Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_02599
- Subject:
- XR_935716.2
- Aligned Length:
- 1770
- Identities:
- 1195
- Gaps:
- 461
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 TCTTCCCTATTTCCCTGCATTTCTCTTCTGTGCTCACTGCCACACGCAGCTCAGCCTGGGCGGCACAGCCAGAT 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 GCGAGATGCGTCTCTGCTGATCTGAGTCTGCCTGCAGCATGGACCTGGGTCTTCCCTGAAGCATCTCCAGGGCT 148
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 149 GGAGGGACGACTGCCATGATGACAGCACCCCATGAGAAGAAGGACCCAGCCTCCGATTGGCCACACTCTGTGTG 222
Query 1 -----------------------------------------------------------------ATGACCCCC 9
|||||||||
Sbjct 223 TCTCTCTATCCTGCCAGCACCGAGGGCTCATCCATCCACAGAGCAGGGCAGTGGGAGGAGACGCCATGACCCCC 296
Query 10 ATCGTCACAGTCCTGATCTGTCTCAGGCTGAGTCTGGGCCCCCGGACCCACGTGCAGGCAGGGACCCTCCCCAA 83
|||.||||.|||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..|||||||||
Sbjct 297 ATCCTCACGGTCCTGATCTGTCTCGGGCTGAGTCTGGGCCCCCGGACCCACGTGCAGGCAGGGCACCTCCCCAA 370
Query 84 GCCCACACTCTGGGCTGAGCCAGGCTCTGTGATCACCCAGGGGAGTCCCGTGACCCTCTGGTGTCAGGGGATCC 157
||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||.|||||||||||..||
Sbjct 371 GCCCACCCTCTGGGCTGAACCAGGCTCTGTGATCACCCAGGGGAGTCCTGTGACCCTCAGGTGTCAGGGGGGCC 444
Query 158 TGGAGACCCAGGAGTACCGTCTGTATAGAGAAAAGAAAACAGCACCCTGGATTACACGGATCCCACAGGAGATT 231
.|||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 445 AGGAGACCCAGGAGTACCGTCTATATAGAGAAAAGAAAACAGCACCCTGGATTACACGGATCCCACAGGAGCTT 518
Query 232 GTGAAGAAGGGCCAGTTCCCCATCCCATCCATCACCTGGGAACACACAGGGCGGTATCGCTGTTTCTACGGTAG 305
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||.|||||
Sbjct 519 GTGAAGAAGGGCCAGTTCCCCATCCCATCCATCACCTGGGAACACACAGGGCGGTATCGCTGTTACTATGGTAG 592
Query 306 CCACACTGCAGGCTGGTCAGAGCCCAGTGACCCCCTGGAGCTGGTGGTGACAGGAGCCTACATCAAACCCACCC 379
|.|||||||||||.|.||||||..||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 CGACACTGCAGGCCGCTCAGAGAGCAGTGACCCCCTGGAGCTGGTGGTGACAGGAGCCTACATCAAACCCACCC 666
Query 380 TCTCAGCTCTACCCAGCCCTGTGGTGACCTCAGGAGGGAACGTGACCCTCCATTGTGTCTCACAGGTGGCATTT 453
|||||||.|..||||||||.|||||||.||||||||||||.||.||||||||.||||.||||||||||||||||
Sbjct 667 TCTCAGCCCAGCCCAGCCCCGTGGTGAACTCAGGAGGGAATGTAACCCTCCAGTGTGACTCACAGGTGGCATTT 740
Query 454 GGCAGCTTCATTCTGTGTAAGGAAGGAGAAGATGAACACCCACAATGCCTGAACTCACAGCCCCGTACCCATGG 527
|...||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||.|.|||.|||
Sbjct 741 GATGGCTTCATTCTGTGTAAGGAAGGAGAAGATGAACACCCACAATGCCTGAACTCCCAGCCCCATGCCCGTGG 814
Query 528 GTGGTCCCGGGCCATCTTCTCTGTGGGCCCCGTGAGCCCGAGTCGCAGGTGGTCGTACAGGTGCTATGCTTATG 601
||.||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 815 GTCGTCCCGCGCCATCTTCTCCGTGGGCCCCGTGAGCCCGAGTCGCAGGTGGTGGTACAGGTGCTATGCTTATG 888
Query 602 ACTCGAACTCTCCCCATGTGTGGTCTCTACCCAGTGATCTCCTGGAGCTCCTGGTCCTAGGTGTTTCTAAGAAG 675
||||||||||||||.|||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 ACTCGAACTCTCCCTATGAGTGGTCTCTACCCAGTGATCTCCTGGAGCTCCTGGTCCTAGGTGTTTCTAAGAAG 962
Query 676 CCATCACTCTCAGTGCAGCCAGGTCCTATAGTGGCCCCTGGGGAGAGCCTGACCCTCCAGTGTGTTTCTGATGT 749
|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||.|||||.||||||.||.|||||||..|||||||.
Sbjct 963 CCATCACTCTCAGTGCAGCCAGGTCCTATCGTGGCCCCTGAGGAGACCCTGACTCTGCAGTGTGGCTCTGATGC 1036
Query 750 CAGCTACGACAGATTTGTTCTGTATAAGGAGGGAGAACGTGACTTCCTCCAGCTCCCTGGCCCACAGCCCCAGG 823
..|||||.||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.||||||.|||||.||||||||||||
Sbjct 1037 TGGCTACAACAGATTTGTTCTGTATAAGGACGGGGAACGTGACTTCCTTCAGCTCGCTGGCGCACAGCCCCAGG 1110
Query 824 CTGGGCTCTCCCAGGCCAACTTCACCCTGGGCCCTGTGAGCCGCTCCTACGGGGGCCAGTACAGATGCTCCGGT 897
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 1111 CTGGGCTCTCCCAGGCCAACTTCACCCTGGGCCCTGTGAGCCGCTCCTACGGGGGCCAGTACAGATGCTACGGT 1184
Query 898 GCATACAACCTCTCCTCCGAGTGGTCGGCCCCCAGCGACCCCCTGGACATCCTGATCGCAGGACAGTTCCGTGG 971
|||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 GCACACAACCTCTCCTCCGAGTGGTCGGCCCCCAGCGACCCCCTGGACATCCTGATCGCAG------------- 1245
Query 972 CAGACCCTTCATCTCGGTGCATCCGGGCCCCACGGTGGCCTCAGGAGAGAACGTGACCCTGCTGTGTCAGTCAT 1045
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 1246 ----------------------CCGGGCCCCACGGTGGCCTCAGGAGAGAACGTGACCCTGCTGTGTCAGTCAC 1297
Query 1046 GGGGGCCGTTCCACACTTTCCTTCTGACCAAGGCGGGAGCAGCTGATGCCCCCCTCCGTCTCAGATCAATACAC 1119
.|||...|.|.||.|||||||||||||||||||.|||.||||||||||.|||....|||||.|||||||...||
Sbjct 1298 AGGGATGGATGCAAACTTTCCTTCTGACCAAGGAGGGGGCAGCTGATGACCCATGGCGTCTAAGATCAACGTAC 1371
Query 1120 GAATATCCTAAGTACCAGGCTGAATTCCCTATGAGTCCTGTGACCTCAGCCCACTCGGGGACCTACAGGTGCTA 1193
.|||.||..||.|||||||||||||||||.|||.|||||||||||||||||||..|||||||||||||||||||
Sbjct 1372 CAATCTCAAAAATACCAGGCTGAATTCCCCATGGGTCCTGTGACCTCAGCCCATGCGGGGACCTACAGGTGCTA 1445
Query 1194 CGGCTCACTCAGCTCCAACCCCTACCTGCTGTCTCACCCCAGTGACTCCCTGGAGCTCATGGTCTCAGGAGCAG 1267
||||||||..||||||||.||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.|..
Sbjct 1446 CGGCTCACAGAGCTCCAAACCCTACCTGCTGACTCACCCCAGTGACCCCCTGGAGCTCGTGGTCTCAGGACCGT 1519
Query 1268 CTGAGACCCTCAGC-CCACCACAAAACAAGTCCGA-TTCCAAGGCTGGAGCAGCTAACACCCT------CAGCC 1333
|||.|..||.|||| ||.|.|| ||||.|.||.| .||||...|||| |||| |||||
Sbjct 1520 CTGGGGGCCCCAGCTCCCCGAC--AACAGGCCCCACCTCCACATCTGG-----------CCCTGAGGACCAGCC 1580
Query 1334 CATCACAAAACAAGACTGCCTCAC--------ACCCCCAGGATTACACAGTGGAGAATCTCATCCGCATGGGCA 1399
|.|||| ||.||| |.|||||| ||||
Sbjct 1581 CCTCAC------------CCCCACCGGGTCGGATCCCCAG--------AGTG---------------------- 1612
Query 1400 TAGCTGGCTTGGTCCTGGTGGTCCTCGGGATTCTGCTATTTGAGGCTCAGCACAGCCAGAGAAGCCTC 1467
Sbjct 1613 -------------------------------------------------------------------- 1612