Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_02585
• Subject: NM_012002.3
• Aligned Length: 981
• Identities: 907
• Gaps: 9

Alignment

Query   1  ATGGCGGCGGCGGCGGCGGCGGCTGCAGCTACGAACGGGACCGGAGGAAGCAGCGGGATGGAGGTGGATGCAGC  74
           |||||||||||.||.|||||||..|      ||||.||||.||||||.||||||||.|||||.|||||||||||
Sbjct   1  ATGGCGGCGGCAGCTGCGGCGGGGG------CGAATGGGAGCGGAGGCAGCAGCGGCATGGAAGTGGATGCAGC  68

Query  75  AGTAGTCCCCAGCGTGATGGCCTGCGGAGTGACTGGGAGTGTTTCCGTCGCTCTCCATCCCCTTGTCATTCTCA  148
              ||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||.|
Sbjct  69  ---AGTCCCCAGCGTGATGGCCTCCGGAGTGACTGGGAGTGTTTCCGTCGCTCTTCATCCCCTTGTCATCCTTA  139

Query 149  ACATCTCAGACCACTGGATCCGCATGCGCTCCCAGGAGGGGCGGCCTGTGCAGGTGATTGGGGCTCTGATTGGC  222
           |||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||.||.
Sbjct 140  ACATCTCAGACCATTGGATCCGCATGCGCTCCCAGGAGGGGCGGCCTATGCAGGTGATTGGGGCTCTGATCGGG  213

Query 223  AAGCAGGAGGGCCGAAATATCGAGGTGATGAACTCCTTTGAGCTGCTGTCCCACACCGTGGAAGAGAAGATTAT  296
           |||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 214  AAGCAGGAGGGGCGAAATATCGAAGTGATGAACTCCTTTGAGCTGCTGTCCCACACCGTGGAAGAGAAGATTAT  287

Query 297  CATTGACAAGGAATATTATTACACCAAGGAGGAGCAGTTTAAACAGGTGTTCAAGGAGCTGGAGTTTCTGGGTT  370
           |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 288  CATTGACAAAGAATATTATTACACCAAGGAGGAGCAGTTTAAACAGGTTTTCAAGGAGCTGGAGTTTCTGGGTT  361

Query 371  GGTATACCACAGGGGGGCCACCTGACCCCTCGGACATCCACGTCCATAAGCAGGTGTGTGAGATCATCGAGAGC  444
           |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.
Sbjct 362  GGTATACCACAGGGGGGCCACCTGACCCCTCAGACATCCACGTCCATAAGCAGGTGTGTGAGATAATTGAGAGT  435

Query 445  CCCCTCTTTCTGAAGTTGAACCCTATGACCAAGCACACAGATCTTCCTGTCAGCGTTTTTGAGTCTGTCATTGA  518
           ||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 436  CCGCTCTTTCTGAAGTTGAACCCTATGACCAAGCACACAGATCTTCCTGTCAGCGTTTTTGAGTCTGTCATCGA  509

Query 519  TATAATCAATGGAGAGGCCACAATGCTGTTTGCTGAGCTGACCTACACTCTGGCCACAGAGGAAGCGGAACGCA  592
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.||||||||.|||||.|
Sbjct 510  TATAATCAATGGAGAGGCCACAATGCTGTTTGCTGAGCTCACTTACACTCTGGCCACTGAGGAAGCTGAACGGA  583

Query 593  TTGGTGTAGACCACGTAGCCCGAATGACAGCAACAGGCAGTGGAGAGAACTCCACTGTGGCTGAACACCTGATA  666
           |.||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 584  TCGGTGTAGACCACGTGGCCCGGATGACAGCAACAGGCAGTGGGGAGAACTCCACTGTGGCTGAACACCTGATA  657

Query 667  GCACAGCACAGCGCCATCAAGATGCTGCACAGCCGCGTCAAGCTCATCTTGGAGTACGTCAAGGCCTCTGAAGC  740
           ||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||.||.||.|||||||||||||||||
Sbjct 658  GCTCAGCATAGTGCCATCAAGATGCTGCACAGCCGTGTGAAGCTCATTTTAGAATATGTCAAGGCCTCTGAAGC  731

Query 741  GGGAGAGGTCCCCTTTAATCATGAGATCCTGCGGGAGGCCTATGCTCTGTGTCACTGTCTCCCGGTGCTCAGCA  814
           .||||||||.|||||.||.||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.||.||.|||||||
Sbjct 732  AGGAGAGGTTCCCTTCAACCATGAGATCCTGCGGGAGGCCTATGCCCTATGTCACTGTCTTCCAGTTCTCAGCA  805

Query 815  CAGACAAGTTCAAGACAGATTTTTATGATCAATGCAACGACGTGGGGCTCATGGCCTACCTCGGCACCATCACC  888
           |.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 806  CTGACAAGTTCAAGACAGACTTTTATGATCAATGCAATGACGTGGGGCTCATGGCCTACCTCGGCACCATCACC  879

Query 889  AAAACGTGCAACACCATGAACCAGTTTGTGAACAAGTTCAATGTCCTCTACGACCGACAAGGCATCGGCAGGAG  962
           ||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||.||.|
Sbjct 880  AAAACGTGCAACACAATGAACCAGTTTGTGAACAAGTTCAACGTCCTCTACGACCGACAAGGCATTGGCCGGCG  953

Query 963  AATGCGCGGGCTCTTTTTC  981
           ||||||.||.||.||||||
Sbjct 954  AATGCGGGGACTGTTTTTC  972