREEGAGPTRTVEWLNMRSWCSGHLHLRC  888
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Sbjct  788  WTVRCLRQADCILIVGLGDQEPTLGQLEQMLENTAVRALKQLVLLHREEGAGPTRTVEWLNMRSWCSGHLHLRC  861

Query  889  PRRLFSRRSPAKLHELYEKVFSRRADRHSDFSRLARVLTGNTIALVLGGGGARGCSHIGVLKALEEAGVPVDLV  962
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Sbjct  862  PRRLFSRRSPAKLHELYEKVFSRRADRHSDFSRLARVLTGNTIALVLGGGGARGCSHIGVLKALEEAGVPVDLV  935

Query  963  GGTSIGSFIGALYAEERSASRTKQRAREWAKSMTSVLEPVLDLTYPVTSMFTGSAFNRSIHRVFQDKQIEDLWL  1036
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Sbjct  936  GGTSIGSFIGALYAEERSASRTKQRAREWAKSMTSVLEPVLDLTYPVTSMFTGSAFNRSIHRVFQDKQIEDLWL  1009

Query 1037  PYFNVTTDITASAMRVHKDGSLWRYVRASMTLSGYLPPLCDPKDGHLLMDGGYINNLPADIARSMGAKTVIAID  1110
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Sbjct 1010  PYFNVTTDITASAMRVHKDGSLWRYVRASMTLSGYLPPLCDPKDGHLLMDGGYINNLPADIARSMGAKTVIAID  1083

Query 1111  VGSQDETDLSTYGDSLSGWWLLWKRLNPWADKVKVPDMAEIQSRLAYVSCVRQLEVVKSSSYCEYLRPPIDCFK  1184
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Sbjct 1084  VGSQDETDLSTYGDSLSGWWLLWKRLNPWADKVKVPDMAEIQSRLAYVSCVRQLEVVKSSSYCEYLRPPIDCFK  1157

Query 1185  TMDFGKFDQIYDVGYQYGKAVFGGWSRGNVIEKMLTDRRSTDLNESRRADVLAFPSSGFTDLAEIVSRIEPPTS  1258
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Sbjct 1158  TMDFGKFDQIYDVGYQYGKAVFGGWSRGNVIEKMLTDRRSTDLNESRRADVLAFPSSGFTDLAEIVSRIEPPTS  1231

Query 1259  YVSDGCADGEESDCLTEYEEDAGPDCSRDEGGSPEGASPSTASEMEEEKSILRQRRCLPQEPPGSATDA  1327
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Sbjct 1232  YVSDGCADGEESDCLTEYEEDAGPDCSRDEGGSPEGASPSTASEMEEEKSILRQRRCLPQEPPGSATDA  1300