Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_02669
• Subject: XM_024452791.1
• Aligned Length: 1710
• Identities: 1602
• Gaps: 108

Alignment

Query    1  ATGAACGTGGTTTTTGCTGTGAAGCAGTACATTTCCAAAATGATAGAGGACAGCGGGCCTGGTATGAAAGTACT  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  TCTCATGGATAAAGAGACGACTGGCATAGTGAGTATGGTATACACACAATCGGAGATTCTACAGAAGGAAGTGT  148
                                              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ----------------------------------ATGGTATACACACAATCGGAGATTCTACAGAAGGAAGTGT  40

Query  149  ACCTCTTTGAACGCATTGATTCTCAAAATCGAGAGATCATGAAACACCTGAAGGCAATTTGTTTTCTTCGACCT  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   41  ACCTCTTTGAACGCATTGATTCTCAAAATCGAGAGATCATGAAACACCTGAAGGCAATTTGTTTTCTTCGACCT  114

Query  223  ACAAAGGAGAATGTGGATTATATTATTCAGGAGCTCCGAAGACCCAAATACACTATATATTTCATTTATTTCAG  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  115  ACAAAGGAGAATGTGGATTATATTATTCAGGAGCTCCGAAGACCCAAATACACTATATATTTCATTTATTTCAG  188

Query  297  TAATGTGATCAGCAAGAGTGACGTGAAGTCATTGGCTGAAGCTGATGAACAGGAAGTTGTGGCTGAGGTTCAGG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  189  TAATGTGATCAGCAAGAGTGACGTGAAGTCATTGGCTGAAGCTGATGAACAGGAAGTTGTGGCTGAGGTTCAGG  262

Query  371  AATTTTATGGTGATTACATTGCTGTGAACCCACATTTGTTTTCCCTCAATATTTTGGGTTGCTGCCAGGGTCGA  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  263  AATTTTATGGTGATTACATTGCTGTGAACCCACATTTGTTTTCCCTCAATATTTTGGGTTGCTGCCAGGGTCGA  336

Query  445  AATTGGGATCCAGCCCAGCTATCTAGAACAACTCAAGGGCTTACAGCTCTCCTTTTATCTCTGAAGAAGTGTCC  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  337  AATTGGGATCCAGCCCAGCTATCTAGAACAACTCAAGGGCTTACAGCTCTCCTTTTATCTCTGAAGAAGTGTCC  410

Query  519  CATGATTCGTTATCAGCTCTCATCAGAGGCAGCAAAGAGACTTGCAGAGTGCGTTAAGCAAGTGATAACTAAAG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  411  CATGATTCGTTATCAGCTCTCATCAGAGGCAGCAAAGAGACTTGCAGAGTGCGTTAAGCAAGTGATAACTAAAG  484

Query  593  AATATGAACTGTTTGAATTCCGTCGGACAGAGGTTCCTCCATTGCTCCTTATTTTAGATCGCTGTGATGATGCC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  485  AATATGAACTGTTTGAATTCCGTCGGACAGAGGTTCCTCCATTGCTCCTTATTTTAGATCGCTGTGATGATGCC  558

Query  667  ATCACCCCATTGCTAAACCAGTGGACATATCAGGCCATGGTCCACGAACTACTAGGCATAAACAACAATCGGAT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  559  ATCACCCCATTGCTAAACCAGTGGACATATCAGGCCATGGTCCACGAACTACTAGGCATAAACAACAATCGGAT  632

Query  741  TGATCTTTCCAGAGTGCCGGGAATCAGTAAAGACTTAAGAGAAGTGGTCCTATCTGCTGAAAATGATGAATTCT  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  633  TGATCTTTCCAGAGTGCCGGGAATCAGTAAAGACTTAAGAGAAGTGGTCCTATCTGCTGAAAATGATGAATTCT  706

Query  815  ATGCTAATAATATGTACCTGAACTTTGCTGAGATTGGTAGCAATATAAAGAATCTCATGGAAGATTTTCAGAAG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  707  ATGCTAATAATATGTACCTGAACTTTGCTGAGATTGGTAGCAATATAAAGAATCTCATGGAAGATTTTCAGAAG  780

Query  889  AAGAAACCAAAAGAACAGCAAAAACTAGAATCAATAGCAGACATGAAGGCGTTTGTTGAGAATTATCCACAGTT  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  781  AAGAAACCAAAAGAACAGCAAAAACTAGAATCAATAGCAGACATGAAGGCGTTTGTTGAGAATTATCCACAGTT  854

Query  963  CAAGAAAATGTCTGGGACTGTTTCAAAGCATGTGACAGTGGTTGGAGAACTGTCTCGATTGGTCAGTGAACGGA  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  855  CAAGAAAATGTCTGGGACTGTTTCAAAGCATGTGACAGTGGTTGGAGAACTGTCTCGATTGGTCAGTGAACGGA  928

Query 1037  ATCTGCTGGAGGTTTCAGAGGTTGAGCAAGAACTGGCCTGTCAAAATGACCATTCTAGTGCTCTCCAGAATATA  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  929  ATCTGCTGGAGGTTTCAGAGGTTGAGCAAGAACTGGCCTGTCAAAATGACCATTCTAGTGCTCTCCAGAATATA  1002

Query 1111  AAAAGGCTTCTGCAGAACCCCAAAGTGACAGAGTTTGATGCTGCCCGCCTGGTGATGCTTTATGCTTTACATTA  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1003  AAAAGGCTTCTGCAGAACCCCAAAGTGACAGAGTTTGATGCTGCCCGCCTGGTGATGCTTTATGCTTTACATTA  1076

Query 1185  TGAGCGACACAGCAGCAATAGCCTGCCAGGACTAATGATGGACCTCAGGAATAAAGGTGTTTCTGAGAAGTATC  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1077  TGAGCGACACAGCAGCAATAGCCTGCCAGGACTAATGATGGACCTCAGGAATAAAGGTGTTTCTGAGAAGTATC  1150

Query 1259  GAAAGCTCGTGTCTGCAGTTGTTGAATATGGTGGTAAACGAGTCAGAGGAAGTGACCTCTTCAGCCCCAAAGAT  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1151  GAAAGCTCGTGTCTGCAGTTGTTGAATATGGTGGTAAACGAGTCAGAGGAAGTGACCTCTTCAGCCCCAAAGAT  1224

Query 1333  GCTGTGGCTATCACCAAACAATTCCTCAAAGGACTGAAGGGAGTAGAAAATGTATATACACAGCATCAACCTTT  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1225  GCTGTGGCTATCACCAAACAATTCCTCAAAGGACTGAAGGGAGTAGAAAATGTATATACACAGCATCAACCTTT  1298

Query 1407  CCTACATGAAACCCTGGATCATCTCATCAAAGGAAGGCTTAAGGAAAACCTATATCCTTATTTAGGCCCCAGCA  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1299  CCTACATGAAACCCTGGATCATCTCATCAAAGGAAGGCTTAAGGAAAACCTATATCCTTATTTAGGCCCCAGCA  1372

Query 1481  CACTCAGAGACAGACCTCAGGATATCATTGTGTTTGTAATTGGAGGAGCCACCTATGAAGAGGCTCTAACAGTT  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1373  CACTCAGAGACAGACCTCAGGATATCATTGTGTTTGTAATTGGAGGAGCCACCTATGAAGAGGCTCTAACAGTT  1446

Query 1555  TATAACCTGAACCGCACCACTCCTGGAGTGAGGATTGTCCTGGGAGGCACCACAGTGCACAACACGAAAAGTTT  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1447  TATAACCTGAACCGCACCACTCCTGGAGTGAGGATTGTCCTGGGAGGCACCACAGTGCACAACACGAAAAGTTT  1520

Query 1629  CCTAGAGGAAGTTCTGGCTTCTGGACTGCACAGCCGAAGCAAGGAGAGCTCTCAAGTCACATCAAGGTCAGCGA  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1521  CCTAGAGGAAGTTCTGGCTTCTGGACTGCACAGCCGAAGCAAGGAGAGCTCTCAAGTCACATCAAGGTCAGCGA  1594

Query 1703  GCAGAAGA  1710
            ||||||||
Sbjct 1595  GCAGAAGA  1602