Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_02599
- Subject:
- XM_017026183.2
- Aligned Length:
- 2025
- Identities:
- 1288
- Gaps:
- 603
Alignment
Query 1 ATGACCCCCATCGTCACAGTCCTGATCTGTCTCAGGCTGAGTCTGGGCCCCCGGACCCACGTGCAGGCAGGGAC 74
||||||||||||.||||.|||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..
Sbjct 1 ATGACCCCCATCCTCACGGTCCTGATCTGTCTCGGGCTGAGTCTGGGCCCCCGGACCCACGTGCAGGCAGGGCA 74
Query 75 CCTCCCCAAGCCCACACTCTGGGCTGAGCCAGGCTCTGTGATCACCCAGGGGAGTCCCGTGACCCTCTGGTGTC 148
|||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||.||||||
Sbjct 75 CCTCCCCAAGCCCACCCTCTGGGCTGAACCAGGCTCTGTGATCACCCAGGGGAGTCCTGTGACCCTCAGGTGTC 148
Query 149 AGGGGATCCTGGAGACCCAGGAGTACCGTCTGTATAGAGAAAAGAAAACAGCACCCTGGATTACACGGATCCCA 222
|||||..||.|||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 AGGGGGGCCAGGAGACCCAGGAGTACCGTCTATATAGAGAAAAGAAAACAGCACCCTGGATTACACGGATCCCA 222
Query 223 CAGGAGATTGTGAAGAAGGGCCAGTTCCCCATCCCATCCATCACCTGGGAACACACAGGGCGGTATCGCTGTTT 296
||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 223 CAGGAGCTTGTGAAGAAGGGCCAGTTCCCCATCCCATCCATCACCTGGGAACACACAGGGCGGTATCGCTGTTA 296
Query 297 CTACGGTAGCCACACTGCAGGCTGGTCAGAGCCCAGTGACCCCCTGGAGCTGGTGGTGACAGGAGCCTACATCA 370
|||.||||||.|||||||||||.|.||||||..|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 CTATGGTAGCGACACTGCAGGCCGCTCAGAGAGCAGTGACCCCCTGGAGCTGGTGGTGACAGGAGCCTACATCA 370
Query 371 AACCCACCCTCTCAGCTCTACCCAGCCCTGTGGTGACCTCAGGAGGGAACGTGACCCTCCATTGTGTCTCACAG 444
||||||||||||||||.|..||||||||.|||||||.||||||||||||.||.||||||||.||||.|||||||
Sbjct 371 AACCCACCCTCTCAGCCCAGCCCAGCCCCGTGGTGAACTCAGGAGGGAATGTAACCCTCCAGTGTGACTCACAG 444
Query 445 GTGGCATTTGGCAGCTTCATTCTGTGTAAGGAAGGAGAAGATGAACACCCACAATGCCTGAACTCACAGCCCCG 518
||||||||||...||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||.
Sbjct 445 GTGGCATTTGATGGCTTCATTCTGTGTAAGGAAGGAGAAGATGAACACCCACAATGCCTGAACTCCCAGCCCCA 518
Query 519 TACCCATGGGTGGTCCCGGGCCATCTTCTCTGTGGGCCCCGTGAGCCCGAGTCGCAGGTGGTCGTACAGGTGCT 592
|.|||.|||||.||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 519 TGCCCGTGGGTCGTCCCGCGCCATCTTCTCCGTGGGCCCCGTGAGCCCGAGTCGCAGGTGGTGGTACAGGTGCT 592
Query 593 ATGCTTATGACTCGAACTCTCCCCATGTGTGGTCTCTACCCAGTGATCTCCTGGAGCTCCTGGTCCTAGGTGTT 666
|||||||||||||||||||||||.|||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 ATGCTTATGACTCGAACTCTCCCTATGAGTGGTCTCTACCCAGTGATCTCCTGGAGCTCCTGGTCCTAGGTGTT 666
Query 667 TCTAAGAAGCCATCACTCTCAGTGCAGCCAGGTCCTATAGTGGCCCCTGGGGAGAGCCTGACCCTCCAGTGTGT 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||.|||||.||||||.||.|||||||.
Sbjct 667 TCTAAGAAGCCATCACTCTCAGTGCAGCCAGGTCCTATCGTGGCCCCTGAGGAGACCCTGACTCTGCAGTGTGG 740
Query 741 TTCTGATGTCAGCTACGACAGATTTGTTCTGTATAAGGAGGGAGAACGTGACTTCCTCCAGCTCCCTGGCCCAC 814
.|||||||...|||||.||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.||||||.|||||.|||
Sbjct 741 CTCTGATGCTGGCTACAACAGATTTGTTCTGTATAAGGACGGGGAACGTGACTTCCTTCAGCTCGCTGGCGCAC 814
Query 815 AGCCCCAGGCTGGGCTCTCCCAGGCCAACTTCACCCTGGGCCCTGTGAGCCGCTCCTACGGGGGCCAGTACAGA 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 AGCCCCAGGCTGGGCTCTCCCAGGCCAACTTCACCCTGGGCCCTGTGAGCCGCTCCTACGGGGGCCAGTACAGA 888
Query 889 TGCTCCGGTGCATACAACCTCTCCTCCGAGTGGTCGGCCCCCAGCGACCCCCTGGACATCCTGATCG------- 955
||||.|||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 TGCTACGGTGCACACAACCTCTCCTCCGAGTGGTCGGCCCCCAGCGACCCCCTGGACATCCTGATCGCAGCCCC 962
Query 956 --------------------CAGGACAGTTCCGTGGCAGACCCTTCATCTCGGTGCATCCGGGCCCCACGGTGG 1009
|||||||||||..||.||||..||.|.||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 963 TCGCCCATCCTTCTTCTCTCCAGGACAGTTCTATGACAGAGTCTCCCTCTCGGTGCAGCCGGGCCCCACGGTGG 1036
Query 1010 CCTCAGGAGAGAACGTGACCCTGCTGTGTCAGTCATGGGGGCCGTTCCACACTTTCCTTCTGACCAAGGCGGGA 1083
|||||||||||||||||||||||||||||||||||..|||...|.|.||.|||||||||||||||||||.|||.
Sbjct 1037 CCTCAGGAGAGAACGTGACCCTGCTGTGTCAGTCACAGGGATGGATGCAAACTTTCCTTCTGACCAAGGAGGGG 1110
Query 1084 GCAGCTGATGCCCCCCTCCGTCTCAGATCAATACACGAATATCCTAAGTACCAGGCTGAATTCCCTATGAGTCC 1157
||||||||||.|||....|||||.|||||||...||.|||.||..||.|||||||||||||||||.|||.||||
Sbjct 1111 GCAGCTGATGACCCATGGCGTCTAAGATCAACGTACCAATCTCAAAAATACCAGGCTGAATTCCCCATGGGTCC 1184
Query 1158 TGTGACCTCAGCCCACTCGGGGACCTACAGGTGCTACGGCTCACTCAGCTCCAACCCCTACCTGCTGTCTCACC 1231
|||||||||||||||..|||||||||||||||||||||||||||..||||||||.||||||||||||.||||||
Sbjct 1185 TGTGACCTCAGCCCATGCGGGGACCTACAGGTGCTACGGCTCACAGAGCTCCAAACCCTACCTGCTGACTCACC 1258
Query 1232 CCAGTGACTCCCTGGAGCTCATGGTCTCAGGAGCAGCTGAGACCCTCAGC-CCACCACAAAACAAGTCCGA-TT 1303
||||||||.|||||||||||.|||||||||||.|..|||.|..||.|||| ||.|.|| ||||.|.||.| .|
Sbjct 1259 CCAGTGACCCCCTGGAGCTCGTGGTCTCAGGACCGTCTGGGGGCCCCAGCTCCCCGAC--AACAGGCCCCACCT 1330
Query 1304 CCAAGGCTGGAGCAGCTAACACCCT------CAGCCCATCACAAAACAAGACTGCCTCAC--------ACCCCC 1363
|||...|||| |||| ||||||.|||| ||.||| |.||||
Sbjct 1331 CCACATCTGG-----------CCCTGAGGACCAGCCCCTCAC------------CCCCACCGGGTCGGATCCCC 1381
Query 1364 AGGATTACACAGTGGAGAATCT-------CATCCG--------CATGGGCATAGCTGGCTTGG---------TC 1413
|| ||||| ||| ||.|.| .||.||||| ||||| ||
Sbjct 1382 AG--------AGTGG----TCTGGGAAGGCACCTGGGGGTTGTGATCGGCAT------CTTGGTGGCCGTCATC 1437
Query 1414 CTGGTGGTCCTC-----------------------------------------GGG---ATTCT---------- 1433
||..||.||||| ||| |..||
Sbjct 1438 CTACTGCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCTTCCTCATCCTCCGACATCGACGTCAGGGCAAACACTGGACATCGAC 1511
Query 1434 ----------GCT-ATTT-------------GAGGCT-------CAG----CACAGCCAGAGAAGCCTC----- 1467
||| |||| |.|||| ||| |||||.||||| ||||.
Sbjct 1512 CCAGAGAAAGGCTGATTTCCAACATCCTGCAGGGGCTGTGGGGCCAGAGCCCACAGACAGAG--GCCTGCAGTG 1583
Query 1468 -------------------------------------------------------------------------- 1467
Sbjct 1584 GAGGTCCAGCCCAGCTGCCGATGCCCAGGAAGAAAACCTCTATGCTGCCGTGAAGCACACACAGCCTGAGGATG 1657
Query 1468 -------------------------------------------------------------------------- 1467
Sbjct 1658 GGGTGGAGATGGACACTCGGCAGAGCCCACACGATGAAGACCCCCAGGCAGTGACGTATGCCGAGGTGAAACAC 1731
Query 1468 -------------------------------------------------------------------------- 1467
Sbjct 1732 TCCAGACCTAGGAGAGAAATGGCCTCTCCTCCTTCCCCACTGTCTGGGGAATTCCTGGACACAAAGGACAGACA 1805
Query 1468 -------------------------------------------------------------------------- 1467
Sbjct 1806 GGCGGAAGAGGACAGGCAGATGGACACTGAGGCTGCTGCATCTGAAGCCCCCCAGGATGTGACCTACGCCCAGC 1879
Query 1468 -------------------------------------------------------------------------- 1467
Sbjct 1880 TGCACAGCTTGACCCTCAGACGGGAGGCAACTGAGCCTCCTCCATCCCAGGAAGGGCCCTCTCCAGCTGTGCCC 1953
Query 1468 --------------------------- 1467
Sbjct 1954 AGCATCTACGCCACTCTGGCCATCCAC 1980