Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_02564
• Subject: NM_011462.3
• Aligned Length: 790
• Identities: 658
• Gaps: 74

Alignment

Query   1  ATGAAGACCCCATTCGGAAAGACACCTGGCCAGCGGTCCAGAGCTGATGCAGGCCATGCTGGAGTATCTGC--C  72
                                                         ||   ||||           |||||  |
Sbjct   1  ----------------------------------------------AT---GGCC-----------TCTGCGTC  14

Query  73  AA--CATGATGAAGAAGAGGACATCCCACAAAAAACATCGGAGCAGTGTGGGTCCGAGCAAACCTGTTTCCCAG  144
           ||  |.||.|          .|.|.||.||.|||||||||||.|||||||||.||.|||||.|||||.|||||.
Sbjct  15  AAGTCCTGCT----------TCCTGCCCCAGAAAACATCGGACCAGTGTGGGACCAAGCAAGCCTGTGTCCCAA  78

Query 145  CCCCGGCGGAACATCGTAGGCTGCAGGATTCAGCATGGGTGGAAAGAGGGGAATGGCCCTGTTACCCAGTGGAA  218
           |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||.||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct  79  CCCCGGCGGAACATCGTAGGCTGCAGGATCCAGCATGGATGGAGAGAGGGCAATGGCCCTGTTACCCAGTGGAA  152

Query 219  AGGAACCGTTCTGGACCAGGTGCCTGTAAATCCTTCTTTGTATCTTATAAAATACGATGGATTTGACTGTGTTT  292
           .||.||.||.|||||||||||||||||.||||||||..|||||||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 153  GGGGACTGTCCTGGACCAGGTGCCTGTGAATCCTTCCCTGTATCTTATAAAGTACGATGGATTTGACTGTGTTT  226

Query 293  ATGGACTAGAACTTAATAAAGATGAAAGAGTTTCTGCGCTTGAAGTCCTCCCTGATAGAGTTGCGACATCTCGA  366
           |||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.
Sbjct 227  ATGGACTAGAACTTAATAAGGATGAAAGAGTTTCTGCACTGGAAGTCCTCCCTGATAGAGTTGCAACATCTCGG  300

Query 367  ATCAGCGATGCACACTTGGCAGACACAATGATTGGCAAAGCAGTGGAACATATGTTTGAGACAGAGGATGGTTC  440
           |||||||||||||||||.||.|||||||||||.||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.||.||
Sbjct 301  ATCAGCGATGCACACTTAGCGGACACAATGATCGGCAAAGCAGTGGAGCACATGTTTGAGACAGAGGACGGCTC  374

Query 441  TAAAGATGAGTGGAGGGGAATGGTCTTAGCACGTGCACCTGTCATGAACACATGGTTTTACATTACCTATGAGA  514
           ||||||||||||||||||.||||||||.|||||.||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 375  TAAAGATGAGTGGAGGGGGATGGTCTTGGCACGGGCGCCTGTCATGAACACATGGTTTTACATCACCTATGAGA  448

Query 515  AAGACCCTGTCTTGTACATGTACCAACTCTTAGATGATTACAAAGAAGGCGACCTTCGCATTATGCCTGATTCC  588
           |||||||||||||||||||||||||.|||.|.|||||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||||||
Sbjct 449  AAGACCCTGTCTTGTACATGTACCAGCTCCTCGATGACTACAAAGAAGGCGACCTCCGCATCATGCCTGATTCC  522

Query 589  AATGATTCACCTCCAGCAGAAAGGGAACCAGGAGAAGTTGTGGACAGCCTGGTAGGCAAACAAGTGGAATATGC  662
           ||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 523  AATGATTCGCCTCCAGCAGAAAGGGAGCCAGGAGAAGTTGTGGACAGCCTGGTAGGCAAGCAAGTGGAATATGC  596

Query 663  CAAAGAAGATGGCTCGAAAAGGACTGGCATGGTCATTCATCAAGTAGAAGCCAAGCCCTCCGTCTATTTCATCA  736
           |||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 597  CAAAGAAGACGGCTCGAAAAGGACTGGCATGGTCATCCACCAAGTAGAGGCCAAGCCCTCTGTCTATTTCATCA  670

Query 737  AGTTTGATGATGATTTCCATATTTATGTCTACGATTTGGTGAAAACATCC  786
           ||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 671  AGTTTGATGACGATTTCCATATTTACGTCTACGATTTGGTGAAAACATCC  720